Barbara Hanna Zimmermann

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Barbara Hanna Zimmermann

Barbara Hanna Zimmermann

Doctor Of Philosophy (Biological Chemistry)

bazimmer @uniandes.edu.co

Profesor Asociado

Departamento de Ciencias Biológicas

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  • 2024
    • BIOLOGÍA CELULAR-TEO

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      BIOQUÍMICA DE PROTEÍNAS

      First period
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.(2023). Laying the groundwork for protein-protein interaction experiments for Toxoplasma gondii Dihydroorotate Dehydrogenase: preparation and preliminary design.
Laying the groundwork for protein-protein interaction experiments for Toxoplasma gondii Dihydroorotate Dehydrogenase: preparation and preliminary design
Thesis
Zimmermann B.H. (2023)
New Insights into rice pyrimidine catabolic enzymes.
Article

Recent Degrees

Doctor Of Philosophy (Biological Chemistry)

Doctoral degree

University Of Michigan

1988

Estados Unidos

Recent Projects

  • 2020
    • Análisis de interacciones entre dihidroorotato deshidrogenasa y complejos respiratorios en Toxoplasma gondii

      Duration: 13 months

      PR.2.2020.8767

      Toxoplasma gondii es un parasito del filum Apicomplexa, su ciclo de vida es principalmente intracelular e infecta amplia variedad de hospederos, y tiene particular éxito infectando los homeotermos. Adicionalmente, tiene distribución mundial y se estima que aproximadamente un tercio de la población humana tiene una infección de tipo crónico. Ahora bien, los tratamientos existentes contra la toxoplasmosis con sulfadiazina y pirimetamina son efectivos contra infecciones agudas, pero tienen efectos secundarios adversos en la salud de los pacientes. Por otro lado, este tratamiento ha demostrado una efectividad limitada contra el estadio de quiste en infecciones crónicas. De acuerdo a lo anterior, alternativas terapéuticas son necesarias, razón por la cual es oportuno comprender mejor el metabolismo del parásito. Dentro de las rutas esenciales de T. gondii encontramos el metabolismo de pirimidinas. Las pirimidinas son componentes estructurales de diferentes biomoléculas fundamentales como los nucleótidos y ácidos nucleicos. La participación de las pirimidinas en procesos metabólicos como la síntesis de ADN y ARN hace que sean de especial interés en un patógeno como T. gondii. De hecho, algunos de los medicamentos utilizados para tratar infecciones de T. gondii y Plasmodium tienen como blanco pasos específicos en el metabolismo de pirimidinas. Las enzimas involucradas en la síntesis de novo de pirimidinas son determinantes en la replicación del parasito, por ejemplo, la enzima que cataliza el cuarto paso de la vía, la dihiidrorotato deshidrogenasa (DHODH). Esta enzima cataliza la oxidación del (s)-dihiroorotato a orotato. A su vez, cataliza la única reacción de tipo redox de la vía de novo y esta acoplada a la cadena respiratoria a través de transferencia de electrones. Estudios previos determinaron que la deleción del gen de DHODH en T.gondii (TgDHODH), con el propósito generar parásitos con auxotrofía por uracilo fue  únicamente posible cuando se utilizaba una versión catalíticamente deficiente de TgDHODH. Estos resultados sugieren que TgDHODH es esencial por dos razones; la generación de reservas esenciales de pirimidinas y una segunda  función mitocondrial  independiente de la actividad de la enzima hasta ahora desconocida. El objetivo del presente estudio es analizar si hay una interacción estructural entre  TgDHODH y los complejos de la membrana mitocondrial que pudiera explicar la posible función adicional de TgDHODH dentro de la replicación del parasito. En primer lugar, se realizará un aislamiento de la mitocondria a partir de taquizoitos de T. gondii, con el objetivo de realizar una electroforesis nativa para separar los complejos mitocondriales y poder determinar el tamaño del complejo que pudiera tener interacción con TgDHODH. Posteriormente, se correrá una segunda dimensión denaturante para identificar el tamaño de las proteínas presentes en el complejo posiblemente asociado a TgDHODH, la visualización de estas proteínas será a través de tinción de plata. En paralelo, a partir de parásitos transformados se producirá myc-tagged TgDHODH, con el propósito de aislar las proteínas en interacción física con TgDHODH a través de una resina anti-myc. Finalmente, la identificación de las proteínas aisladas se llevará a cabo utilizando secuenciación de aminoácidos. Estos resultados permitirán comprender el comportamiento de TgDHODH y de esta manera aportar información para el diseño de posibles tratamientos que puedan inhibir su función independiente de catálisis y de esta forma impedir la replicación del parásito

Courses

  • 2024
    • BIOLOGÍA CELULAR-TEO

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      BIOQUÍMICA DE PROTEÍNAS

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  • 2023
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  • 2017
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  • 2016
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      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

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  • 2014
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      Bachelor Level

Products

.(2023). Laying the groundwork for protein-protein interaction experiments for Toxoplasma gondii Dihydroorotate Dehydrogenase: preparation and preliminary design.
Laying the groundwork for protein-protein interaction experiments for Toxoplasma gondii Dihydroorotate Dehydrogenase: preparation and preliminary design
Thesis
Zimmermann B.H. (2023)
New Insights into rice pyrimidine catabolic enzymes.
Article
.(2022). Ensayo de clonación de la proteína dihidropirimidina deshidrogenasa (DHPD) de papa en el vector pGBKT7.
Ensayo de clonación de la proteína dihidropirimidina deshidrogenasa (DHPD) de papa en el vector pGBKT7
Thesis
.(2022). Ensayo de la Proteasa 3C de rhinovirus humano para el clivaje del rótulo de histidina de proteínas como dihidroorotato deshidrogenasa (DHODH) de toxoplasma gondii.
Ensayo de la Proteasa 3C de rhinovirus humano para el clivaje del rótulo de histidina de proteínas como dihidroorotato deshidrogenasa (DHODH) de toxoplasma gondii
Thesis
.(2022). Primeros pasos hacia la técnica de doble híbrido para detección de posibles interacciones de la Dihidroorotato Deshidrogenasa de Toxoplasma gondii: clonación en pGBKT7.
Primeros pasos hacia la técnica de doble híbrido para detección de posibles interacciones de la Dihidroorotato Deshidrogenasa de Toxoplasma gondii: clonación en pGBKT7
Thesis
Barrera C, Urbina A, Zimmermann B.H.(2021).
Does Toxoplasma gondii dihydroorotate dehydrogenase interact with other mitochondrial membrane proteins?, 32nd Molecular Parasitology Meeting, Woodshole, USA, Oct. 5 - 9, 2021. Poster
Event
Calle V .(2021). Efecto sinérgico de la modificación genética e inmovilización de enzimas microbianas en la cinética de procesamiento de alimentos.
Efecto sinérgico de la modificación genética e inmovilización de enzimas microbianas en la cinética de procesamiento de alimentos
Thesis
Urbina A .(2020). MECANISMOS DE RESISTENCIA DE TOXOPLASMA GONDII A FÁRMACOS ANTIPARASITARIOS Y SU PAPEL EN LA BÚSQUEDA DE TRATAMIENTOS EFECTIVOS.
MECANISMOS DE RESISTENCIA DE TOXOPLASMA GONDII A FÁRMACOS ANTIPARASITARIOS Y SU PAPEL EN LA BÚSQUEDA DE TRATAMIENTOS EFECTIVOS
Thesis
Zimmermann B.H.(2019).
Exploring possible interactions of dihydroorotate dehydrogenase with respiratory complexes in Toxoplasma gondii. International Toxoplasma Congress (Toxo XV), June 19 – 21, 2019, Quimbaya, Quindio, Colombia, Poster
Event
Galeano P, Zimmermann B.H, Carazzone C. (2019)
Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography Coupled to Mass Spectrometry and Multivariate Analysis of the De Novo Pyrimidine Pathway Metabolites
Biomolecules (ISSN 2218-273X)
Article
Garavito M.F, Narvaez H, Pulido D, Loffler M, Judelson H, Restrepo S, Zimmermann B.H. (2019)
Phytophthora infestans Dihydroorotate Dehydrogenase Is a Potential Target for Chemical Control - A Comparison With the Enzyme From Solanum tuberosum
Frontiers in Microbiology (ISSN 1664-302X)
Article
Barrera C .(2019). Technique development for the analysis of possible interactions between Dihydrorotate Dehydrogenase and mitochondrial complexes in Toxoplasma gondii..
Technique development for the analysis of possible interactions between Dihydrorotate Dehydrogenase and mitochondrial complexes in Toxoplasma gondii.
Thesis
Narvaez H, Lopez A, Gupta N, Zimmermann B.H. (2018)
A CTP synthase undergoing stage-specific spatial expression is essential for the survival of the intracellular parasite Toxoplasma gondii
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (ISSN 2235-2988)
Article
Rincon M, Lopez A, Narvaez H, Zimmermann B.H.(2018).
Catabolismo de Pirimidinas en Oryza sativa: Evaluando su Importancia Bajo Condiciones de Estrés Salino, III Congreso Colombiano de Bioquímica y Biología, November 1 – 3, 2018, Bogotá, Colombia, Poster
Event
Rincon M, Narvaez H, Lopez A, Zimmermann B.H. (2018)
Characterization of the Pyrimidine Catabolic Pathway of Oryza sativa
Annual Meeting of Amer-Assoc-of-Anatomists (AAA), Amer-Physiol-Soc (APS), Amer-Soc-for-Biochemistry-and-Mol-Biol (ASBMB), Amer-Soc-for-Investigat-Pathol (ASIP), Amer-Soc-for-Pharmacol-and-Experimental-Therapeut (ASPET) on Experimental Biology (EB)
Inproceeding
Rincon M, Lopez A, Narvaez H, Zimmermann B.H.(2018).
Pyrimidine degradation in rice - protection against abiotic stress? - characteration of the pyrimidine catabolic pathway of Oryza sativa, Joint 26th International Conference on Arginine and Pyrimidine & 1st International Conference on Amino Acids and Nucleotides. July 4 – 7, 2018, Shanghai, China, Oral Presentation
Event
Gutierrez N .(2017). Oryzalin but not Itraconazole disrupts CTP synthase localization in some Toxoplasma gondii tachyzoites..
Oryzalin but not Itraconazole disrupts CTP synthase localization in some Toxoplasma gondii tachyzoites.
Thesis
Pulido D .(2016). Assessment of Solanum tuberosum and Phytophthora infestans dihydroorotate dehydrogenase enzyme as an alternative target to control late blight..
Assessment of Solanum tuberosum and Phytophthora infestans dihydroorotate dehydrogenase enzyme as an alternative target to control late blight.
Thesis
Zimmermann B.H.
Caracterización de la via de catabolismo de pirimidinas en plantas y evaluación preliminar de su participación en estrés abiótico
Universidad de Los Andes/Colciencias.
Proposal
Tavera H .(2016). Clonacion de Uridin Kinasa/Uracil Fosforribosiltransferasa de Solanum tuberosum.
Clonacion de Uridin Kinasa/Uracil Fosforribosiltransferasa de Solanum tuberosum
Thesis
Galeano P, Garavito M.F, Zimmermann B.H, Carazzone C.(2016).
LC-MS/MS PROFILING OF THE INTERMEDIARIES OF de novo PYRIMIDINE BIOSYNTHESIS IN LEAVES OF Solanum lycopersicum PLANTS, 21st International Mass Spectrometry Conference, August 20 – 26, 2016, Toronto, Canada. Poster
Event
Galeano P, Carazzone C, Garavito M.F, Zimmermann B.H.(2016).
LC-MS/MS analysis of compounds involved in De Novo pyrimidine biosynthesis in Solanum lycopersicum
Event
Hortua M, Cajiao D, Zimmermann B.H, Fox B, Bzik D. (2016)
Pyrimidine pathway-dependent and -independent functions of the Toxoplasma gondii mitochondrial dihydroorotate dehydrogenase
INFECTION AND IMMUNITY (ISSN 0019-9567)
Article
Pulido D, Garavito M.F, Judelson H, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2016).
Solanum tuberosum and Phytophthora infestans dihydroorotate dehydrogenase as an alternative target to control late blight. ICAP 2016, July 6-9, 2016, Granada, Spain, Poster Presentation
Event
Narvaez H, Lopez A, Zimmermann B.H.(2016).
The glutaminase inhibitor DON exhibits a strong anti-Toxoplasma activity in vitro. 25th International Conference on Arginine and Pyrimidines (ICAP 2016), Granada (Spain) July 6-9, 2016. Oral presentation.
Event
Prieto K, Garavito M.F, Danies G, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2016).
Uracil phosphoribosyltransferase (UPRT) salvages uracil during hyphal growth of Phytophthora infestans, Canadian Society of Microbiologists Annual Conference. (Toronto, Canada, June 12 -15, 2016). Poster
Event
Lopez A .(2015). Biochemical characterization of cytidine triphosphate synthase (CTPase) from Toxoplasma gondii..
Biochemical characterization of cytidine triphosphate synthase (CTPase) from Toxoplasma gondii.
Thesis
Narvaez H .(2015). Deciphering the role of cytidine triphosphate synthase (TgCTP) in the parasite Toxoplasma gondii.
Deciphering the role of cytidine triphosphate synthase (TgCTP) in the parasite Toxoplasma gondii
Thesis
Narvaez H, Zimmermann B.H.(2015).
Exploring the dual role of CTP synthase in Toxoplasma gondii.13th International Congress on Toxoplasmosis, June 17 – 21, 2015, Gettysburg, PA, USA. Poster Presentation
Event
Tenjo F .(2015). Potential Targets against Late Blight: the Case of Uridine Monophosphate Synthase.
Potential Targets against Late Blight: the Case of Uridine Monophosphate Synthase
Thesis
Garavito M.F, Narvaez H, Zimmermann B.H. (2015)
Pyrimidine Metabolism: Dynamic and Versatile Pathways in Pathogens and Cellular Development
Journal of Genetics and Genomics (ISSN 1673-8527)
Article
Lopez A, Narvaez H, Zimmermann B.H.(2015).
Pyrimidine catabolism in abiotic stress tolerance in Oryza sativa L.: Preliminary characterization of pathway enzymes, 16th International Symposium on Purine and Pyrimidine Metabolism in Man, June 6 – 9, 2015, Columbia University, New York, NY, USA. Oral Presentation.
Event
Prieto K, Garavito M.F, Vasquez J. J., Zimmermann B.H, Restrepo S. (2015)
Pyrimidine salvage by Uracil Phosphoribosyltransferase (UPRT) of Phytophthora infestans in late blight disease in Solanum tuberosum
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F, Loffler M, Judelson H, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2015).
Targeting the pyrimidine metabolism in a devastating plant pathogen
Event
Tenjo F. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2015).
Uridine Monophosphate Synthase: Architecture Versatility in the Service of Late Blight Control.
Event
Narvaez H, Zimmermann B.H.(2014).
25th Annual Molecular Parasitology Meeting, WoodsHole, MA
Event
Primrose D .(2014). Antigenicity of peptides from the protein ROP18, a virulence factor in Toxoplasma gondii..
Antigenicity of peptides from the protein ROP18, a virulence factor in Toxoplasma gondii.
Thesis
Bello J .(2014). Biochemical characterization of Aspartate Transcarbamoylases and Dihydroorotases from Phytophthora infestans and Solanum tuberosum: looking for targets to control late blight disease.
Biochemical characterization of Aspartate Transcarbamoylases and Dihydroorotases from Phytophthora infestans and Solanum tuberosum: looking for targets to control late blight disease
Thesis
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2014).
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Event
Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Lozano G, Vasquez J. J., Myers K, Fry W. E., Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2014)
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Gene (ISSN 0378-1119)
Article
Narvaez H, Gupta N, Zimmermann B.H.(2014).
Deciphering the role of TgCTP in Toxoplasma gondii- ICAP 2014
Event
Lopez A, Pulido D, Narvaez H, Zimmermann B.H.(2014).
Dyhydropyrimidine dehydrogenase and dihydroorotate dehydrogenase: Insights into function in Oryza sativa L.
Event
Tenjo F, Bello J, Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2014)
Evaluación de una posible regulación metabólica en la biosíntesis de pirimidinas en el patosistema de Phytophthora infestans y Solanum tuberosum
ACTUALIDADES BIOLOGICAS (ISSN 0304-3584)
Article
Tenjo F. J., Bello J, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Garavito M.F, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2014).
Evaluation of a Possible Metabolic Regulation in Pyrimidine Biosynthesis in Phytophthora infestans and Solanum tuberosum: the case of Aspartate Transcarbamoylase and Uridine Monophosphate Synthase
Event
Narvaez H, Gupta N, Zimmermann B.H.(2014).
Exploring the dynamics of location and function of Cytidine 5'‐triphosphate synthase from Toxoplasma gondii
Event
Lopez A, Narvaez H, Zimmermann B.H.(2014).
Insight into the role of Cytidine Triphosphate Synthase in Toxoplasma gondii: evaluation of protein-protein interactions
Event
Garavito M.F, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2014).
Pyrimidine salvage pathways: Uracil Phosphoribosyltransferases of Phytophthora infestans and Solanum tuberosum
Event
Restrepo S, Garavito M.F, Zimmermann B.H.(2014).
Ruta de síntesis de pirimidinas: ¿el talon de Aquiles de los protistas?
Event
Tibabuzo A. M., Ocampo J, Zimmermann B.H, Leidy C, Carazzone C, Meesters R.(2013).
A proteomics screening method for the identification of antimicrobial active molecules in Colombian snake venom
Event
Bello J, Tenjo F. J., Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S, Garavito M.F.(2013).
Cloning and expression of the pyrimidine enzymes aspartate transcarbamoylase and uridine synthase of an oomycete plant pathogen
Event
Narvaez H, Zimmermann B.H.(2013).
Deciphering the role of TgCTPase in Toxoplasma gondii: from pyrimidines metabolism to the polymer formation
Event
Lopez A, Narvaez H, Quevedo L, Zimmermann B.H.(2013).
Expression and preliminary characterization of dihydroorotate dehydrogenase and dihydropyrimidine dehydrogenase from Oryza sativa
Event
Cajiao D, Ramon-Maiques S, Zimmermann B.H.(2013).
Expression, purification and preliminary crystallization studies of the Toxoplasma gondii dihydroorotate dehydrogenase
Event
Tibabuzo A. M., Ocampo H, Zimmermann B.H, Leidy C. (2013)
Phospholipase A2 Activity and Substrate Specificity of Bothrops Asper and Crotalus Durissus Cumanensis Snake Venom Collected from the Guajira Region of Colombia
57th Annual Meeting
Inproceeding
Uribe J .(2013). Tamizaje selectivo en Colombia para desordenes del metabolismo lisosomal.
Tamizaje selectivo en Colombia para desordenes del metabolismo lisosomal
Thesis
Hortua M, Cajiao D, Zimmermann B.H, Fox B, Bzik D.(2013).
Toxoplasma gondii dihydroorotate dehydrogenase: Potential functions beyond pyrimidine synthesis
Event
Tibabuzo A, Ocampo J, Zimmermann B.H, Leidy C. (2012)
A novel fluorometric assay for phospholipases A2 from the Colombian snakes Botrhops asper and Crotalus cumanenses
Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology (ISSN 0041-0101)
Article
Hortua M, Huynh M, Garavito M.F, Fox B, Bzik D, Carruthers V, Loffler M, Zimmermann B.H. (2012)
Biochemical and molecular characterization of the pyrimidine biosynthetic enzyme dihydroorotate dehydrogenase from Toxoplasma gondii
Molecular and Biochemical Parasitology (ISSN 0166-6851)
Article
Bello J, Tenjo F. J., Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2012).
Cloning and Expression of the pyrimidine enzymes uridine monophosphate synthetase (UMP) and aspartate carbamoyltransferase (ATC) of an Oomycete
Event
Lopez A, Narvaez H, Becerra L. F., Zimmermann B.H.(2012).
Cloning and expression of dihydropyrimidine dehydrogenase from Oryza sativa
Event
Lozano G, Narvaez H, Rocha M, Zimmermann B.H.(2012).
Insights on the last two enzymes of de novo pyrimidine biosynthesis, orotate phosphoribosyltransferase and orotidine 5’ monophosphate decarboxylase, of Toxoplasma gondii
Event
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2012).
Metabolismo de pirimidinas en Phytophthora infestans: Búsqueda de estrategias comunes para el control de patógenos Oomycetes como Phytophthora infestans basados en los blancos para el control de parásitos apicomplexa.
Event
Tibabuzo A .(2012). Physicochemical factors influencing snake venom phospholipase activity from Bothrops asper and Crotalus durissus cumanensis from Colombia..
Physicochemical factors influencing snake venom phospholipase activity from Bothrops asper and Crotalus durissus cumanensis from Colombia.
Thesis
Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2012).
Preliminary biochemical characterization of the pyrimidine salvage pathway enzyme uracil phosphoribosyltransferase in the plant pathogen Phytophthora infestans and its host Solanum tuberosum
Event
Narvaez H, Zimmermann B.H.(2012).
Preliminary characterization of the antiparasitic target cytidine triphosphate synthase: exploring its possible structural role in Toxoplasma gondii
Event
Narvaez H, Lozano G, Handelsman J, Zimmermann B.H.(2012).
Preliminary characterization of the cytidine triphosphate synthase: Contrast between CTPs isolated from a halophilic environment and from the parasite Toxoplasma gondii.
Event
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2012).
Pyrimidine metabolism in Phytophthora infestans: new control strategies based on targets used to control apicomplexan parasites
Event
Juez G, Hortua M, Zimmermann B.H.(2011).
Aislación de una nueva cepa avirulenta de Toxoplasma gondii nativa de Colombia
Event
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2011).
Biochemical characterization of recombinant Dihydroorotate dehydrogenase from the plant pathogenic Oomycete Phytophthora infestans
Event
Garavito M.F, Hortua M, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2011).
Common strategies for controlling human Apicomplexan parasites and agricultural Oomycete pathogens such as Phytophthora infestans
Event
Hortua M, Huynh M, Garavito M.F, Carruthers V, Fox B, Bzik D, Loffler M, Zimmermann B.H. (2011)
Dihydroorotate dehydrogenase as potential drug target against toxoplasmosis
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Primrose D, Zimmermann B.H. (2011)
Evaluation of the possible antigenic activity of ROP18 from Toxoplasma gondii
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Hortua M, Loffler M, Huynh M, Carruther V, Zimmermann B.H.(2011).
Kinetic characterization and inhibition of a mitochondrial dihydroorotate dehydrogenase from Toxoplasma gondii,
Event
Narvaez H, Lozano G, Zimmermann B.H. (2011)
Orotidine 5’-monophosphate decarboxylase of Toxoplasma gondii: Cloning and identification of different alternative splicing pattern
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Zimmermann B.H, Narvaez H. (2011)
Preliminary characterization of the antiparasitic target cytidine triphosphate synthase from Toxoplasma gondii
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Narvaez H, Zimmermann B.H.(2011).
Preliminary characterization of the antiparasitic target cytidine triphosphate synthase from Toxoplasma gondii 11th International Congress on Toxoplasmosis
Event
Rocha M, Camargo E, Lozano G, Primrose D, Zimmermann B.H.(2011).
Preliminary kinetic characterizations of recombinant aspartate transcarbamoylase, dihydroorotase and orotate phosphoribosyl transferase from Toxoplasma gondii.
Event
Hortua M, Lozano G, Narvaez H, Rocha M, Camargo E. A., Garavito M.F, Zimmermann B.H. (2011)
Pyrimidine biosynthesis in Toxoplasma gondii
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Campos J, Hortua M, Zimmermann B.H.(2011).
Seroprevalencia de Toxoplasma gondii en ganado porcino provenientes de dos frigoríficos de Bogotá durante el 2008 y el 2010
Event
Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2011).
Uracil Phosphoribosyltransferase inhibition as a complementary target for Phytophthora infestans control
Event
Zimmermann B.H, Rocha M, Garavito M.F, Hortua M. (2010)
Clonación y expresión de la dihidroorotasa de Toxoplasma gondii en el vecto pET-19b
Infectio (ISBN 0123-9392)
Inproceeding
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2010).
Dihydroorotate dehydrogenase from the phytopathogenic Oomycete Phytophthora infestans as a novel target for crop control.
Event
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2010)
Expression and homology modeling of Dihydroorotate dehydrogenase from the phytopathogenic Oomycete Phytophthora infestans
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Hortua M, Loffler M, Zimmermann B.H.(2010).
Kinetic characterization of dihydroorotate dehydrogenase from Toxoplasma gondii.
Event
Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2010).
Orotate phosphoribosyl transferase and orotidine-5-monophosphate decarboxylase as targets for control of Phytophthora infestans.
Event
Narvaez H, Zimmermann B.H.(2010).
Preliminary characterization of antiparasitic target Cytidine triphosphate synthase from Toxoplasma gondii
Event
Lozano G, Zimmermann B.H.(2010).
Preliminary studies of Orotate Phosphorybosyltransferase and Orotidine 5’-monophosphate descarboxilase from Toxoplasma gondi
Event
Camargo E, Rocha M, Hortua M, Zimmermann B.H.(2010).
Subcloning and expression of aspartate transcarbamoylase y dihydroorotase from Toxoplasma gondii: First steps toward inhibition assays.
Event
Camargo E. A., Rocha M, Hortua M, Zimmermann B.H.(2010).
Subcloning and expression of recombinant Dihydroorotase of Toxoplasma gondii in the plasmid pET-19b. First steps towards inhibition assays.
Event
Rocha M, Zimmermann B.H.(2010).
Subcloning and expression of recombinant Dihydroorotase of Toxoplasma gondii in the plasmid pET-19b. First steps towards inhibition assays. Molecular Parasitology Meeting XXI
Event
Garavito M.F, Hortua M, Zimmermann B.H. (2009)
Caracterizacion bioinformatica de la secuencia de la dihidrorotato deshidrogenasa de Toxoplasma gondii y primer acercamiento a su localizacion celular
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Narvaez H, Primrose D, Rocha M, Zimmermann B.H. (2009)
Caracterización de ROP18 de cepa colombiana (PC117) y su posible interacción con el sistema inmune del huésped
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Lozano G, Restrepo S, Zimmermann B.H. (2009)
Clonación, expresión y caracterización bioinformática de la enzima orotato fosforibosiltransferasa (OPRTasa) de Toxoplasma gondii
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Restrepo S, Zimmermann B.H. (2009)
Estrategias comunes para controlar patógenos Oomicetes como Phytophthora infestans basados en el modelo Apicomplexa Toxoplasma gondii
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Lozano G, Zimmermann B.H. (2009)
Estudios preliminares de las enzimas orotato-fosforibosil-transferasa y orotidina 5’-monofosfato descarboxilasa de Toxoplasma gondii
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2009)
First approach to the characterization of de novo pyrimidine biosyntheis pathway in Phytophthora infestans as a target for pathogen control
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Lozano G, Rocha M, Zimmermann B.H.(2009).
Phosphorybosyltransferase and Orotidine 5’-monophosphate descarboxylase from Toxoplasma gondi
Event
Zimmermann B.H, Campos J. (2009)
Prevalencia de Toxoplasma gondii en ganado porcino proveniente de un frigorifico de Bogota
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Hortua M, Garavito M.F, Carruther V, Huynh M, Zimmermann B.H. (2009)
Resultados Preliminares de la Localización Inusual de Dihidrootorato Deshidrogenasa en Toxoplasma gondii
Biomedica (ISSN 0120-4157)
Article
Hortua M, Garavito M.F, Huynh M, Carruthers V, Zimmermann B.H.(2009).
Toxoplasma gondii dihydroorotate dehydrogenase and its possible unusual intracellular localization - 10th International Congress on Toxoplasmosis
Event
Garavito M.F, Hortua M, Lozano G, Zimmermann B.H. (2009)
Toxoplasma gondii: 100 años de Historia
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Article
Botina B, Zimmermann B.H, Vanegas M. (2008)
Caracterización preliminar de compuestos antilisteriales producidos por bacterias acidolácticas nativas
Revista MVZ Cordoba (ISSN 0122-0268)
Article
Lozano G, Garavito M.F, Zimmermann B.H.(2008).
Cloning of Orotate phosphoribosyltransferase from Toxoplasma gondii.
Event
Hortua M, Huynh M, Garavito M.F, Carruthers V, Zimmermann B.H.(2008).
Didydroorotate dehydrogenase from Toxoplasma gondii and its unusual intracellular localization.
Event
Garavito M.F, Becerra L, Camposvillarraga J, Chamat X, Hernndezroldan A, Hortua M, Lozano G, Primrose D, Zimmermann B.H.(2008).
Selection of epitopes of ROP18 for possible Typification of Toxoplasma gondii.
Event
Hortua M, Garavito M.F, Serrano R, Zimmermann B.H.(2007).
Immunolocalization of the pyrimidine biosynthetic enzymes dihydroorotase and dihydroorotate dehydrogenase in tachyzoites of Toxoplasma gondii
Event
Hortua M, Cardenas S, Juez G, Garavito M.F, Zimmermann B.H. (2007)
Seroprevalence of Toxoplasma gondii in pregnant patients from a large public hospital in Bogota, Colombia
Infectio  (ISSN 0123-9392)
Article
Robles-Lopez S.M., Hortua M, Zimmermann B.H. (2006)
Cloning and preliminary characterization of the dihydroorotase from Toxoplasma gondii
Molecular and Biochemical Parasitology (ISSN 0166-6851)
Article
Sierra M, Zimmermann B.H. (2003)
Cloning and expression of the dihydroorotate dehydrogenase from Toxoplasma gondii
Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Basis of Disease (ISSN 0925-4439)
Article
Mejias I, Zimmermann B.H. (2002)
Molecular cloning, recombinant expression and partial characterization of the aspartate transcarbamoylase from Toxoplasma gondii
Molecular and Biochemical Parasitology (ISSN 0166-6851)
Article
Gómez S, Mateus A, Hernández J, Zimmermann B.H. (2000)
Recombinant Cry3Aa has insecticidal activity against the Andean potato weevil, Premnotrypes vorax
Biochemical and Biophysical Research Communications (ISSN 0006-291X)
Article
Mejias I, Zimmermann B.H. (1998)
Cloning and expression of an aspartate trans car ba my läse sequence from toxoplasma gondii
FASEB Journal (ISSN 0892-6638)
Article
Sierra M, Zimmermann B.H. (1998)
Cloning of the dihydroo rotate dehydrogenase of toxoplasma gondil
FASEB Journal (ISSN 0892-6638)
Article
Zimmermann B.H, Kemling N, Evans D. (1995)
Function of conserved histidine residues in mammalian dihydroorotase
Biochemistry (ISSN 0006-2960)
Article
Keightley J, Zimmermann B.H, Mather M, Springer P, Pastuszyn A, Lawrence D, Fee J. (1995)
Molecular genetic and protein chemical characterization of the cytochrome ba3 from Thermus thermophilus HB8
Journal of Biological Chemistry (ISSN 0021-9258)
Article
Simmer J, Kelly R, Rinker A, Zimmermann B.H, Scully J, Kim H, Evans D. (1990)
Mammalian dihydroorotase: Nucleotide sequence, peptide sequences, and evolution of the dihydroorotase domain of the multifunctional protein CAD
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (ISSN 0027-8424)
Article
Zimmermann B.H, Nitsche C, Fee J, Rusnak F, Munck E. (1988)
Properties of a copper-containing cytochrome ba3: a second terminal oxidase from the extreme thermophile Thermus thermophilus.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (ISSN 0027-8424)
Article
Rusnak F, Munck E, Nitsche C, Zimmermann B.H, Fee J. (1987)
Evidence for structural heterogeneities and a study of exchange coupling. Mössbauer studies of cytochrome c1aa3 from Thermus thermophilus.
Journal of Biological Chemistry (ISSN 0021-9258)
Article
Hetey L, Zimmermann B.H. (1986)
Characterization of the synaptosomal high-affinity uptake of noradrenaline in the nucleus accumbens of rats
Biomedica Biochimica Acta (ISSN 0232-766X)
Article
Kuhnz W, Zimmermann B.H, Nau H. (1985)
Improved separation of phospholipids by high-performance liquid chromatography
Article
Zimmermann B.H, Fee J. (1985)
Observations on the peroxo complexes of cytochrome c1aa3 from Thermus thermophilus
Federation Proceedings (ISSN 0014-9446)
Article

Degrees

  • Doctor Of Philosophy (Biological Chemistry)

    Doctoral degree

    University Of Michigan

    1988

    Estados Unidos

Projects

  • 2020
    • Análisis de interacciones entre dihidroorotato deshidrogenasa y complejos respiratorios en Toxoplasma gondii

      Duration: 13 months

      PR.2.2020.8767

      Toxoplasma gondii es un parasito del filum Apicomplexa, su ciclo de vida es principalmente intracelular e infecta amplia variedad de hospederos, y tiene particular éxito infectando los homeotermos. Adicionalmente, tiene distribución mundial y se estima que aproximadamente un tercio de la población humana tiene una infección de tipo crónico. Ahora bien, los tratamientos existentes contra la toxoplasmosis con sulfadiazina y pirimetamina son efectivos contra infecciones agudas, pero tienen efectos secundarios adversos en la salud de los pacientes. Por otro lado, este tratamiento ha demostrado una efectividad limitada contra el estadio de quiste en infecciones crónicas. De acuerdo a lo anterior, alternativas terapéuticas son necesarias, razón por la cual es oportuno comprender mejor el metabolismo del parásito. Dentro de las rutas esenciales de T. gondii encontramos el metabolismo de pirimidinas. Las pirimidinas son componentes estructurales de diferentes biomoléculas fundamentales como los nucleótidos y ácidos nucleicos. La participación de las pirimidinas en procesos metabólicos como la síntesis de ADN y ARN hace que sean de especial interés en un patógeno como T. gondii. De hecho, algunos de los medicamentos utilizados para tratar infecciones de T. gondii y Plasmodium tienen como blanco pasos específicos en el metabolismo de pirimidinas. Las enzimas involucradas en la síntesis de novo de pirimidinas son determinantes en la replicación del parasito, por ejemplo, la enzima que cataliza el cuarto paso de la vía, la dihiidrorotato deshidrogenasa (DHODH). Esta enzima cataliza la oxidación del (s)-dihiroorotato a orotato. A su vez, cataliza la única reacción de tipo redox de la vía de novo y esta acoplada a la cadena respiratoria a través de transferencia de electrones. Estudios previos determinaron que la deleción del gen de DHODH en T.gondii (TgDHODH), con el propósito generar parásitos con auxotrofía por uracilo fue  únicamente posible cuando se utilizaba una versión catalíticamente deficiente de TgDHODH. Estos resultados sugieren que TgDHODH es esencial por dos razones; la generación de reservas esenciales de pirimidinas y una segunda  función mitocondrial  independiente de la actividad de la enzima hasta ahora desconocida. El objetivo del presente estudio es analizar si hay una interacción estructural entre  TgDHODH y los complejos de la membrana mitocondrial que pudiera explicar la posible función adicional de TgDHODH dentro de la replicación del parasito. En primer lugar, se realizará un aislamiento de la mitocondria a partir de taquizoitos de T. gondii, con el objetivo de realizar una electroforesis nativa para separar los complejos mitocondriales y poder determinar el tamaño del complejo que pudiera tener interacción con TgDHODH. Posteriormente, se correrá una segunda dimensión denaturante para identificar el tamaño de las proteínas presentes en el complejo posiblemente asociado a TgDHODH, la visualización de estas proteínas será a través de tinción de plata. En paralelo, a partir de parásitos transformados se producirá myc-tagged TgDHODH, con el propósito de aislar las proteínas en interacción física con TgDHODH a través de una resina anti-myc. Finalmente, la identificación de las proteínas aisladas se llevará a cabo utilizando secuenciación de aminoácidos. Estos resultados permitirán comprender el comportamiento de TgDHODH y de esta manera aportar información para el diseño de posibles tratamientos que puedan inhibir su función independiente de catálisis y de esta forma impedir la replicación del parásito