Helena Groot de Restrepo

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Helena Groot de Restrepo

Helena Groot de Restrepo

Magíster En Microbiología

hgroot @uniandes.edu.co

Profesor Titular

Departamento de Ciencias Biológicas

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Recent Courses

  • 2020
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level

Recent Products

Spinelli R, Barrero L, Lopez J, Muñoz C, Groot H, Siano A. (2020)
Cytotoxic and antiproliferative activities of amphibian (anuran) skin extracts on human acute monocytic leukemia cells
Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology (ISSN 0041-0101)
Article
Lago J, Navas D, Groot H, Lago P, Polania D.
Development of an Accessible Open Source Code in Python for High-Resolution Melting Data Analysis from Patients Diagnosed with Hemophilia A in Bogotá, Colombia
Event

Recent Degrees

Magíster En Microbiología

Master degree

Universidad De Los Andes

1984

Colombia

Licenciada En Microbiología

Bachelor degree

Universidad De Los Andes

1970

Colombia

Recent Projects

  • 2016
    • ACTIVIDAD ANTIMICROBIANA DE SECRECIONES DE PIEL DE RANAS Y SU RELACIÓN CON VARIABLES BIOCLIMÁTICAS: UN ESTUDIO A NIVEL INTER E INTRAESPECIE

      Duration: 24 months

      PR.6.2016.2747

      La piel de los anuros está encargada de la primera línea de defensa contra microorganismos patógenos. Se ha planteado que esto es posible mediante la secreción de cócteles de sustancias bioquímicas en la piel que tienen actividad antimicrobiana. El repertorio de sustancias secretadas puede variar mucho entre especies hermanas de ranas, inclusive, entre individuos de una misma especie. Sin embargo, es poca la información sobre si esta actividad antimicrobiana tiene alguna relación propiamente con el medio ambiente en el que se desarrolla cada especie de rana. Este proyecto se propone desarrollar dos preguntas de investigación. La primera, sobre microbiología, radica en la identificación y evaluación de actividad antimicrobiana de las secreciones de piel de varias especies de ranas. La segunda pregunta, sobre biología, radica en identificar si existe una relación entre esta actividad antimicrobiana con las variables bioclimáticas del lugar de origen de las ranas. Adicionalmente, serán realizados dos análisis: el primero a nivel interespecífico para identificar la relación de su correspondiente actividad antimicrobiana con el ambiente en que se desarrolla cada especie de rana. El segundo análisis, a nivel intraespecífico, será realizado con varios individuos de Hypsiboas crepitans. En donde se propone identificar la posible relación entre la variación de la actividad antimicrobiana entre poblaciones de una misma especie con el ambiente en que se desarrolla cada población.

      Identification and Antimicrobial Activity of Peptides Derived from Frogs Skin and their Microbiota

      Duration: 36 months

      PR.6.2016.3067

      El rápido incremento de la resistencia de las bacterias a todas las clases de antibióticos disponibles es uno de los mayores problemas de salud pública a nivel mundial. En este sentido la búsqueda de nuevos compuestos antimicrobianos se ha intensificado especialmente la dirigida a encontrar moléculas de la naturaleza. La piel de los anfibios pueden generar grandes cantidades de péptidos antimicrobianos (PAM) de diferentes tamaños, estructuras y cargas que actúan en sinergia y a su vez regulan la microbiota de su piel. Descubrimientos recientes indican que los PAM producidos por la piel de las ranas y los metabolitos producidos por su microbiota son importantes para el desarrollo normal del animal. Los PAM de piel de rana presentan entre 11-46 aminoácidos de longitud, tienen carga catiónica, contienen una proporción significativa de residuos hidrofóbicos y son propensos  formar estructura de alfa hélice. El principal mecanismo de acción de estos péptidos es el rompimiento de la membrana bacteriana, pero también pueden atacar blancos intracelulares. Por otro lado, existen reportes que las comunidades bacterianas producen PAM, llamados bacteriocinas, y su producción ocurre en todos los grupos de Eubacterias y Arqueobacterias. Por ejemplo, en Escherichia coli se han reportado colicins y bacteriocins en el 50% de las cepas aisladas de hospederos humanos. Además para Pseudomonas aeruginosa se ha encontrado que el 90% de las cepas aisladas producen bacteriocinas. Teniendo en cuenta estos datos, es lógico pensar que las bacteriocinas tengan una función en comunidades microbianas como es el caso de la microbiota de la piel de ranas. Nuestra hipótesis es que tanto los PAMs producidos por la piel de las ranas como los producidos por las bacterias de  su microbiota actúan en sinergia para evitar la invasión de otras de cepas bacterianas patógenas. Por las razones anteriormente expuestas, nuestro grupo de investigación está interesado en investigar los PAMs producidos por la interacción de la piel de las ranas con su microbiota natural. Creemos que estas mezclas naturales tienen un potencial antimicrobiano contra infecciones que involucran la salud humana. Para cumplir con el objetivo planteado para este trabajo, modificaremos la técnica de cultivo de micro-órganos de piel de ranas (SMOs) in vitro. Utilizaremos dos protocolos de SMOs, el primero incluirá un coctel de antibióticos para eliminar la microbiota de la piel de las ranas y obtener en el medio solo las moléculas secretadas por la rana. El segundo será realizado sin antibióticos para obtener todas las moléculas producidas tanto por la piel de las ranas como su microbiota. Finalmente, se identificarán péptidos antimicrobianos  obtenidos en cultivos, los cuales serán probados contra bacterias patógenas para los humanos.

Courses

  • 2020
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level
    • SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.2

      First period
      Doctoral Level

      DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level
    • SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.2

      Second period
      Doctoral Level

      GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level
    • GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
  • 2019
    • GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      First period
      Master Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level

      DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level
    • EPIDEMIOLOGIA MOLEC DEL CANCER

      First period
      Master Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level

      DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level
    • TOPICOS GENETICA HUMANA

      Second period
      Master Level

      EPIDEMIOLOGIA MOLEC DEL CANCER

      Second period
      Master Level
  • 2018
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      GENETICA TOXICOLOG.AMBIENTAL

      First period
      Master Level
    • EPID.MOLEC.ENFERM.COMPLE-LD

      First period
      Master Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level

      GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      Second period
      Master Level
  • 2017
    • GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      First period
      Master Level
    • EPID.MOLEC.ENFERM.COMPLE-LD

      Second period
      Master Level

      GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level

      DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level
    • BUSQUEDA SUST.POTENC.BIOMED-LD

      Second period
      Master Level
  • 2016
    • GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      First period
      Master Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      Second period
      Master Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      Second period
      Doctoral Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
    • TECN.CULTIVO CELULAS MAMIFEROS

      Second period
      Master Level
  • 2015
    • GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level

      DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      First period
      Master Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      Second period
      Master Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      Second period
      Doctoral Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level
  • 2014
    • SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      First period
      Master Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      Second period
      Master Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      First period
      Doctoral Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level

      DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
    • GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level
  • 2013
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
  • 2012
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level
  • 2011
    • TECN.CULTIVO CELULAS MAMIFEROS

      Second period
      Master Level

      SEM. EN GENET. TOXICOL. Y AMB.

      First period
      Master Level
    • DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      First period
      Bachelor Level

      DESCIFRANDO EL GENOMA HUMANO

      Second period
      Bachelor Level
    • GENÉTICA MÉDICA

      First period
      Bachelor Level

      GENÉTICA MÉDICA

      Second period
      Bachelor Level

Products

Spinelli R, Barrero L, Lopez J, Muñoz C, Groot H, Siano A. (2020)
Cytotoxic and antiproliferative activities of amphibian (anuran) skin extracts on human acute monocytic leukemia cells
Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology (ISSN 0041-0101)
Article
Lago J, Navas D, Groot H, Lago P, Polania D.
Development of an Accessible Open Source Code in Python for High-Resolution Melting Data Analysis from Patients Diagnosed with Hemophilia A in Bogotá, Colombia
Event
Mestizo P, Narváez DM, Pinzon J, Torres D, Franco S, Macias M, Groot H, Miscione G, Suescun L, Hurtado J. (2020)
Novel Complexes with ONNO Tetradentate Coumarin Schiff-Base Donor Ligands: X-ray Structures, DFT calculations, molecular dynamics and Potential Anticarcinogenic activity
Biometals (ISSN 0966-0844)
Article
Hurtado J, Mestizo P, Pinzon J, Narváez DM, Torres D, Macias M, Groot H.
Potential carcinogenic activity of new complexes containing coumarin Schiff-base ligands
Event
Suarez S, Narváez DM, Sarmiento P, Bocanegra L, Salcedo F, Muñoz C, Groot H, Cruz J. (2019)
Tridimensional alginate disks of tunable topologies for mammalian cell encapsulation
Analytical Biochemistry (ISSN 0003-2697)
Article
Suarez S, Sarmiento P, Salcedo F, Cruz J, Muñoz C, Groot H, Narváez DM. (2018)
3D Alginate Hydrogels with Controlled Mechanical Properties for Mammalian Cell Encapsulation
IX Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica
Inproceeding
Suarez S, Bocanegra L, Pastrana H, Cruz J, Muñoz C, Groot H, Narváez DM.
3D alginate hydrogels: Impact of substrate stiffness on cellular response of Human Adipose Mesenchymal Stem cells (hAdMSCs). Investigación y creación Uniandes 70 años. Noviembre 21. Poster
Event
Muñoz C, Salazar V, Barrero L, Groot H, Boix E. (2018)
Buforin II bacteria agglutination activity as part of its antimicrobial action mechanism
IX Seminario Internacional de Ingeniería Biomédica 2018 IX International Seminar of Biomedical Engineering
Inproceeding
Varona M, Ibañez M, Briceño L, Groot H, Narváez DM, Palma R, Herrera D, Morgan G, Torres C. (2018)
Evaluación de la exposición al polvo de carbón y de sílice en sitios de minería subterránea en tres departamentos de Colombia
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Cruz J, Muñoz C, Gonzalez A, Groot H, Briceño J, Cabrera R, Cuellar M.
Evaluación de un tratamiento tópico a base de péptidos antimicrobianos contra S.aureus MRSA en un modelo tridimensional in-vitro de piel humana
Colciencias.
Proposal
Muñoz C, Barrero L, Groot H.
Frog antimicrobial peptides in combination: a new strategy against Staphylococcus aureus. International Conference on Infectious Disease. November 5-7, Berlin, Germany. Oral presentation
Event
Lago J, Polania D, Groot H.
Genetic and clinical analysis of hereditary bleeding disorders in patients from Bogotá, Colombia, focused to improve their diagnosis
Event
Vanegas V, Muñoz C, Groot H.
Insights from the evaluation of antimicrobial peptides against the erythrocytic stage of Plasmodium falciparum.September 3-4, in Tokio, Japan. Infectious disease. Theme: Emerging Innovative Treatment & Therapeutic Techniques in Infectious Disease
Event
Cuellar M, Cifuentes J, Perez J, Suarez S, Serna J, Groot H, Muñoz C, Cruz J. (2018)
Novel BUF2-magnetite nanobioconjugates with cell-penetrating abilities
International Journal of Nanomedicine (ISSN 1178-2013)
Article
Bocanegra L, Suarez S, Muñoz C, Groot H.
Práctica en Microbiología: Ensayo de herida con medio condicionado de células madre mesénquimales obtenidas de tejido adiposo humano
Other
Mestizo P, Narváez DM, Groot H, Hurtado J.
Synthesis of Cobalt(II), Copper(II), Nickel(II), Zinc(II) and Platinum(II) Complexes with ONNO Tetradentate Coumarin Schiff-Base Donor Ligands.
Event
Suarez S, Cruz J, Muñoz C, Groot H, Narváez DM.
Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas: Diseño de matrices 3D de alginato para la encapsulación de células madre mesenquimales con uso potencial para diferenciación
Other
Pastrana H, Suarez S, Cruz J, Muñoz C, Groot H, Narváez DM.
The effect of 3D alginate hydrogel stiffness on cellular behavior. World Congress on Advanced Biomaterials and Tissue Engineering, June 20-21, in Rome, Italy. Poster.
Event
Muñoz C, Salazar V, Barrero L, Camargo S, Mosquera A, Groot H, Boix E, Salazar V. (2018)
Unveiling the multifaceted mechanisms of antibacterial activity of buforin II and frenatin 2.3S peptides from skin micro-organs of the orinoco lime treefrog (Sphaenorhynchus lacteus)
International Journal of Molecular Sciences (ISSN 1422-0067)
Article
Pinzon J, Perna Chaux A, Rojas N, Diaz A, Polania D, Jacome M, Mendivil C, Groot H, Lopez V. (2017)
Effect of diabetes status and hyperglycemia on global DNA methylation and hydroxymethylation
Endocrine Connections (ISSN 2049-3614)
Article
Casas J, Muñoz C, Groot H.
Evaluación de la actividad antibacteriana de las secreciones de piel de Hypsiboas crepitans en simbiosis con su microbiota nativa. August 18-19. Bogotá Microbial Meeting (III Edition), American Society of Microbiology, Universidad de los Andes
Event
Bolognesi C, Knasmueller S, Nersesyan A, Roggieri P, Ceppi M, Bruzzone M, Blaszczyk E, Mielzynska-Svach D, Milic M, Bonassi S, Benedetti D, Da Silva J, Toledo R, Favero D, Groot H, Filipic M, Hercog K, Aktas A, Burgaz S, Kundi M, Grummt T, Thomas P, Hor M, Escudero-fung M, Holland N, Fenech M. (2017)
Inter-laboratory consistency and variability in the buccal micronucleus cytome assay depends on biomarker scored and laboratory experience: results from the HUMNxl international inter-laboratory scoring exercise
MUTAGENESIS (ISSN 0267-8357)
Article
Barrero L, Muñoz C, Groot H.
New peptides immunomodulatory activity in macrophages and antibacterial activity against multiresistant Staphylococcus aureus. Co-dirección Tesis de Maestría en Ciencias Biológicas
Other
Barrero L, Muñoz C, Groot H.
New peptides with antibacterial and potentially immunomodulatory activity against Multiresistant Staphylococcus aureus. June 20-23. 4th International Conference on Prevention & Infection Control, Geneva-Switzerland
Event
Narváez DM, Groot H, Diaz S, Palma R, Muñoz N, Cros M, Hernandez-Vargas H. (2017)
Oxidative stress and repetitive element methylation changes in artisanal gold miners occupationally exposed to mercury
Heliyon (ISSN 2405-8440)
Article
Aristizabal A, Groot H, Camacho G, Realpe E, Paredes M. (2016)
ANÁLISIS DE LAS SECUENCIAS CITOCROMO OXIDASA I Y ESPACIADORES RIBOSOMALES TRANSCRITOS INTERNOS (ITS I Y II Y 5.8S) PARA LA IDENTIFICACIÓN DE ESPECIES DE INTERÉS FORENSE
Entomología mexicana (ISSN 2448-475X)
Article
Perez L .APORTES GENÉTICOS PARA EL ENTENDIMIENTO DE LA ORGANIZACIÓN SOCIAL DE LA COMUNIDAD MUISCA TIBANICA (SOACHA, CUNDINAMARCA). (2016).
APORTES GENÉTICOS PARA EL ENTENDIMIENTO DE LA ORGANIZACIÓN SOCIAL DE LA COMUNIDAD MUISCA TIBANICA (SOACHA, CUNDINAMARCA)
Thesis
Barrero L .Actividad antimicrobiana de secreciones de piel de ranas y su relacio?n con variables bioclima?ticas: Un estudio a nivel inter e intraespecie. (2016).
Actividad antimicrobiana de secreciones de piel de ranas y su relacio?n con variables bioclima?ticas: Un estudio a nivel inter e intraespecie
Thesis
Muñoz C .Búsqueda de péptidos antimicrobianos nuevos en secreciones de piel de ranas. (2016).
Búsqueda de péptidos antimicrobianos nuevos en secreciones de piel de ranas
Thesis
Varona M, Diaz S, Briceño L, Sánchez C, Torres C, Palma R, Groot H, Idrovo A. (2016)
Determining social factors related to pesticide poisoning among rice farmers in Colombia
Revista de Salud Publica (ISSN 0124-0064)
Article
Muñoz C, Mndez M, Salazar V, Moscoso J, Narváez DM, Torres M, Florez F, Groot H, Mitrani E, Salazar V. (2016)
Frog skin cultures secrete anti-yellow fever compounds
Journal of Antibiotics (ISSN 0021-8820)
Article
Hurtado-McCormick S, Sanchez L, Martinez A, Calderon L, Calvo D, Narváez DM, Lemus M, Groot H, Rodriguez M. (2016)
Fungi in biofilms of a drinking water network: Occurrence, diversity and mycotoxins approach
Water Science and Technology: Water Supply (ISSN 1606-9749)
Article
Toro J, Cuellar-Giraldo D, Burbano L, Guio C, Reyes S, Cortes F, Cardenas-Robledo S, Narváez DM, Cardenas W, Porras A, Lattig M, Groot H. (2016)
HLA-DRB1*14 is a protective allele for multiple sclerosis in an admixed Colombian population
Neurology: Neuroimmunology and Neuroinflammation (ISSN 2332-7812)
Article
Ossa H, Aquino J, Pereira R, Ibarra A, Ossa R, Perez L, Granda J, Lattig M, Groot H, De Carvalho E, Gusmao L. (2016)
Outlining the ancestry landscape of Colombian admixed populations
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Article
Talero V, Narváez DM, Jaramillo J, Pineda M, Groot H, Lopez R, Briceño J. (2016)
Preliminar In-Vitro characterization of Small Intestinal Submucosa and Hyaluronic Acid scaffold as an open wound dressing material
TISSUE ENGINEERING PART A (ISSN 1937-3341)
Article
Perez L, Rodriguez Saza, F., Langebaek C, Groot H. (2016)
Real-time quantification to analyze historical Colombian samples detecting a short fragment of hypervariable region II of mitochondrial DNA
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Narváez DM .Risk assessment in occupationally exposed populations to toxic agents: Determination of genetic and epigenetic effects under oxidative stress conditions. (2016).
Risk assessment in occupationally exposed populations to toxic agents: Determination of genetic and epigenetic effects under oxidative stress conditions
Thesis
Narváez DM .Risk assessment in occupationally exposed populations to toxic agents: Determination of genetic and epigenetic effects under oxidative stress conditions.. (2016).
Risk assessment in occupationally exposed populations to toxic agents: Determination of genetic and epigenetic effects under oxidative stress conditions.
Thesis
Camargo S .ACTIVIDAD BIOLÓGICA DE NUEVOS PÉPTIDOS DE PIEL DE RANAS CON POTENCIAL ANTIMICROBIANO EN MACRÓFAGOS Y MICROORGANISMOS RESISTENTES. (2015).
ACTIVIDAD BIOLÓGICA DE NUEVOS PÉPTIDOS DE PIEL DE RANAS CON POTENCIAL ANTIMICROBIANO EN MACRÓFAGOS Y MICROORGANISMOS RESISTENTES
Thesis
Groot H, Narváez DM, Miranda M. (2015)
EPIDEMIOLOGÍA MOLECULAR EN LA PREVENCIÓN DEL CÁNCER OCUPACIONAL
Medicina (ISSN 0025-7680)
Article
Torres C, Ibañez M, Briceño L, Checa D, Morgan G, Groot H, Varona M. (2015)
Underground Coal Mining: Relationship between Coal Dust Levels and Pneumoconiosis, in Two Regions of Colombia, 2014
BioMed Research International (ISSN 2314-6133)
Article
Muñoz C, Lopez V, Groot H. (2014)
El secreto antimicrobiano de las histonas
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Article
Narváez DM, Polania D, Torres C, Briceño L, Morgan G, Palma R, Varona M, Groot H. (2014)
Association between Glutathione S-transferases GSTM1 and GSTT1 polymorphisms and Risk of Coal Workers' Pneumoconiosis
MUTAGENESIS (ISSN 0267-8357)
Article
Rojas N .Caracterización de los niveles de metilación e hidroximetilación en pacientes con Diabetes Mellitus tipo 2.. (2014).
Caracterización de los niveles de metilación e hidroximetilación en pacientes con Diabetes Mellitus tipo 2.
Thesis
Polania D .GENÉTICA MOLECULAR DE LA HEMOFILIA A EN UNA FAMILIA COLOMBIANA CON DIAGNÓSTICO DE ENFERMEDAD DE VON WILLEBRAND Y DE HEMOFILIA A. (2014).
GENÉTICA MOLECULAR DE LA HEMOFILIA A EN UNA FAMILIA COLOMBIANA CON DIAGNÓSTICO DE ENFERMEDAD DE VON WILLEBRAND Y DE HEMOFILIA A
Thesis
Narváez DM, Hernandez A, Lopez V, Diaz S, Palma R, Varona M, Groot H. (2014)
Genotoxic and epigenetic effects of Lead in recycling automotive battery workers
MUTAGENESIS (ISSN 0267-8357)
Article
Polania D, Groot H, Narváez DM. (2014)
Genética molecular de la Hemofilia A en una familia colombiana con diagnóstico de enfermedad de von Willebrand y de Hemofilia A
Medicina (ISSN 0025-7680)
Article
Cano D, Gomez C, Ospina N, Cajigas J, Groot H, Andrade R, Torres M. (2014)
Mitochondrial DNA Haplogroups and Susceptibility to Prostate Cancer in a Colombian Population
ISRN Oncology (ISSN 2090-5661)
Article
Pinto A .Simulación y verificación experimental del daño en el ADN debido a la interacción con rayos X. (2014).
Simulación y verificación experimental del daño en el ADN debido a la interacción con rayos X
Thesis
Tabima D, Narváez DM, Groot H, Lopez R.
Study On Early Cellular Adhesion During The Development of 3D Small Intestinal Submucosa Scaffolds
Event
Varona M, Narváez DM, Groot H, Combariza D. (2013)
Biomarcadores y Genotoxicidad
Toxicología Ocupacional (ISBN 978-958-57096-2-1)
Inbook
Villamizar V .Caracterización molecular de procesamientos no canónicos del factor de transcripción Ikaros en pacientes con Leucemia Linfoide Aguda tipo B.. (2013).
Caracterización molecular de procesamientos no canónicos del factor de transcripción Ikaros en pacientes con Leucemia Linfoide Aguda tipo B.
Thesis
Narváez DM, Miranda M, Palma R, Varona M, Groot H.
Chromosomal damage and genetic polymorphisms in car painters exposed to organic solvents.
Event
Hernandez A .Determinación de los Efectos Genotóxicos y Epigenéticos del plomo en Personas expuestas en el Reciclaje de Baterías.. (2013).
Determinación de los Efectos Genotóxicos y Epigenéticos del plomo en Personas expuestas en el Reciclaje de Baterías.
Thesis
Lopez V, Orozco C, Acevedo A, Cortina L, Cuellar G, Mónica D, Martín E, Mesa N. M., Muñoz J, Portilla C. A., Quijano S, Quintero G, Rodriguez M, Saavedra C, Groot H, Torres M. (2013)
El perfil de splicing del factor de transcripción ikaros caracteriza subtipos de neoplasias hematológicas
Revista Colombiana de Cancerología (ISSN 0123-9015)
Article
Hernandez A, Narváez DM, Lopez V, Diaz S, Palma R, Varona M, Groot H.
Genotoxic effects of Lead in recycling automotive battery workers from Bogotá Colombia.
Event
Gil S .Relación de las variantes alélicas de los genes CTLA4 y PADI4 con Artritis Reumatoide en un grupo de Pacientes Colombianos. (2013).
Relación de las variantes alélicas de los genes CTLA4 y PADI4 con Artritis Reumatoide en un grupo de Pacientes Colombianos
Thesis
Orozco C, Acevedo A, Cortina L, Cuellar G. E., Duarte M, Martin L, Mesa N. M., Muñoz J, Portilla C. A., Quijano S, Quintero G, Rodriguez M, Saavedra C, Groot H, Torres M, Lopez V. (2013)
The Combined Expression Patterns of Ikaros Isoforms Characterize Different Hematological Tumor Subtypes
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Article
Orozco C, Duarte M, Mesa N, Quijano S, Torres M, Saavedra C, Groot H, Lopez V. (2013)
The joint expression of Ikaros isoforms is characteristic of the haematological tumor subtype
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Article
Sanabria D, Groot H, Guzman J, Lattig M. (2012)
An overview of oculocutaneous albinism: TYR gene mutations in five Colombian individuals.
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Pastrana H, Narváez DM, Groot H, Avila A, Muñoz F, Cuellar F.
Citotoxicidad y Genotoxicidad de Nanopartículas de SiO2 y TiO2 in vitro
Research International Proposal
Rojas W, Parra M, Torres M, Groot H, et al. (2012)
Erratum: Genetic make up and structure of Colombian populations by means of uniparental and biparental DNA markers (American Journal of Physical Anthropology 143 (13-20))
American Journal of Physical Anthropology (ISSN 1096-8644)
Article
Groot H, Muñoz C, Moscoso J, Riveros G, Salazar V, Florez F, Mitrani E, Salazar V. (2012)
Skin micro-organs from several frog species secrete a repertoire of powerful antimicrobials in culture
Journal of Antibiotics (ISSN 0021-8820)
Article
Muñoz C, Mitrani E, Groot H.
Búsqueda de actividad antibiótica e identificación de precursores génicos en la rana Spahaenorhynchus lacteus
Event
Orozco C, Groot H, López V. (2011)
Estandarización de una técnica diagnóstica basada en los perfiles de expresión de la familia de factores de transcripción Ikaros en pacientes con leucemia. XLVI Congreso Nacional de Ciencias Biológicas
Revista de la Asociacion Colombiana de Ciencias Biológicas (ISSN 0120-4173)
Article
Araus J, Groot H, Gonzalez A. (2011)
Modeling of genetic regulatory networks in the differentiation of neural crest stem cells to sensory neurons by means of boolean networks
Revista Facultad de Ingenieria (ISSN 0120-6230)
Article
Lattig M, Groot H, Toro J, Amorim A, Gusmao L. (2011)
Population substructure effect in a case-control study of Multiple Sclerosis (MS) in Bogota – Colombia
61th Annual Meeting, ASHG
Inproceeding
Groot H, Narváez DM, Miranda M. (2011)
Química y Genética: inseparables en la function del ADN.
Innovación y Ciencia (ISSN 0121-5140)
Article
Sanabria D, Groot H, Guzman J, Lattig M. (2010)
Albinismo Oculocutáneo Relacionado con la Tirosinasa (OCA1 A/B): Reporte de la mutación G47D en Colombia
XI Congreso Colombiano de Genética Humana
Inproceeding
Groot H, Crdenas J, Mora C, Paredes M. (2010)
Análisis de 22 SNPS autosomales en una muestra de población Cundiboyancense en Colombia y su aplicación en identificación humana
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Groot H, Salazar I, Paredes M. (2010)
Análisis del citocromo b y la región control del ADN mitocondrial. en una muestra de la población de Felis catus, L en Bogotá, Colombia. Aplicaciones Forenses
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Groot H, Narvez D, Olaya L, Varona M, Londoo A, Paez M, Castro R. (2010)
Association between DNA Damage and the Use of Pesticides in Tomato Crop
Environmental and Molecular Mutagenesis (ISSN 0893-6692)
Article
Torres M, Groot H, Cano D, Ospina N, Piazuelo M, Correa P.
Correlation between Human and Helicobacter pylori ancestry in Colombian population
Event
Gomez Y, Perea C, Castañeda A, Ruiz S, Peña K, Otalora A, Groot H, Lattig M.
El gen transportador de serotonina 5HTTLPR y STin2 y la susceptibilidad a la sintomatología depresiva y ansiosa en estudiantes universitarios
Event
Groot H, Torres M, Ospina N, Gmez C, Andrade R, Cajigas J. (2010)
Evaluación de polimorfismos en enzimas metabólicas: CYP17, SRD5A2 Y GSTS en un grupo de casos y controles en una muestra de la población asociada con susceptibilidad y riesgo a desarrollar cáncer de próstata
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Lattig M, Groot H, Gonzlez J, Perea C, Guio C, Toro J. (2010)
HLA-DRB1 - susceptibilidad y protección en pacientes con Esclerosis Múltiple en Bogotá – Colombia
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Lattig M, Perea C, Guio C, Gonzalez J. M., Groot H, Toro J.
HLA-DRB1*14 allele confers a protective role to Multiple Sclerosis in a Colombian population
Event
Groot H, Aristizabal N, Paredes M, Camacho G. (2010)
Identificación de especies de interés forense de la familia Calliphoridae a partir de individuos inmaduros y adultos de una muestra preliminar de Bogotá mediante el uso de los genes citocromo oxidasa I Y II
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Lattig M, Torres M, Groot H, Cardenas W, Torres M, Perea C, Guio C, Toro J. (2010)
Mitochondrial DNA Haplogroups in Patients with multiple Sclerosis in Bogotá
American Society of Human Genetics
Inproceeding
Groot H, Lattig M, Torres M, Cardenas W, Perea C, Gonzalez J. M., Guio C, Toro J.
Mitochondrial DNA Haplogroups and the relationship in patients with multiple sclerosis in Bogotá
Event
Groot H, Torres M, Cano D, Ospina N, Cajigas J.
Mitochondrial DNA haplogroups and susceptibility to prostate cancer in Colombian population
Event
Groot H, Perea C, Castañeda A, Ruíz S, Peña K, Otalora A, Gómez Y, Lattig M. (2010)
Polimorfismos en el transportador de serotonina (5HTT) y susceptibilidad a desarrollar sintomatología depresiva y ansiosa en estudiantes universitarios de Bogotá-Colombia
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Groot H, Lattig M, Torres M. (2010)
Relación de los haplogrupos del ANDmit y el polimorfismo Fok-I DEL receptor de vitamina D, en un grupo de pacientes con esclerosis múltiple
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Duran P, Salguero F, Paez P, Groot H, Lattig M.
Resistance to thyroid hormone: Description of a new mutation
Event
Salguero F, Duran P, Paez P, Laverde G, Groot H, Lattig M.
Resistance to thyroid hormone: description of a new mutation in a Colombian family
Event
Perea C, Castañeda A, Ruiz S, Peña K, Otalora A, Groot H, Gomez Y, Lattig M.
Serotonin transporter gene variants (5HTTlPR and STin2) and susceptibility to depressive and anxiety symtoms in undergraduate students in Bogotá Colombia
Event
Groot H, Salguero E, Mora C, Paredes M. (2010)
Subclasificación del haplogrupo b mitocondrial de una muestra de la población colombiana mediante SNPs de región codificante, como una herramienta para incrementar el poder de identificación de personas
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Groot H, Prez L, Paredes M, Mora C. (2010)
Tipificación de haplogrupos y sub haplogrupos de cromosoma Y relevantes para población de la región Caribe colombiana y su aplicación en identificación humana
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Sanabria D, Groot H, Guzman J, Lattig M.
Tyrosinase-related Oculocutaneous Albinism (OCA1A/B): report of the G47D mutation in Colombia
Event
Mesa M, Rueda M, Zayas R, Sicard D, Groot H. (2009)
Acción protectora de la melatonina sobre células mononucleares de sangre periférica hunana sometidas a radiación gamma Co60
Universitas Scientiarum (ISSN 0122-7483)
Article
Groot H, Castillo L, Mora C, Paredes M. (2009)
Análisis de la región control y el gen del Cyt b del ADNmt como herramienta para la caracterización de evidencia traza presuntiva de CANIS LUPUS FAMILIARIS
Iatreia (ISSN 0121-0793)
Article
Lattig M, Torres M, Groot H, Arturocrdenas W, Perea C, Toro J. (2009)
Aproximación al origen étnico mediante Haplogrupos de ADN mitocondrial en pacientes con esclerosis múltiple
Revista Universitas Médica (ISSN 2011-0839)
Article
Groot H, Lattig M, Perea C, M J, Toro J. (2009)
Asociación del alelo HLA DRB1*15 y susceptibilidad a esclerosis múltiple en población residente en Bogotá
Revista Universitas Médica (ISSN 2011-0839)
Article
Groot H. (2009)
CITOTOXICITY OF Sassafras albidum AND Rosmarinus officinalis IN DIFFERENT CELL LINES
Inproceeding
Groot H, Torres M.
DNA REPAIR GENE XRCC1 AND hOGG1 POLYMORPHISMS AND RISK OF PROSTATE CANCER IN COLOMBIAN POPULATION
Event
Groot H, Gmez C, Mora A, Ospina N, Andrade R. (2009)
Epidemiología molecular del cáncer de la próstata en pacientes colombianos
Revista Universitas Médica (ISSN 2011-0839)
Article
Groot H, Torres M.
GSTM1 AND GSTT1 POPLYMORPHISMS AN THE RISK OF PROSTATE CANCER IN A COLOMBIAN POPULATION
Event
Groot H. (2009)
In Vitro Evaluation of DNA damage induced by low doses of X rays
10TH ICEM (International conference on Environmental Mutagens)
Inproceeding
Lattig M, Perea C, Gonzalez J. M., Groot H, Toro J.
Influence of the HLA-DRB1*15 allele on Multiple Sclerosis in a Colombian population
Event
Groot H, Arana J, Jimnez P. (2009)
Metales como inhibidores de la técnica de PCR en el estudio genético de restos óseos humanos
Revista Universitas Médica (ISSN 2011-0839)
Article
Groot H, Lattig M, Torres M, Cardenas W, Perea C, Gonzalez J. M., Toro J.
Mitochondrial DNA Haplogroups and ethnical origins in patients with multiple sclerosis
Event
Groot H, Varona M, Torres C, Diaz S, Patio R, Albores A, Narvaez D. (2009)
Occupational Exposure to Organic Solvents: Biomarkers of Exposure, Effect and Susceptibility
Environmental and Molecular Mutagenesis (ISSN 0893-6692)
Article
Groot H, Mndez M, Triana G. (2009)
Pruebas de susceptibilidad antimicótica de sustancias secretadas por la piel de rana
Revista Universitas Médica (ISSN 2011-0839)
Article
Salguero F, Duran P, Paez P, Groot H, Lattig M.
Síndrome de Resistencia a la hormona tiroidea: caracterización clínico-molecular de una familia colombiana
Event
Groot H, Lattig M, Salguero F, Durn P. (2009)
Síndrome de resistencia a la hormona tiroidea: Caracterización clínico molecular de una familia colombiana
Revista Universitas Médica (ISSN 2011-0839)
Article
Torres C, Varona M, Lancheros A, Patiño R, Groot H. (2008)
Evaluación del daño en el ADN y vigilancia biológica de la exposición laboral a solventes orgánicos, 2006
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Muñoz C, Salazar V, Moscoso J, Riveros G, Florez F, Groot H, Mitrani E. (2008)
Identification of antibacterial and antiviral activities and identification of new genes from skin secretions from different species of Colombian frogs
6th world congress of herpetology
Inproceeding
Groot H, Rodriguez A. f., Ortiz S, Narváez DM, Torres C, Varona M. (2007)
Association of DNA damage and the polymorphisms of the enzymes CYP2E1, GSTM1 and GSTT1 in a population exposed to organic solvents
Environmental and Molecular Mutagenesis (ISSN 0893-6692)
Article
Groot H, Narváez DM, Ortiz S, Rodriguez A. f., Torres C, Varona M. (2007)
Biological monitoring and DNA damage evaluation of occupational exposure to organic solvents.
Environmental and Molecular Mutagenesis (ISSN 0893-6692)
Article
Cardenas O, Varona M, Patiño R, Groot H, Sicard D, Torres M, Pardo D. (2007)
Exposición a solventes orgánicos y efectos genotóxicos en trabajadores de fábricas de pintura en Bogotá
Revista de Salud Publica (ISSN 0124-0064)
Article
Torres M, Bravi C, Bortolini M, Duque C, Callegari S, Ortiz D, Bedoya G, Groot H, Ruiz A. (2006)
A revertant of the major founder native American haplogroup C common in populations from northern South America
American Journal of Human Biology (ISSN 1042-0533)
Article
Monroy C, Cortes A, Sicard D, Groot H. (2005)
Citotoxicidad y gentotoxicidad en células humanas expuestas in vitro a glifosato
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Briceño J, Groot H, Martinez D, Tabima D. (2004)
Desarrollo de una metodología para la preparación y evaluación biomecánica, in vitro e in vivo de soportes de colágeno obtenidas a partir de submucosa intestinal porcina
Article
Torres M, Acosta C, Sicard D, Groot H. (2004)
Genetic susceptibility and risk of gastric cancer in a human population of Cauca, Colombia [Susceptibilidad genética y riesgo de cáncer gástrico en una población del Cauca.]
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Torres M, Acosta C, Sicard D, Groot H. (2004)
Susceptibilidad Genética y Riesgo de Cáncer Gástrico en una población del Cauca
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Tabima D, Briceño J, Groot H. (2003)
Desarrollo de una metodología para la preparación y evaluación de matrices biodegradables usadas para el crecimiento de fibroblastos
Desarrollo de una metodología para la preparación y evaluación de matrices biodegradables usadas para el crecimiento de fibroblastos
Inproceeding
Bortolini M, Salzano F, Thomas, Stuart S, Torres M, Nasanen S, Bau C, Hutz M, Layrisse Z, Petzl-erler M, Tsuneto L, Hill K, Hurtado A, Castro D, Groot H, Michalski R, Nymadawa P, Bedoya G, Bradman N, Labuda D, Ruiz A. (2003)
Y-chromosome evidence for differing ancient demographic histories in the Americas
American Journal of Human Genetics (ISSN 0002-9297)
Article
Cann H, De C, Cazes L, Groot H, et al. (2002)
A human genome diversity cell line panel
Science (ISSN 0036-8075)
Other Publication
Torres M, Acosta C, Rodríguez X, Groot H, Salej J. (2002)
Glutathione S-Transferase Polimorphisms in Gastric Cancer in two Colombian Populations
Environmental and Molecular Mutagenesis (ISSN 0893-6692)
Article
Correa D, Arroyo J, Llinas A, Groot H, Briceño J. (2002)
Protocolos para el Diseño In Vitro de Cartílago Articular Animal Basados en Ingeniería de Tejidos
Revista Colombiana de Biotecnología (ISSN 0123-3475)
Article
Torres M, Rodríguez Y, Sicard D, Groot H. (2001)
Análisis de marcadores de susceptibilidad al cáncer gastrico en dos poblaciones colombianas
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Article
Torres M, Yanez C, Groot H, Sicard D. (2001)
People Exposed to Lead and the Comet Assay
Environmental and Molecular Mutagenesis (ISSN 0893-6692)
Article
Groot H, Torres M, Sicard D. (2000)
DNA damage and repair in cells of lead exposed people.
American Journal of Industrial Medicine (ISSN 0271-3586)
Article
Monsalve M, Groot H, Espinel A, Correal G, Devine D. (1994)
Evidence of mitochondrial DNA diversity in South American aboriginals
Annals of Human Genetics (ISSN 0003-4800)
Article

Degrees

  • Magíster En Microbiología

    Master degree

    Universidad De Los Andes

    1984

    Colombia

    Licenciada En Microbiología

    Bachelor degree

    Universidad De Los Andes

    1970

    Colombia

Projects

  • 2016
    • ACTIVIDAD ANTIMICROBIANA DE SECRECIONES DE PIEL DE RANAS Y SU RELACIÓN CON VARIABLES BIOCLIMÁTICAS: UN ESTUDIO A NIVEL INTER E INTRAESPECIE

      Duration: 24 months

      PR.6.2016.2747

      La piel de los anuros está encargada de la primera línea de defensa contra microorganismos patógenos. Se ha planteado que esto es posible mediante la secreción de cócteles de sustancias bioquímicas en la piel que tienen actividad antimicrobiana. El repertorio de sustancias secretadas puede variar mucho entre especies hermanas de ranas, inclusive, entre individuos de una misma especie. Sin embargo, es poca la información sobre si esta actividad antimicrobiana tiene alguna relación propiamente con el medio ambiente en el que se desarrolla cada especie de rana. Este proyecto se propone desarrollar dos preguntas de investigación. La primera, sobre microbiología, radica en la identificación y evaluación de actividad antimicrobiana de las secreciones de piel de varias especies de ranas. La segunda pregunta, sobre biología, radica en identificar si existe una relación entre esta actividad antimicrobiana con las variables bioclimáticas del lugar de origen de las ranas. Adicionalmente, serán realizados dos análisis: el primero a nivel interespecífico para identificar la relación de su correspondiente actividad antimicrobiana con el ambiente en que se desarrolla cada especie de rana. El segundo análisis, a nivel intraespecífico, será realizado con varios individuos de Hypsiboas crepitans. En donde se propone identificar la posible relación entre la variación de la actividad antimicrobiana entre poblaciones de una misma especie con el ambiente en que se desarrolla cada población.

      Identification and Antimicrobial Activity of Peptides Derived from Frogs Skin and their Microbiota

      Duration: 36 months

      PR.6.2016.3067

      El rápido incremento de la resistencia de las bacterias a todas las clases de antibióticos disponibles es uno de los mayores problemas de salud pública a nivel mundial. En este sentido la búsqueda de nuevos compuestos antimicrobianos se ha intensificado especialmente la dirigida a encontrar moléculas de la naturaleza. La piel de los anfibios pueden generar grandes cantidades de péptidos antimicrobianos (PAM) de diferentes tamaños, estructuras y cargas que actúan en sinergia y a su vez regulan la microbiota de su piel. Descubrimientos recientes indican que los PAM producidos por la piel de las ranas y los metabolitos producidos por su microbiota son importantes para el desarrollo normal del animal. Los PAM de piel de rana presentan entre 11-46 aminoácidos de longitud, tienen carga catiónica, contienen una proporción significativa de residuos hidrofóbicos y son propensos  formar estructura de alfa hélice. El principal mecanismo de acción de estos péptidos es el rompimiento de la membrana bacteriana, pero también pueden atacar blancos intracelulares. Por otro lado, existen reportes que las comunidades bacterianas producen PAM, llamados bacteriocinas, y su producción ocurre en todos los grupos de Eubacterias y Arqueobacterias. Por ejemplo, en Escherichia coli se han reportado colicins y bacteriocins en el 50% de las cepas aisladas de hospederos humanos. Además para Pseudomonas aeruginosa se ha encontrado que el 90% de las cepas aisladas producen bacteriocinas. Teniendo en cuenta estos datos, es lógico pensar que las bacteriocinas tengan una función en comunidades microbianas como es el caso de la microbiota de la piel de ranas. Nuestra hipótesis es que tanto los PAMs producidos por la piel de las ranas como los producidos por las bacterias de  su microbiota actúan en sinergia para evitar la invasión de otras de cepas bacterianas patógenas. Por las razones anteriormente expuestas, nuestro grupo de investigación está interesado en investigar los PAMs producidos por la interacción de la piel de las ranas con su microbiota natural. Creemos que estas mezclas naturales tienen un potencial antimicrobiano contra infecciones que involucran la salud humana. Para cumplir con el objetivo planteado para este trabajo, modificaremos la técnica de cultivo de micro-órganos de piel de ranas (SMOs) in vitro. Utilizaremos dos protocolos de SMOs, el primero incluirá un coctel de antibióticos para eliminar la microbiota de la piel de las ranas y obtener en el medio solo las moléculas secretadas por la rana. El segundo será realizado sin antibióticos para obtener todas las moléculas producidas tanto por la piel de las ranas como su microbiota. Finalmente, se identificarán péptidos antimicrobianos  obtenidos en cultivos, los cuales serán probados contra bacterias patógenas para los humanos.

    • Identification and Antimicrobial Activity of Peptides Derived from Frogs Skin and their Microbiota

      Duration: 36 months

      PR.6.2016.3388

      El rápido incremento de la resistencia de las bacterias a todas las clases de antibióticos disponibles es uno de los mayores problemas de salud pública a nivel mundial. En este sentido la búsqueda de nuevos compuestos antimicrobianos se ha intensificado especialmente la dirigida a encontrar moléculas de la naturaleza. La piel de los anfibios pueden generar grandes cantidades de péptidos antimicrobianos (PAM) de diferentes tamaños, estructuras y cargas que actúan en sinergia y a su vez regulando la microbiota de su piel. Descubrimientos recientes indican que los PAM producidos por la piel de las ranas y los metabolitos producidos por su microbiota son importantes para el desarrollo normal del animal. Los PAM de piel de rana presentan entre 11-46 aminoácidos de longitud, tienen carga catiónica, contienen una proporción significativa de residuos hidrofóbicos y son propensos  formar estructura de alfa hélice. El principal mecanismo de acción de estos péptidos es el rompimiento de la membrana bacteriana, pero también pueden atacar blancos intracelulares. Por otro lado, existen reportes que las comunidades bacterianas producen PAM, llamados bacteriocinas, y su producción ocurre en todos los grupos de Eubacterias y Arqueobacterias. Por ejemplo, en Escherichia coli se han reportado colicinas y bacteriocinas en el 50% de las cepas aisladas de hospederos humanos. Además para Pseudomonas aeruginosa se ha encontrado que el 90% de las cepas aisladas producen bacteriocinas. Teniendo en cuenta estos datos, es lógico pensar que las bacteriocinas tengan una función en comunidades microbianas como es el caso de la microbiota de la piel de ranas. Nuestra hipótesis es que tanto los PAMs producidos por la piel de las ranas como los producidos por las bacterias de  su microbiota actúan en sinergia para evitar la invasión de otras de cepas bacterianas patógenas. Por las razones anteriormente expuestas, nuestro grupo de investigación está interesado en investigar los PAMs producidos por la interacción de la piel de las ranas con su microbiota natural. Creemos que estas mezclas naturales tienen un potencial antimicrobiano contra infecciones que involucran la salud humana. Para cumplir con el objetivo planteado para este trabajo, modificaremos la técnica de cultivo de micro-órganos de piel de ranas (SMOs) in vitro. Utilizaremos dos protocolos de SMOs, el primero incluirá un coctel de antibióticos para eliminar la microbiota de la piel de las ranas y obtener en el medio solo las moléculas secretadas por la rana. El segundo será realizado sin antibióticos para obtener todas las moléculas producidas tanto por la piel de las ranas como su microbiota. Finalmente, se identificarán péptidos antimicrobianos  obtenidos en cultivos, los cuales serán probados contra bacterias patógenas para los humanos.

  • 2015
    • Actividad antimicrobiana de secreciones de piel de ranas y su relación con variables bioclimáticas: un estudio a nivel intra- e interespecies

      Duration: 24 months

      PR.6.2015.2644

      La piel de los anuros está encargada de la primera línea de defensa contra microorganismos patógenos. Se ha planteado que esto es posible mediante la secreción de cócteles de sustancias bioquímicas en la piel que tienen actividad antimicrobiana. El repertorio de sustancias secretadas puede variar mucho entre especies hermanas de ranas, inclusive, entre individuos de una misma especie. Sin embargo, es poca la información sobre si esta actividad antimicrobiana tiene alguna relación propiamente con el medio ambiente en el que se desarrolla cada especie de rana. Este proyecto se propone desarrollar dos preguntas de investigación. La primera, sobre microbiología, radica en la identificación y evaluación de actividad antimicrobiana de las secreciones de piel de varias especies de ranas. La segunda pregunta, sobre biología, radica en identificar si existe una relación entre esta actividad antimicrobiana con las variables bioclimáticas del lugar de origen de las ranas. Adicionalmente, serán realizados dos análisis: el primero a nivel interespecífico para identificar la relación de su correspondiente actividad antimicrobiana con el ambiente en que se desarrolla cada especie de rana. El segundo análisis, a nivel intraespecífico, será realizado con varios individuos de Hypsiboas crepitans. En donde se propone identificar la posible relación entre la variación de la actividad antimicrobiana entre poblaciones de una misma especie con el ambiente en que se desarrolla cada población.