.(2024). A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny.
A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny
Tesis
Adriana Jimena Bernal Giraldo
Adriana Jimena Bernal Giraldo
Doctor Of Philosophy In Plant Pathology
abernal @uniandes.edu.co
Profesor Asociado
- : A5041473679
- Research Gate
- Orcid
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Departamento de Ciencias Biológicas
Perfil
Cursos Recientes
- 2024
INGENIERIA GENETICA PLANTAS
Segundo Periodo
Licenciatura
PRACTICAS LABOR. AVANZADAS
Segundo Periodo
Licenciatura
Productos Recientes
.(2024). Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta).
Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta)
Tesis
Títulos Académicos Recientes
Doctor Of Philosophy In Plant Pathology
Doctorado
University Of California
2003
Estados Unidos
Microbióloga
Título de grado
Universidad De Los Andes, Colombia
1994
Colombia
Proyectos Recientes
- 2021
- Explorando los microbiomas de suelos asociados con sistemas agrícolas contrastantes y la diversidad de aislamientos de la roya del café en Colombia
Duración: 45 meses
PR.6.2021.8007
En este proyecto se pretende evaluar el impacto de la agricultura en la diversidad bacteriana del suelo yla influencia de diferentes prácticas agronómicas en él, utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento en sistemas de cultivos de café, yuca, Sacha-Inchi y tomate de árbol en Colombia. De igual forma se pretende estudiar la diversidad molecular de la roya del café causada por el hongo Hemileia vastatrix, utilizando también secuenciación de tercera generación.
- 2020
- Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en Colombia
Duración: 18 meses
PR.6.2020.7087
La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.
Cursos
- 2024
INGENIERIA GENETICA PLANTAS
Segundo Periodo
Licenciatura
PRACTICAS LABOR. AVANZADAS
Segundo Periodo
Licenciatura
BIOLOGÍA MOLECULAR AVANZADA
Primer Periodo
Maestría
SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.
Primer Periodo
Maestría
PRACTICAS LABOR. AVANZADAS
Primer Periodo
Licenciatura
TG,MONOGR,PASANTIA,EMPRENDIM
Segundo Periodo
Licenciatura
BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO
Primer Periodo
Licenciatura
SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1
Primer Periodo
Doctorado
SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.
Segundo Periodo
Maestría
SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1
Segundo Periodo
Doctorado
SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.2
Segundo Periodo
Doctorado
TG,MONOGR,PASANTIA,EMPRENDIM
Primer Periodo
Licenciatura
- 2023
- 2022
- 2021
- 2020
- 2019
- 2018
- 2017
- 2014
Productos
.(2024). A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny.
A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny
Tesis
.(2024). Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta).
Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta)
Tesis
Villegas-Torres MF, Bernal A, Gonzalez A.
CocAI: Transformación del uso de la planta de coca a alternativas productivas a partir de la modulación del metabolismo secundario para fomentar la síntesis de metabolitos de tipo no alcaloide combinando cultivo in vitro, metabolómica e inteligencia artificial
Minciencias.
Propuesta
.(2024). Evaluación de expresión génica de biopelículas en comunidades de E. Coli por estrés, a partir de microscopía de hoja de luz.
Evaluación de expresión génica de biopelículas en comunidades de E. Coli por estrés, a partir de microscopía de hoja de luz
Tesis
.(2024). Microbioma bacteriano de Manihot esculenta en diferentes condiciones de cultivo en la costa atlántica colombiana.
Microbioma bacteriano de Manihot esculenta en diferentes condiciones de cultivo en la costa atlántica colombiana
Tesis
Villegas-Torres MF, Gonzalez A, Duitama J, Velasco J, Bernal A.(2024).
Ruta de la innovación 2.0: Visita de Incauca
Evento
.(2024). Sowing deep roots: exploring the plant growth promoting role of rhizobacteria in solanum lycopersicum.
Sowing deep roots: exploring the plant growth promoting role of rhizobacteria in solanum lycopersicum
Tesis
.(2024). XopAE: A través del patelina verso. Explorando interacciones proteína-proteína que toman parte durante los estadíos de infección de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm).
XopAE: A través del patelina verso. Explorando interacciones proteína-proteína que toman parte durante los estadíos de infección de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm)
Tesis
Bernal A. (2023)
A minisatellite-based MLVA for deciphering the global epidemiology of the bacterial cassava pathogen Xanthomonas phaseoli pv. manihotis
Artículo
.(2023). Análisis de patrones de expresión espaciotemporal del gen nlgn3 en el cerebro de peces hembra de la especie Poecilia reticulata tras la exposición a diversos contextos sociales.
Análisis de patrones de expresión espaciotemporal del gen nlgn3 en el cerebro de peces hembra de la especie Poecilia reticulata tras la exposición a diversos contextos sociales
Tesis
Bernal A. (2023)
CRISPRi in Xanthomonas demonstrates functional convergence of transcription activator-like effectors in two divergent pathogens
New Phytologist (ISSN 0028-646X)
Artículo
Bernal A, Zarate C, Audran C, Medina C, Escalon A, Javegny S, Gagnevin L, Thomas E, Pimparé L, López C, Jacobs J, Noël L. D., Koebnik R, Szurek B. (2023)
CRISPRi inXanthomonasdemonstrates functional convergenceof transcription activator-like effectors in twodivergent pathogens
New Phytologist (ISSN 0028-646X)
Artículo
.(2023). Caracterización de bacterias aisladas de la rizosfera de sacha inchi (Plukenetia volubilis) asociadas a la promoción de crecimiento vegetal y protección contra estrés hídrico.
Caracterización de bacterias aisladas de la rizosfera de sacha inchi (Plukenetia volubilis) asociadas a la promoción de crecimiento vegetal y protección contra estrés hídrico
Tesis
.(2023). Dominios de interacción entre la proteína efectora XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y la patelina 3 en Arabidopsis thaliana.
Dominios de interacción entre la proteína efectora XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y la patelina 3 en Arabidopsis thaliana
Tesis
.(2023). Gene expression dynamics in the guppy brain: unraveling the neural mechanisms underlying social decision making and mate choice.
Gene expression dynamics in the guppy brain: unraveling the neural mechanisms underlying social decision making and mate choice
Tesis
.(2023). Guide selection using a CRISPRa system to activate parkin gene related to parkinson's disease.
Guide selection using a CRISPRa system to activate parkin gene related to parkinson's disease
Tesis
.(2023). Rol del T6SS en Competencia Bacteriana de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis Ante Bacterias Epífitas de Yuca (Manihot esculenta).
Rol del T6SS en Competencia Bacteriana de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis Ante Bacterias Epífitas de Yuca (Manihot esculenta)
Tesis
.(2023). Validación de la interacción entre el efector XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y una patelina de plantas involucrada en inmunidad vegetal.
Validación de la interacción entre el efector XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y una patelina de plantas involucrada en inmunidad vegetal
Tesis
.(2023). Xanthomonas phaseoli pv. manihotis effector XopAO1 targets two key proteins to suppress defense in Cassava.
Xanthomonas phaseoli pv. manihotis effector XopAO1 targets two key proteins to suppress defense in Cassava
Tesis
Bernal A, Barrera C, Clavijo F, Benčič A., Croce V, Jacobs J, Koebnik R, Roman-Reyna V. (2022)
Complete Genome Sequence Resource for Xanthomonas translucens pv. undulosa MAI5034, a Wheat Pathogen from Uruguay
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Meral S, Bibi S, Diaz C, Menkovic J, Bernal A, Koebnik R. (2022)
Complete Genome Sequence of Xanthomonas campestris pv. campestris SB80, a Race 4 Strain Isolated from White Head Cabbage in Turkey
Microbiology Resource Announcements (ISSN 2576-098X)
Artículo
.(2022). Diseño de un protocolo de desecación para Pseudomonas benéficas en plantas incorporando carotenoides y disacáridos.
Diseño de un protocolo de desecación para Pseudomonas benéficas en plantas incorporando carotenoides y disacáridos
Tesis
Luuu S, Duplat D, Benitez P, Leon C, Villota S, Veloz-Villavicencio E, Arevalo V, Jaenes K, Guoo Y, Cicek S, Robinson L, Peidis P, Pearson J, Woodgett J, Mazzulli T, Ponce P, Restrepo S, Gonzalez J, Bernal A, Guevara-Suarez M, Pardee K, Cevallos V, González C, Bremner R. (2022)
Multicenter international assessment of a SARS-CoV-2 RT-LAMP test for point of care clinical application
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Artículo
Ayala D, Cardenas M, Guyot R, Chaib M, Bernal A, Reyes A, Restrepo S. (2021)
A whole genome duplication drives the genome evolution of Phytophthora betacei, a closely related species to Phytophthora infestans
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Artículo
.(2021). Aislamiento y caracterización de Pseudomonas benéficas de la microbiota asociada a la raíz de Plukenetia volubilis.
Aislamiento y caracterización de Pseudomonas benéficas de la microbiota asociada a la raíz de Plukenetia volubilis
Tesis
.(2021). Análisis computacional de redes metabólicas e interacción proteína-proteína en relaciones planta patógeno: dilucidando su complejidad mediante métodos computacionales.
Análisis computacional de redes metabólicas e interacción proteína-proteína en relaciones planta patógeno: dilucidando su complejidad mediante métodos computacionales
Tesis
Zarate C, Gomez D, Verdier V, Lopez C, Bernal A, Szurek B. (2021)
Cassava diseases caused by Xanthomonas phaseoli pv. manihotis and Xanthomonas cassavae
Molecular Plant Pathology (ISSN 1464-6722)
Artículo
.(2021). Comparación de técnicas moleculares para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 o COVID 19.
Comparación de técnicas moleculares para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 o COVID 19
Tesis
Bautista D, Guayazan N, Buitrago M, Cardenas M, Botero D, Duitama J, Bernal A, Restrepo S. (2021)
Comprehensive Time-Series Analysis of the Gene Expression Profile in a Susceptible Cultivar of Tree Tomato (Solanum betaceum) During the Infection of Phytophthora betacei
Frontiers in Plant Science (ISSN 1664-462X)
Artículo
.(2021). Comunidades sintéticas microbianas, una alternativa prometedora para la agricultura.
Comunidades sintéticas microbianas, una alternativa prometedora para la agricultura
Tesis
.(2021). Efecto de la exposición a estrés crónico en la expresión de genes asociados al comportamiento ansiogénico sam2 y nlgn1 en pez cebra (Danio rerio).
Efecto de la exposición a estrés crónico en la expresión de genes asociados al comportamiento ansiogénico sam2 y nlgn1 en pez cebra (Danio rerio)
Tesis
.(2021). Evaluación de efectividad de bacterias promotoras de crecimiento vegetal en la variedad de arroz F67 (Oryza sativa).
Evaluación de efectividad de bacterias promotoras de crecimiento vegetal en la variedad de arroz F67 (Oryza sativa)
Tesis
.(2021). How to transport lipids: a brief history of patellins.
How to transport lipids: a brief history of patellins
Tesis
.(2021). Phenotypic and metabolomic changes triggered by beneficial bacteria on cape gooseberry against Fusarium wilt.
Phenotypic and metabolomic changes triggered by beneficial bacteria on cape gooseberry against Fusarium wilt
Tesis
Zarate C, Osorio D, Mora R, Perez A. L., Dereeper A, Restrepo S, Lopez C, Szurek B, Bernal A. (2021)
TAL effector repertoires of strains of Xanthomonas phaseoli Pv. Manihotis in commercial cassava crops reveal high diversity at the country scale
Microorganisms (ISSN 2076-2607)
Artículo
Montenegro N, Alvarez A, Arrieta M, Rodriguez L. M., Botero D, Tabima J, Castiblanco L, Trujillo C, Restrepo S, Bernal A. (2021)
The type VI secretion system of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis is involved in virulence and in vitro motility
BMC Microbiology (ISSN 1471-2180)
Artículo
Diaz L, Chaparro Dayanne, Jimenez H, Gomez-Ramirez L, Bernal A, Burbano-Erazo E, Jimenez DJ. (2021)
Top-Down Enrichment Strategy to Co-cultivate Lactic Acid and Lignocellulolytic Bacteria From the Megathyrsus maximus Phyllosphere
Frontiers in Microbiology (ISSN 1664-302X)
Artículo
Leidy C, Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Gerson-Dirceu López, Carazzone C, Feussner I, Bernal A, Forero-Shelton Manu, Suesca E. (2020)
Carotenoid Content and Composition in Exponential, Stationary and Biofilm States of Staphylococcus aureus and their Influence on Membrane Biophysical Properties
Biophysical Journal (ISSN 0006-3495)
Artículo
Melendez J .(2020). Carotenoids in Bacteria: General Scheme on The Diversity of The Biosynthetic Pathways.
Carotenoids in Bacteria: General Scheme on The Diversity of The Biosynthetic Pathways
Tesis
Cabrera L .(2020). Control of Botrytis cinerea in roses using biopolymer-based films with essential oils incorporated.
Control of Botrytis cinerea in roses using biopolymer-based films with essential oils incorporated
Tesis
Cruz L .(2020). De la raíz a la hoja: Capacidad de Bacilos rizosféricos como potenciales inductores de resistencia sistémica (ISR) en plantas de Arabidopsis thaliana.
De la raíz a la hoja: Capacidad de Bacilos rizosféricos como potenciales inductores de resistencia sistémica (ISR) en plantas de Arabidopsis thaliana
Tesis
Bernal A. (2020)
Effector Repertoire of Phytophthora betacei: In Search of Possible Virulence Factors Responsible for Its Host Specificity
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Artículo
Rojas-Estevez P, Urbina D, Ayala D, Guayazan N, Mideros M, Bernal A, Cardenas M, Restrepo S. (2020)
Effector Repertoire of Phytophthora betacei: In Search of Possible Virulence Factors Responsible for Its Host Specificity
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Artículo
Scortichini M, Arnold D, Pruvost O, Jacques MA, Bernal A. (2020)
Evolutionary trajectories in plant-associated Pseudomonas and Xanthomonas strains
Evolutionary trajectories in plant-associated Pseudomonas and Xanthomonas strains (ISBN 978-2-88963-700-3)
Otro
Botero D, Monk J, Rodriguez M, Rodriguez A, Restrepo M, Bernal V, Reyes A, Gonzalez A, Palsson B, Restrepo S, Bernal A. (2020)
Genome-Scale Metabolic Model of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis: An Approach to Elucidate Pathogenicity at the Metabolic Level
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Artículo
Ramirez E, Dereeper A, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2020)
Resistance and susceptibility to Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in cassava: A transcriptomic comparison (or two sides of the same coin)
Physiological and Molecular Plant Pathology (ISSN 0885-5765)
Artículo
Bautista D, Guayazan N, Botero D, Duitama J, Bernal A, Restrepo S.(2020).
Time series transcriptome analysis reveals adaptable activation of defense related genes in tree tomato infected with late blight
Evento
Buitrago M, Restrepo S, Bernal A.
Transcriptional Expression Pattern in Effector Genes of Phytophthora betacei
Evento
Rache L, Blondin L, Flores C, Trujillo C, Szurek B, Restrepo S, Koebnik R, Bernal A, Verniere C. (2019)
An Optimized Microsatellite Scheme for Assessing Populations of Xanthomonas phaseoli pv. Manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Gomez F, Soto J, Restrepo S, Bernal A, Lopez L, Lopez C. (2019)
Gene co-expression network for Xanthomonas-challenged cassava reveals key regulatory elements of immunity processes
European Journal of Plant Pathology (ISSN 0929-1873)
Artículo
Diaz-Tatis P, Ochoa J. C., Garcia L. M., Chavarriaga P, Bernal A, Lopez C. (2019)
Interfamily transfer of Bs2 from pepper to cassava (Manihot esculenta Crantz)
Tropical Plant Pathology (ISSN 1983-2052)
Artículo
Cruz L .(2019). Microscopía confocal para visualización de localización subcelular e interacción molecular de efectores del patosistema Xam (Xanthomonas axonopodis pv manihotis).
Microscopía confocal para visualización de localización subcelular e interacción molecular de efectores del patosistema Xam (Xanthomonas axonopodis pv manihotis)
Tesis
Bernal A, Cardenas M, Snoeijenbos M, Guevara-Suarez M, Gutierrez C .(2019). Phytobiomes, The Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together.
Phytobiomes, The Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together
Tesis
Snoeijenbos M, Cardenas M, Guevara-Suarez M, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2019)
Phytobiomes, the Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together
Annual Plant Reviews online (ISSN 2639-3832)
Artículo
Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Feussner I, Bernal A, Forero-Shelton Manu, Leidy C. (2019)
Variations in carotenoid content and acyl chain composition in exponential, stationary and biofilm states of Staphylococcus aureus, and their influence on membrane biophysical properties
Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes (ISSN 0005-2736)
Artículo
Villarreal S .(2018). Análisis de la distribución, contexto genómico y evolución del efector XopE4 en diferentes cepas de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Análisis de la distribución, contexto genómico y evolución del efector XopE4 en diferentes cepas de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Tesis
Bernal V, Ochoa J. C., Trujillo C, Rache L, Bernal A, Lopez C. (2018)
Development of a multiplex nested PCR method for detection of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Cassava
Tropical Plant Pathology (ISSN 1983-2052)
Artículo
Villarreal S .(2018). Evaluación del efector XopE4 de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis como supresor de la respuesta hipersensible mediada por distintos elicitores.
Evaluación del efector XopE4 de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis como supresor de la respuesta hipersensible mediada por distintos elicitores
Tesis
Kante M, Blondin L, Flores C, Rache L, Wonni I, Dagno K, Restrepo S, Bernal A, Koebnik R, Verdier V, Koita O, Verniere C, Szurek B. (2018)
MLVA-based diversity analysis of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) populations in Mali
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Leidy C, Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Feussner I, Bernal A, Forero-Shelton Manu.(2018).
Modulation of lipid composition during biofilm formation, and its influence on the membrane biophysical properties of Staphylococcus aureus
Evento
Botero D, Alvarado C, Bernal A, Danies G, Restrepo S. (2018)
Network Analyses in Plant Pathogens
Frontiers in Microbiology (ISSN 1664-302X)
Artículo
Mideros M, Turissini D, Guayazan N, Ibarra H, Danies G, Cardenas M, Myers K, Tabima J, Goss E, Bernal A, Lagos L, Grajales A, Gonzalez-Garcia L, Cooke D. E. L., Fry W. E., Grunwald N. J., Matute D, Restrepo S. (2018)
Phytophthora betacei, a new species within Phytophthora clade 1c causing late blight on Solanum betaceum in Colombia.
Persoonia (ISSN 0031-5850)
Artículo
Zarate C, Rache L, Verniere C, Gagnevin L, Bernal A, Szurek B. (2018)
TALE neighborhood: A genomic approach to picture worldwide TALome diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis
Otro
Medina C, Reyes P, Trujillo C, Gonzalez J, Bejarano D, Montenegro N, Jacobs J, Joe A, Restrepo S, Alfano J, Bernal A. (2018)
The role of type III effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in virulence and suppression of plant immunity
Molecular Plant Pathology (ISSN 1464-6722)
Artículo
Rache L, Bernal A, Restrepo S. (2017)
Cellulase and xylanase activities of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) strains collected from different regions of Colombia
J Biotechnol Biomater (ISSN 2155-952X)
Artículo
Rache L, Bernal A, Restrepo S.
Cellulase and xylanase activities of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) strains collected from different regions of Colombia
Evento
Gonzalez J .(2017). Functional characterization of the suppression of plant immunity mediated by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis type III effector XopAO1.
Functional characterization of the suppression of plant immunity mediated by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis type III effector XopAO1
Tesis
Gomez D .(2016). A Small Heat Shock Protein Important in Plant Defense is Targeted by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis HpaF Effector.
A Small Heat Shock Protein Important in Plant Defense is Targeted by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis HpaF Effector
Tesis
Rache L, Flores C, Lopez C, Szurek B, Verniere C, Koebnik R, Restrepo S, Bernal A. (2016)
A strategy to study population variation of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using a new set of multiple-locus variable number tandem repeats
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Medina C .(2016). Elucidation of role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Elucidation of role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Tesis
Berdugo J .(2016). Genetic Diversity and Association Mapping in Colombian Central Collection of potato (Solanum tuberosum L.) Group Andigenum using SNPs markers.
Genetic Diversity and Association Mapping in Colombian Central Collection of potato (Solanum tuberosum L.) Group Andigenum using SNPs markers
Tesis
Diaz-Tatis P, Zarate C, Bernal A, Lopez C. (2016)
Infección de callo embriogénico friable de yuca con Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam)
Revista Colombiana de Biotecnología (ISSN 0123-3475)
Artículo
Soto J, Ortiz J. F., Perlaza L, Vasquez A, Becerra L, Mathew B, Leon J, Bernal A, Ballvora A, Lopez C. (2015)
A genetic map of cassava (Manihot esculenta Crantz) with integrated physical mapping of immunity-related genes
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Artículo
Santiago M, Susana C, Mariana R, Alejandro A, Bernal A, Gonzalez A. (2015)
APPLICATIONS OF MOLECULAR DOCKING AND MOLECULAR DYNAMICS ON THE INHIBITION OF QUORUM SENSING SYSTEMS
ADVANCES IN MATHEMATICAL CHEMISTRY AND APPLICATIONS (ISBN 978-1-68108-052-9)
Capítulo de Libro
Rache L, Koebnik R, Bernal A.
Analysis of the Population Diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) in Different Regions of Colombia Using VNTRS
Evento
Muñoz A, Cruz L, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2015)
COMPARING INOCULATION METHODS TO EVALUATE THE GROWTH OF Xanthomonas axonopodis pv. manihotis ON CASSAVA PLANTS
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Artículo
Florez C, Rache L, Lopez C, Koebnik R, Verdier V, Bernal A, Szurek B.
Characterization of Cassava Bacterial Blight in Venezuela: Diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis ( Xam ) and its Talome
Evento
Zarate C .(2015). Diversity of TALE content in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strains is a valuable tool to improve target gene searching methodologies.
Diversity of TALE content in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strains is a valuable tool to improve target gene searching methodologies
Tesis
Gonzalez J .(2015). Importancia de la triada catalítica del efector XopAO1 en la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Importancia de la triada catalítica del efector XopAO1 en la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Tesis
Gomez F .(2015). Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz.
Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz
Tesis
Botero D, Gomez F, Alvarez M, Alvarez A, Alvarado C, Zarate C, Gonzalez A, Restrepo S, Bernal A.
Molecular Pathogenicity Networks in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Evento
Botero D, Gomez F, Alvarez M, Alvarez A, Gonzalez A, Restrepo S, Bernal A.
Molecular Pathogenicity Networks in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (5th Xanthomonas Genomics Conference)
Evento
Danies G, Antolinez A, Cantillo J, Peña G, Vargas A, Cardenas M, Bernal A, Fry W. E., Restrepo S. (2015)
Physalis peruviana responses to Phytophthora infestans are typical of an incompatible interaction
CANADIAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY (ISSN 0706-0661)
Artículo
Gomez F, Alvarez M, Alvarado C, Zarate C, Jimenez E, Pardo C, Botero D, Gonzalez A, Bernal A.
Reconstruction of Genome-Scale Metabolic Networks of Species of the Genus Xanthomonas with Different Pathogenic Behavior
Evento
Karr J, Williams A, Zucker J, Raue A, Steiert B, Timmer J, Kreutz C, Wilkinson S, Allgood B, Bot B, Hoff B, Kellen M, Covert M, Stolovitzky G, Meyer P, Hu Y, Baron M, Bryson K, Barker B, Bogart E, Wang Y, Chandramohan D, Huang L, Zawack K, Shestov A, Makadia H, Decicco D, Yin A, Wang M, Li S, Swistak M, Cygan M, Kazakiewicz D, Kursa M, Korytkowski P, Plewczynski D, Yang J, Li Y, Tang H, Wang T, Liu Y, Xie Y, Xiao G, Bello J, Botero D, Cañas S, Castro J, Gomez F, Valdes I, Gonzalez L, Bernal A, Pedraza J, Restrepo S, Reyes A. (2015)
Summary of the DREAM8 Parameter Estimation Challenge: Toward Parameter Identification for Whole-Cell Models
PLoS Computational Biology (ISSN 1553-734X)
Artículo
Trujillo C, Ochoa J. C., Mideros M, Restrepo S, López C. E., Bernal A. (2014)
A Complex Population Structure of the Cassava Pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Recent Years in the Caribbean Region of Colombia
MICROBIAL ECOLOGY (ISSN 0095-3628)
Artículo
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2014).
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Evento
Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Lozano G, Vasquez J. J., Myers K, Fry W. E., Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2014)
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Gene (ISSN 0378-1119)
Artículo
Tenjo F. J., Bello J, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Garavito M.F, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2014).
Evaluation of a Possible Metabolic Regulation in Pyrimidine Biosynthesis in Phytophthora infestans and Solanum tuberosum: the case of Aspartate Transcarbamoylase and Uridine Monophosphate Synthase
Evento
Bernal V .(2014). Genome-wide identification of small non-coding RNAs related with quorum sensing and virulence in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Genome-wide identification of small non-coding RNAs related with quorum sensing and virulence in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Tesis
Rodriguez A .(2014). Identification of HrpG and RpfCGH-regulated genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Identification of HrpG and RpfCGH-regulated genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Tesis
Bernal A. (2014)
Maestría en Biología Computacional: una apuesta de Uniandes al futuro de la ciencia en el país
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Artículo
Trujillo C, Arias N, Poulin L, Medina C, Tapiero A, Restrepo S, Koebnik R, Bernal A. (2014)
Population typing of the causal agent of cassava bacterial blight in the Eastern Plains of Colombia using two types of molecular markers
BMC Microbiology (ISSN 1471-2180)
Artículo
Garavito M.F, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2014).
Pyrimidine salvage pathways: Uracil Phosphoribosyltransferases of Phytophthora infestans and Solanum tuberosum
Evento
Bernal A. (2014)
RNA-seq data analysis in prokaryotes: A review for non-experts
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Artículo
Muñoz A, Perez A. L., Gomez F, Gil J, Michelmore R, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2014)
RNAseq analysis of cassava reveals similar plant responses upon infection with pathogenic and non-pathogenic strains of Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis
PLANT CELL REPORTS (ISSN 0721-7714)
Artículo
Perez M, Trier S, Bernal A, Vargas-zambrano J, Herrfurth C, Feussner I, Gonzalez J, Leidy C. (2014)
S. Aureus Adapt to Growth Conditions by Changing Membrane Order
Biophysical Journal (ISSN 0006-3495)
Artículo
Botero D, Restrepo S, Bernal A, Gonzalez A.
THE Xanthomonas axonopodis pv. manihotis PATHOGENESIS UNCOVER BY METABOLIC NETWORKS
Evento
Diaz P, Bernal A, Lopez C. (2014)
Transient GUS gene expression in cassava (Manihot esculenta Crantz) using Agrobacterium tumefaciens leaf infiltration
Revista MVZ Cordoba (ISSN 0122-0268)
Artículo
Bello J, Tenjo F. J., Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S, Garavito M.F.(2013).
Cloning and expression of the pyrimidine enzymes aspartate transcarbamoylase and uridine synthase of an oomycete plant pathogen
Evento
Perlaza L .(2013). Deconstructive Evolutionary Pipeline (DeEP) Implemented to Find Genes Responsible for Pathogenic Behavior in Xanthomonas Genus.
Deconstructive Evolutionary Pipeline (DeEP) Implemented to Find Genes Responsible for Pathogenic Behavior in Xanthomonas Genus
Tesis
del Castillo Munera J., Cardenas M, Pinzon A, Castañeda A, Bernal A, Restrepo S. (2013)
Developing a taxonomic identification system of Phytophthora species based on microsatellites Artículo completo 2013
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Artículo
Medina C, Bernal A. (2013)
El uso de nuevas tecnologías de la genómica para defender nuestros cultivos
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Artículo
Ramirez J .(2013). Evaluación de la redundancia en el papel de algunos efectores de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en la virulencia frente a yuca y en respuesta no hospedero.
Evaluación de la redundancia en el papel de algunos efectores de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en la virulencia frente a yuca y en respuesta no hospedero
Tesis
Trujillo C .(2013). Genetic structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis populations in two cassava producer regions in Colombia and characterization of an effector protein.
Genetic structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis populations in two cassava producer regions in Colombia and characterization of an effector protein
Tesis
Arrieta M, Rodriguez L. M., Perez A. L., Poulin L, Diaz A, Arias N, Trujillo C, Restrepo M, Bart R, Boch J, Boureau T, Darrasse A, Perrine D, Dugé de Bernonville T, Fontanilla P, Gagnevin L, Guérin F, Jacques M, Lauber E, Lefeuvre P, Medina C, Edgar M. Medina, Montenegro N, Muñoz A, Noël L. D., Ortiz J. F., Osorio D, Pardo C, Patil P. B., Poussier S, Pruvost O, Robène Soustrade I, Ryan R, Tabima J, Urrego O, Vernière C, Carrere S, Verdier V, Szurek B, Restrepo S, López C. E., Koebnik R, Bernal A. (2013)
Genomic Survey of Pathogenicity Determinants and VNTR Markers in the Cassava Bacterial Pathogen Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis Strain CIO151
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Artículo
Romero J .(2013). Las propiedades térmicas y mecánicas de las membranas bacterianas influencian la actividad de los agentes antimicrobiales que atacan la membrana.
Las propiedades térmicas y mecánicas de las membranas bacterianas influencian la actividad de los agentes antimicrobiales que atacan la membrana
Tesis
Ospina M .(2013). Microorganismos endófitos causantes del deterioro post cosecha primario en yuca (Manihot esculenta Crantz), una teoría olvidada..
Microorganismos endófitos causantes del deterioro post cosecha primario en yuca (Manihot esculenta Crantz), una teoría olvidada.
Tesis
Cespedes M, Cardenas M, Vargas A, Rojas A, Morales J. B. , Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2013)
Physiological and molecular characterization of Phytophthora infestans isolates from the Central Colombian Andean Region
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Artículo
Botero D, Restrepo S, Bernal A.
Reconstrucción Metabólica de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Evento
Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis Ramírez AM. (2013)
Seborrheic dermatitis: predisposing factors and ITS2 secondary structure for Malassezia phylogenic analysis
Medical Mycology (ISSN 1369-3786)
Artículo
Castiblanco L, Gil J, Rojas A, Osorio D, Gutiérrez S, Muñoz A, Perez A. L., Koebnik R, Szurek B, López C, Restrepo S, Verdier V, Bernal A. (2013)
TALE1 from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis acts as a transcriptional activator in plant cells and is important for pathogenicity in cassava plants
Molecular Plant Pathology (ISSN 1464-6722)
Artículo
Muñoz A, Bernal A, Szurek B, López C. E.. (2013)
Tell Me a Tale of TALEs
Applied Biochemistry and Biotechnology - Part B Molecular Biotechnology (ISSN 1073-6085)
Artículo
Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Caracterización de aislamientos de Malassezia spp. a partir de individuos con dermatitis seborreica
VIII Encuentro Nacional de Investigación en Enfermedades Infecciosas
Capítulo en Memoria
Verdier V, Lopez C, Bernal A. (2012)
Cassava Bacterial Blight, Caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Cassava In The Third Millennium. Modern Production, Processing, Use And Marketing Systems (ISBN 978-958-694-112-9)
Capítulo de Libro
López C. E., Bernal A. (2012)
Cassava Bacterial Blight: Using Genomics for the Elucidation and Management of an Old Problem
Tropical Plant Biology (ISSN 1935-9756)
Artículo
Cabezas L, Calderon L, Medina L. M., Bahamon I, Cardenas M, Bernal A, Gonzalez A, Restrepo S. (2012)
Characterization of cellulases of fungal endophytes isolated from Espeletia spp.
Journal of Microbiology (ISSN 1225-8873)
Artículo
Bello J, Tenjo F. J., Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2012).
Cloning and Expression of the pyrimidine enzymes uridine monophosphate synthetase (UMP) and aspartate carbamoyltransferase (ATC) of an Oomycete
Evento
Trujillo C, Medina C, Restrepo S, López C. E., Bernal A.
Comparison of diversity and population structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis between two cassava growing regions in Colombia
Evento
Cardenas M, Tabima J, Fry W. E., Grunwald N. J., Bernal A, Restrepo S. (2012)
Defining species boundaries in the genus Phytophthora: the case of Phytophthora andina A response to Phytophthora andina sp nov., a newly identified heterothallic pathogen of solanaceous hosts in the Andean highlands' (Oliva et al., 2010)
Plant Pathology (ISSN 0032-0862)
Artículo
Osorio D, Rodriguez L. M., Perez A. L., Trujillo C, Lopez C, Koebnik R, Szurek B, Restrepo S, Bernal A.
Determination of the genetic and functional diversity of TAL effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Evento
Bernal A. (2012)
Determination of the virulence activity of the type three effectors avrBs2, hpaF and xopZ from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Cassava
Capítulo en Memoria
Guevara-Suarez M, Sopo L, Motta A, Tabima J, M. C. Cepero de García, García A, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Especies de Fusarium asociadas con onicomicosis en Colombia
VIII Encuentro Nacional de Investigación en Enfermedades Infecciosas
Capítulo en Memoria
Bernal A. (2012)
Expressing diverse versions of disease resistance proteins for protection against cassava bacterial blight
Capítulo en Memoria
Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Fusarium species associated with onychomycoses in Colombia.
18th Congress of the International Society for Human and Animal Mycology
Capítulo en Memoria
Rodriguez L. M., Grajales A, Arrieta M, Salazar J. C., Restrepo S, Bernal A. (2012)
Genomes-based phylogeny of the genus Xanthomonas
BMC Microbiology (ISSN 1471-2180)
Artículo
Bart R, Cohna M, Kassena A, Bernal A, et al. (2012)
High-throughput genomic sequencing of cassava bacterial blight strains identifies conserved effectors to target for durable resistance
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (ISSN 0027-8424)
Artículo
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2012).
Metabolismo de pirimidinas en Phytophthora infestans: Búsqueda de estrategias comunes para el control de patógenos Oomycetes como Phytophthora infestans basados en los blancos para el control de parásitos apicomplexa.
Evento
Mideros M, Bastidas J, Castillo Y. V., Lagos L, Bernal A, Restrepo S. (2012)
Pathogenicity and aggressiveness of isolates belonging to a new Phytophthora infestans sensu lato population in Colombia
Annual Meeting of the American Phytopathological Society
Capítulo en Memoria
Muñoz A, Guevara-Suarez M, Amado Y, Bocanegra L, Sopo L, Motta A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Phylogenetic relationship of Malassezia species isolated from seborrheic dermatitis
18th Congress of the International Society for Human and Animal Mycology
Capítulo en Memoria
Cardenas M, Danies G, Tabima J, Bernal A, Restrepo S. (2012)
Phytophthora infestans population structure: A worldwide scale
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Artículo
Hurtado V, Trujillo C, Ocampo J, Restrepo S, Bernal A. (2012)
Plausible role of the interactions between the effector HpaF of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis and Manihot esculenta proteins in the plant defense system
Capítulo en Memoria
Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2012).
Preliminary biochemical characterization of the pyrimidine salvage pathway enzyme uracil phosphoribosyltransferase in the plant pathogen Phytophthora infestans and its host Solanum tuberosum
Evento
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2012).
Pyrimidine metabolism in Phytophthora infestans: new control strategies based on targets used to control apicomplexan parasites
Evento
Bernal A.
Role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in the virulence towards cassava.
Evento
Bernal A. (2012)
Structure and Diversity of colombian populations of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis, the causal agent of cassava bacterial blight. Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Capítulo en Memoria
Tabima J, Mideros M, Bernal A, Jiménez P, Riaño D, Grunwald N. J., Restrepo S. (2012)
The dynamics of evolution in Phytopththora infestans as told by phylogeographical approaches.
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Vargas N, Bernal A, Sarria V, Franco A, Restrepo S. (2011)
Amatoxin and phallotoxin composition in species of the genus Amanita in Colombia: A taxonomic perspective
Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology (ISSN 0041-0101)
Artículo
Gonzalez A, Borrero A, Bernal A. (2011)
Applications of Molecular Docking and Molecular Dynamics on the Inhibition of Quorum Sensing Systems: The Case of Indol and 3-OH PAME
Otro
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2011).
Biochemical characterization of recombinant Dihydroorotate dehydrogenase from the plant pathogenic Oomycete Phytophthora infestans
Evento
Reyes P, Restrepo S, Bernal A. (2011)
Cassava's immunity suppression mediated by Type III effectors of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Garavito M.F, Hortua M, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2011).
Common strategies for controlling human Apicomplexan parasites and agricultural Oomycete pathogens such as Phytophthora infestans
Evento
Trujillo C, Restrepo S, López C. E., Bernal A. (2011)
Diversity and population dynamics of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Colombia from 2008 to 2010
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Cardenas M, Medina E, Tabima J, Bernal A, Restrepo S, C. A. Lopera. (2011)
First Report of Phytophthora infestans Causing Late Blight on Solanum viarum in Colombia
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Artículo
Garcia-Bayona L, Grajales A, Cardenas M, Sierra R, M. C. Cepero de García, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
First report of Fusarium oxysporum causin potato dry rot in solanum tuberosum in colombia
New Disease Reports (ISSN 2044-0588)
Artículo
Cardenas M, Tabima J, Vargas A, C. A. Lopera, Bernal A, Restrepo S. (2011)
First report of Phytophthora infestans causing Late blight in the wild Solanaceae, Solanum viarum, in Colombia
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Artículo
Cardenas M, Grajales A, Sierra R, Rojas A, González A, Vargas A, Marín M, Fermín, Lagos, Grunwald N. J., Bernal A, Salazar C, Restrepo S. (2011)
Genetic diversity of Phytophthora infestans in the Northern Andean region
BMC Genetics (ISSN 1471-2156)
Artículo
Mideros Y, Castillo Y, Obando C, Cardenas M, Lagos L, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
Genetic structure and patogenicity of Phytophthora infestans sensu lato collected from Solanum betaceum in southwestern Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Garcia-Bayona L, Grajales A, Cardenas M, Sierra R, Lozano G, Garavito M.F, M. C. Cepero de García, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
Isolation and characterization of two strains of Fusarium oxysporum causing potato dry rot in Solanum tuberosum in Colombia.
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Artículo
Gil J, Bohórquez L, Bernal A, López C. E., Castiblanco L. (2011)
LA PROTEÍNA PTHB DE Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis ES AUTOACTIVA EN ENSAYOS DE DOBLE HÍBRIDO
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Artículo
Olarte X, Fermín, Tabima J, Rojas Y, Tennant P, Fuchs M, Sierra R, Bernal A, Restrepo S. (2011)
Phylogeography and molecular epidemiology of Papaya ringspot virus
Virus Research (ISSN 0168-1702)
Artículo
Restrepo M, Restrepo S, Bernal A. (2011)
RpfG interaction in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Pinzon A, Rodriguez L. M., Gonzalez A, Bernal A, Restrepo S, Gonzalez A. (2011)
Targeted metabolic reconstruction: a novel approach for the characterization of plant-pathogen interactions
Briefings in Bioinformatics (ISSN 1467-5463)
Artículo
Cai R, Lewis J, Yan S, Liu H, Clarke C, Campanile F, Almeida N, Studholme D, Lindeberg M, Schneider D, Zaccardelli M, Setubal J, Morales N, Bernal A, Coaker G, Baker C, Bender C, Leman S, Vinatzer B. (2011)
The Plant Pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato Is Genetically Monomorphic and under Strong Selection to Evade Tomato Immunity
PLoS Pathogens (ISSN 1553-7366)
Artículo
Bernal A. (2011)
The PthB protein from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis is an autoactive in yeast two-hybrid assays
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Artículo
Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2011).
Uracil Phosphoribosyltransferase inhibition as a complementary target for Phytophthora infestans control
Evento
Patiño A, Amado Y, M. C. Cepero de García, Chaves D, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis Ramírez AM. (2011)
Virulence Gene Expression in Malassezia spp from Individuals with Seborrheic Dermatitis
Journal of Investigative Dermatology (ISSN 0022-202X)
Artículo
Arrieta M, Rodriguez L. M., Restrepo S, Koebnik R, Bernal A. (2010)
A bioinformatic study of pathogenicity factors in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Gorrón E, Rodríguez F, Bernal D, Rodriguez L. M., Bernal A, Restrepo S, Tohme J. (2010)
A new method for designing degenerate primers and its use in the identification of sequences in Brachiaria showing similarity to apomixis-associated genes
Bioinformatics (ISSN 1367-4803)
Artículo
Bernal A, Restrepo S. (2010)
Bacterial Phylogenomics Revisited: A Case study for the Xanthomonas genus
Capítulo en Memoria
Antolinez A, Danies G, Peña A, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Biochemical and microscopical study of Phytophthora infestans process of infection on Physalis peruviana
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Del J, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Developing a taxonomic identification system based on microsatellites of Phytophthora species
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2010).
Dihydroorotate dehydrogenase from the phytopathogenic Oomycete Phytophthora infestans as a novel target for crop control.
Evento
Sierra R, Rodriguez L. M., Chaves D, Pinzon A, Grajales A, Rojas A, Mutis G, Cardenas M, Burbano D, Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Discovery of Phytophthora infestans Genes Expressed in Planta through Mining of cDNA Libraries
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Artículo
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2010)
Expression and homology modeling of Dihydroorotate dehydrogenase from the phytopathogenic Oomycete Phytophthora infestans
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Montenegro N, Alvarez A, Restrepo S, Bernal A. (2010)
Identification and characterization of genes involved in the type VI secretion system in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Cespedes L, Cardenas M, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Molecular and morphological characterization of a Phytophthora infestans population in the Colombian Andean region
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Trujillo C, Restrepo S, López C. E., Esquivel J, Bernal A. (2010)
Molecular diversity and population dynamics of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in the Caribbean region of Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2010).
Orotate phosphoribosyl transferase and orotidine-5-monophosphate decarboxylase as targets for control of Phytophthora infestans.
Evento
Danies G, Vargas A, Antolinez A, Peña A, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Physalis peruviana natural reservoir for Phytophthora infestans in the field
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Cardenas M, Cespedes L, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Phytophthora infestans oospores: Production and viability in Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Quesada L, Cespedes L, Carreño N, González A, Rojas A, Vargas A, Zuluaga A, Myers K, Fry W. E., Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2009)
Characterization of Phytophthora infestans Populations in Colombia: First Report of the A2 Mating Type
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Bernal A. (2009)
Characterization of effector proteins in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Capítulo en Memoria
Buitrago F, Sierra R, Grajales A, Jiménez P, Bernal A, Restrepo S, Rodriguez L. M.. (2009)
Comparative study of Chalcone synthase promoters across plant families
Revista Colombiana de Biotecnología (ISSN 0123-3475)
Artículo
Restrepo S, Pinzon A, Rodriguez L. M., Sierra R, Grajales A, Bernal A, Barreto E, Moreno P, Zambrano M, Cristancho M, Gonzalez A, Castro H. (2009)
Computational Biology in Colombia
PLoS Computational Biology (ISSN 1553-734X)
Artículo
Pinzon A, Barreto E, Bernal A, Achenie L, Gonzalez A, Isea R, Restrepo S. (2009)
Computational models in plant-pathogen interactions: the case of Phytophthora infestans
Theoretical Biology and Medical Modelling (ISSN 1742-4682)
Artículo
Buitrago F, Sierra R, Grajales A, Rodriguez L, Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2009)
Estudio comparativo de promotores de la Chalcón Sintasa en diferentes familias de plantas
Revista Colombiana de Biotecnología (ISSN 0123-3475)
Artículo
Bernal A, Restrepo S. (2009)
Identification of pathogenic effectors in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using a genetic screen.
XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
Capítulo en Memoria
Garcia-Bayona L, Grajales A, Sierra R, Cardenas M, Avila L, M. C. Cepero de García, Restrepo S, Bernal A. (2009)
Isolation and characterization of Fusarium oxysporum causing potato dry rot in Solanum tuberosum in Colombia - año 2009
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Trujillo C, Jarma A, López C. E., Restrepo S, Bernal A. (2009)
Molecular diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in three different agroecological regions in the Caribbean region of Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Prada H, Avila L, Sierra R, Bernal A, Restrepo S. (2009)
Morphological and molecular characterization of the antagonistic interaction between the endophyte Diaporthe sp isolated from frailejon (Espeletia sp.) and the plant pathogen Phytophthora infestans
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Artículo
Ryan R, Koebnik R, Szurek B, Boureau T, Bernal A, Bogdanove A, Dow J. (2009)
Passing GO (gene ontology) in plant pathogen biology: a report from the Xanthomonas Genomics Conference
Cellular Microbiology (ISSN 1462-5814)
Artículo
Sierra R, Cardenas M, Grajales A, Rodriguez L. M., Bernal A, Restrepo S. (2009)
Using bioinformatics in the characterization of novel putative virulence determinants of Phytophthora infestans expressed in planta
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Alvarez A, Gonzalez A, Bernal A. (2009)
Virtual Screening of Quenchers for the Signal 3-Hydroxypalmitic Acid Methyl Ester in Ralstonia Solanacearum
2009 AIChE Annual Meeting: Nashville, TN
Capítulo en Memoria
Bernal A, Yoo C, Mutwil M, Jensen J, Hou G, Blaukopf C, Sorensen I, Blancaflor E, Scheller H, Willats W. (2008)
Functional Analysis of the Cellulose Synthase-Like Genes CSLD1, CSLD2, and CSLD4 in Tip-Growing Arabidopsis Cells
Plant Physiology (ISSN 0032-0889)
Artículo
Sierra R, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2008)
Gene expression profiling of the infection of yellow potato (Solanum phureja) by Phytophthora infestans
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Jensen J, Sorensen S, Harholt J, Geshi N, Sakuragi Y, Moller I, Zandleven J, Bernal A, Jensen N, Pauly M, Beldman G, Willats W, Scheller H. (2008)
Identification of a xylogalacturonan xylosyltransferase involved in pectin biosynthesis in Arabidopsis
Plant Cell (ISSN 1040-4651)
Artículo
Gutiérrez S, Rodriguez L. M., Pardo C, Pinzón D, Morales N, Restrepo S, Bernal A. (2008)
Identification of effector genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using bioinformatics and a forward genetics screen
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Castiblanco L, Trujillo C, Alfonso N, López C. E., Szurek B, Verdier V, Restrepo S, Bernal A. (2008)
Molecular characterization of virulence and pathogenicity determinants in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Rojas A, Sierra R, González A, Vargas A, Cardenas M, Fermín, Lagos L, Bernal A, Restrepo S, Salazar C. (2008)
Study of the genetic diversity of Phytophthora infestans isolates from the Northern Andean region using seven genic regions
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2007)
Appearance of the mating type A2 in a population of Phytophthora infestans from six species of the Solanaceae family in the Cundinamarca - Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Bernal A, Jensen J, Harholt J, Sorensen S, Moller I, Blaukopf C, Johansen B, De R, Pauly M, Scheller H, Willats W. (2007)
Disruption of AtCslD5 results in reduced growth, reduced Xylan and Homogalacturonan synthase activity and altered Xylan occurrence in Arabidopsis
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Artículo
Vargas A, Correa A, Lozano D, Bernal A, Restrepo S, Jiménez P, González A. (2007)
First report of late blight caused by Phytophthora infestans on Cape gooseberry (Physalis peruviana) in Colombia.
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Artículo
Moller I, Sorensen I, Bernal A, Blaukopf C, Lee S, Obro J, Pettolino F, Roberts A, Mikkelsen J, Knox J, Bacic A, Willats W. (2007)
High-throughput mapping of cell-wall polymers within and between plants using novel microarrays
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Artículo
Barriga C, Pinzon A, Szurek B, González A, Morales N, Restrepo S, Bernal A, Verdier V. (2007)
Identification of pathogenicity determinants in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using comparative genomic tools
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Carreño N, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2007)
Problemas fitopatológicos en especies de la familia Solanaceae causados por los géneros Phytophthora, Alternaria y Ralstonia en Colombia
Agronomía Colombiana (ISSN 0120-9965)
Artículo
Tapiero A, Garnica D, Gordillo M, Bernal A, Restrepo S. (2006)
Molecular and pathogenic variability in colombian isolates of Phytophthora sojae
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Garnica D, Pinzon A, Quesada L, Bernal A, Restrepo S, Barreto E. (2006)
Molecular markers a la carte: Exploiting genomic databases for the generation of tools for understanding of Phytophthora spp. populations
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Artículo
Pinzon A, Garnica D, Quesada L, Bernal A, Barreto E, Grunwald N. J., Restrepo S. (2006)
Survey and analysis of microsatellites from transcript sequences in Phytophthora species: frequency, distribution, and potential as markers for the genus
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Artículo
Bernal A, Pan Q, Pollack J, Rose L, Kozik A, Willits N, Luo Y, Guittet M, Kochetkova E, Michelmore R. (2005)
Functional analysis of the plant disease resistance gene Pto using DNA shuffling
Journal of Biological Chemistry (ISSN 0021-9258)
Artículo
Manfield I, Bernal A, Moller I, Mccartney L, Riess N, Knox J, Willats W. (2005)
Re-engineering of the PAM1 phage display monoclonal antibody to produce a soluble, versatile anti-homogalacturonan scFv
PLANT SCIENCE (ISSN 0168-9452)
Artículo
Manfield I, Orfila C, Mccartney L, Harholt J, Bernal A, Scheller H, Gilmartin P, Mikkelsen J, Knox J, Willats W. (2004)
Novel cell wall architecture of isoxaben-habituated Arabidopsis suspension-cultured cells: global transcript profiling and cellular analysis
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Artículo
Bernal A, Willats W. (2004)
Plant science in the age of phage
Trends in Plant Science (ISSN 1360-1385)
Artículo
Chang J, Tai Y, Bernal A, Lavelle D, Staskawicz B, Michelmore R. (2002)
Functional analyses of the Pto resistance gene family in tomato and the identification of a minor resistance determinant in a susceptible haplotype
Molecular Plant-Microbe Interactions (ISSN 0894-0282)
Artículo
Suarez M, Bernal A, Gutiérrez J, Tohme J, Fregene M. (2000)
Developing expressed sequence tags (ESTs) from polymorphic transcript-derived fragments (TDFs) in cassava (Manihot esculenta Crantz)
Genome / National Research Council Canada = Genome / Conseil national de recherches Canada (ISSN 0831-2796)
Artículo
Chang J, Rathjen J, Bernal A, Staskawicz B, Michelmore R. (2000)
avrPto enhances growth and necrosis caused by Pseudomonas syringae pv. tomato in Tomato lines lacking either Pto or Prf
Molecular Plant-Microbe Interactions (ISSN 0894-0282)
Artículo
Títulos académicos
Doctor Of Philosophy In Plant Pathology
Doctorado
University Of California
2003
Estados Unidos
Microbióloga
Título de grado
Universidad De Los Andes, Colombia
1994
Colombia
Proyectos
- 2021
- Explorando los microbiomas de suelos asociados con sistemas agrícolas contrastantes y la diversidad de aislamientos de la roya del café en Colombia
Duración: 45 meses
PR.6.2021.8007
En este proyecto se pretende evaluar el impacto de la agricultura en la diversidad bacteriana del suelo yla influencia de diferentes prácticas agronómicas en él, utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento en sistemas de cultivos de café, yuca, Sacha-Inchi y tomate de árbol en Colombia. De igual forma se pretende estudiar la diversidad molecular de la roya del café causada por el hongo Hemileia vastatrix, utilizando también secuenciación de tercera generación.
- 2020
- 2019
- 2016
- 2007