El programa de posgrado está basado en un sistema de cursos teóricos y teórico-prácticos que capacitan al estudiante para la investigación científica que desarrollará con el apoyo de uno o más de los centros o grupos de investigación del Departamento. La duración esperada del programa es de dos años. Para obtener el título, se requieren por lo menos 36 créditos aprobados. El candidato tiene la oportunidad y la obligación de enfocar sus estudios en una de las áreas de investigación que se ofrecen en los centros, laboratorios y grupos de investigación del Departamento de Ciencias Biológicas. Por otra parte, el estudiante deberá realizar un proyecto de investigación en el cual, de común acuerdo con su director, escoge un tema para la realización práctica de su proyecto de grado, que debe constituir un aporte original sobre el tema. Culminados los cursos, el estudiante debe presentar un examen preparatorio (oral), que permite evaluar la capacidad de asociación e integración de sus conocimientos, éste se realiza en forma de discusión basada en su proyecto de investigación. La investigación se lleva a cabo dentro del desarrollo de las siguientes asignaturas: Proyecto de grado, Tesis I y Tesis II. El candidato culmina su maestría con la sustentación pública de su Tesis.