Adriana Jimena Bernal Giraldo

La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

La producción de diferentes tipos de biocompuestos a partir de biomasa vegetal ha impactado la economía mundial en la última década. Específicamente, los residuos agrícolas han sido considerados como una excelente fuente de energía renovable para la generación de químicos orgánicos. Sin embargo, uno de los cuellos de botella en estos bioprocesos es la ineficiente sacarificación enzimática de los polisacáridos vegetales. Generalmente, esto se debe a la naturaleza compleja y recalcitrante de los polímeros que conforman la pared celular de las plantas (i.e. lignocelulosa). La degradación de biomasa vegetal es un proceso metabólico llevado a cabo principalmente por bacterias y hongos en la naturaleza. Sin embargo, aún existe poco entendimiento acerca de la eco-enzimología de este proceso dentro comunidades microbianas. Este proyecto se enfocará en la construcción y análisis de consorcios microbianos lignocelulolíticos derivados de suelo de bosque. El método de enriquecimiento estará acoplado a un método de selección (e.g. dilution-to-extinction) con el fin de obtener un consorcio mínimo eficiente. Durante la construcción de los consorcios, análisis (meta)ómicos y enzimáticos se realizarán con el fin de evaluar la diversidad, dinámicas y funcionalidad de las comunidades microbianas seleccionadas.

La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo fundamental para la seguridad alimentaria de millones de personas en el mundo. En Colombia, la región Caribe contribuye a aproximadamente la mitad de la producción nacional, a pesar de los problemas socioeconómicos y políticos de la región como la propiedad de la tierra, las dinámicas de comercialización, el conflicto armado, el cambio climático y los problemas fitosanitarios. La más grande amenaza para lograr una producción estable es la bacteriosis vascular (en inglés, Cassava Bacterial Blight -CBB), que es una enfermedad causada por el patógeno Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) capaz de causar daños irreversibles a la planta, impidiendo su crecimiento y productividad. Considerando que la yuca es principalmente propagada por estacas que son intercambiadas entre los campesinos, en este estudio se pretende analizar el impacto de las dinámicas socioculturales asociadas con las prácticas de manejo en la dispersión de CBB en cultivos de yuca en el Caribe Colombiano, tomando como caso de estudio los municipios de la subregión de Sabanas en el departamento de Córdoba. Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

Una de las enfermedades que conlleva pérdidas en los cultivos de yuca es el añublo bacteriano causado por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Desde 1990 se han realizado diferentes estudios analizando la diversidad genética de las poblaciones de Xam y se reportó alta diversidad poblacional y cambio rápido en el tiempo. La alta diversidad de Xam ha conllevado a la pérdida de resistencia de las variedades de yuca cultivadas y a la necesidad de desarrollar nuevas estrategias para controlar la enfermedad. Además, los estudios muestran la importancia de analizar continuamente las dinámicas poblaciones. El objetivo de este estudio es utilizar análisis de repeticiones en tándem de número variable (VNTRs) para caracterizar poblaciones de Xam y analizar si se conserva alta diversidad de poblaciones en la localidad de Chinú-Colombia. Para desarrollar el estudio, las cepas de Xam colectadas en la localidad de Chinú durante el 2014 y las cepas más diversas encontradas en los estudios de los 90s y 2008 a 2010, serán analizadas utilizando primers para amplificar 4 loci minisatelites y 18 loci microsatélites. Los resultados del proyecto permitirán evaluar la técnica de VNTRs previamente estandarizada y analizar la diversidad de Xam en el tiempo en la localidad de Chinú.