Andres Link Ospina

Los mamíferos juegan un papel clave en el mantenimiento y regeneración de los bosques a través de procesos como dispersión de semillas, polinización, folivoría y frugivoría (Fleming & Sosa 1994). En Colombia se registran 528 especies de mamíferos, cifra que se ha incrementado durante la última década a partir de revisiones sistemáticas o adiciones de nuevas localidades de distribución (Solari et al, 2013; Ramírez-Chaves & Suarez-Castro, 2014; Ramírez-Chaves et al, 2016; Ramírez-Chaves et al, 2021). El incremento ha sido mayor para murciélagos (orden Chiroptera), grupo que actualmente cuenta con el número más alto de especies de mamíferos registradas en Colombia con un total de 209 especies (Ramírez-Chaves et al, 2021). Sin embargo, el uso de nuevas técnicas y exploraciones de campo realizadas por diferentes investigadores han generado gran cantidad de conocimiento para otros grupos, por lo que es necesario sintetizar la información de manera constante para que esté disponible a aquellos involucrados en estudiar y conservar la biodiversidad del país (Ramírez-Chaves & Suarez-Castro, 2014).A pesar de la falta de inventarios biológicos detallados, existe evidencia que sugiere que la diversidad biológica en el territorio colombiano se concentra principalmente en el área de piedemonte y en las estribaciones inferiores de las cordilleras. La mayor parte de la superficie del país corresponde a llanuras bajas situadas por debajo de los 500 m.s.n.m. pero, a grandes rasgos, el país puede dividirse en dos regiones: una región transinterandina, que incluye tres cordilleras andinas, los valles interandinos y las fajas litorales caribeña y pacífica, y una segunda región Cisandina que abarca las llanuras de La Orinoquia, La Amazonia y la Sierra de La Macarena (Hernández et al., 1992). A pesar de ser una región potencialmente megadiversa se conoce muy poco acerca de la biota de sus ecosistemas, por lo que resulta fundamental motivar y realizar inventarios y estudios de biodiversidad. Es necesario tener en cuenta que estos ecosistemas han sido seriamente afectados por la expansión de fronteras agrícolas y el establecimiento de cultivos ilícitos (Mosquera et al., 2007), así como por la actividad minera en muchas regiones que ha tenido un efecto devastador sobre fauna, flora, ríos y suelos (López, 2015).Actualmente el Museo de Historia Natural C.J. Marinkelle de la Universidad de los Andes se encuentra registrado ante el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, con número de registro 158 y acrónimo ANDES. Por su parte, la colección de Mamíferos (ANDES-M) cuenta con especímenes recolectados desde 1945, donde gran parte del material proviene de investigaciones del profesor C. J. Marinkelle (García-R, 2020; García-R & Cano-Cobos, 2020). La colección recibe material proveniente principalmente de investigaciones realizadas por laboratorios y grupos de investigación del Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad de los Andes y, en menor medida, a partir de salidas de campo de cursos de pregrado. Para el mes de febrero de 2024 el número de ejemplares catalogados asciende a 2738, los cuales se encuentran preservados en alcohol al 75% (Preparación de tipo Ejemplar completo, Ejemplar con cráneo extraído y Fetos) y en seco (Piel plana, Piel rellena, Cráneo y Esqueleto) (García-R & Cano-Cobos, 2020).El presente proyecto aportará al conocimiento de la riqueza y estructura genética de mamíferos en diferentes regiones biogeográficas que ocurren en Colombia y al crecimiento de las colecciones del Museo de Historia Natural C.J Marinkelle de la Universidad de los Andes. Paralelamente, los estudiantes de diferentes programas de pregrado y posgrado de la Universidad de los Andes aprenderán técnicas de recolección, preservación e identificación para diferentes grupos taxonómicos, así como a proporcionar datos de buena calidad que puedan ser utilizados en el futuro.

Cebus capucinus curtus representa la única especie de primate arbóreo presente en el sistema insular Gorgona, pero a pesar de su potencial aporte en el mantenimiento de la comunidad de plantas, y a ser un atractivo ecoturístico por su particular carisma, se conoce poco sobre el estado actual de su población y sobre su origen en la isla. En el 2012 se realizó una investigación sobre el estado poblacional y uso de hábitat de los monos en la Isla Gorgona, en dicho estudio se registró la mayor densidad de la especie en todo su rango de distribución geográfica, lo que refleja la influencia de esta especie en el VOC Selva húmeda tropical. Actualmente se pretende realizar una Investigación conjunta entre la Universidad de los Andes, la Fundación Proyecto Primates Colombia y Parques Nacionales Naturales relacionada con aspectos sobre genética del mono cariblanco Cebus capucinus curtus presente en el PNNG. Se tomarán muestras fecales (método de recolección no invasivo) y se analizarán en el Laboratorio de Ecología de Bosques Tropicales y Primatología de la Universidad de los Andes. El análisis nos permitirá conocer el origen de los monos cariblancos en la isla Gorgona y responder preguntas sobre la variabilidad genética de la población, biogeografía de islas y efecto fundador. Los resultados y la recopilación de datos cubrirán vacíos de información existentes sobre los monos cariblanco en el AP, y sentarán una base para futuras colaboraciones y proyectos sobre estos primates en la isla.

Los mamíferos juegan un papel clave en el mantenimiento y regeneración de los bosques a través de procesos como dispersión de semillas, polinización, folivoría y frugivoría (Fleming & Sosa 1994). En Colombia se registran 528 especies de mamíferos, cifra que se ha incrementado durante la última década a partir de revisiones sistemáticas o adiciones de nuevas localidades de distribución (Solari et al, 2013; Ramírez-Chaves & Suarez-Castro, 2014; Ramírez-Chaves et al, 2016; Ramírez-Chaves et al, 2021). El incremento ha sido mayor para murciélagos (orden Chiroptera), grupo que actualmente cuenta con el número más alto de especies de mamíferos registradas en Colombia con un total de 209 especies (Ramírez-Chaves et al, 2021). Sin embargo, el uso de nuevas técnicas y exploraciones de campo realizadas por diferentes investigadores han generado gran cantidad de conocimiento para otros grupos, por lo que es necesario sintetizar la información de manera constante para que esté disponible a aquellos involucrados en estudiar y conservar la biodiversidad del país (Ramírez-Chaves & Suarez-Castro, 2014).A pesar de la falta de inventarios biológicos detallados, existe evidencia que sugiere que la diversidad biológica en el territorio colombiano se concentra principalmente en el área de piedemonte y en las estribaciones inferiores de las cordilleras. La mayor parte de la superficie del país corresponde a llanuras bajas situadas por debajo de los 500 m.s.n.m. pero, a grandes rasgos, el país puede dividirse en dos regiones: una región transinterandina, que incluye tres cordilleras andinas, los valles interandinos y las fajas litorales caribeña y pacífica, y una segunda región Cisandina que abarca las llanuras de La Orinoquia, La Amazonia y la Sierra de La Macarena (Hernández et al., 1992). A pesar de ser una región potencialmente megadiversa se conoce muy poco acerca de la biota de sus ecosistemas, por lo que resulta fundamental motivar y realizar inventarios y estudios de biodiversidad. Es necesario tener en cuenta que estos ecosistemas han sido seriamente afectados por la expansión de fronteras agrícolas y el establecimiento de cultivos ilícitos (Mosquera et al., 2007), así como por la actividad minera en muchas regiones que ha tenido un efecto devastador sobre fauna, flora, ríos y suelos (López, 2015).Actualmente el Museo de Historia Natural C.J. Marinkelle de la Universidad de los Andes se encuentra registrado ante el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, con número de registro 158 y acrónimo ANDES. Por su parte, la colección de Mamíferos (ANDES-M) cuenta con especímenes recolectados desde 1945, donde gran parte del material proviene de investigaciones del profesor C. J. Marinkelle (García-R, 2020; García-R & Cano-Cobos, 2020). La colección recibe material proveniente principalmente de investigaciones realizadas por laboratorios y grupos de investigación del Departamento de Ciencias Biológicas de la Universidad de los Andes y, en menor medida, a partir de salidas de campo de cursos de pregrado. Para el mes de febrero de 2024 el número de ejemplares catalogados asciende a 2738, los cuales se encuentran preservados en alcohol al 75% (Preparación de tipo Ejemplar completo, Ejemplar con cráneo extraído y Fetos) y en seco (Piel plana, Piel rellena, Cráneo y Esqueleto) (García-R & Cano-Cobos, 2020).El presente proyecto aportará al conocimiento de la riqueza y estructura genética de mamíferos en diferentes regiones biogeográficas que ocurren en Colombia y al crecimiento de las colecciones del Museo de Historia Natural C.J Marinkelle de la Universidad de los Andes. Paralelamente, los estudiantes de diferentes programas de pregrado y posgrado de la Universidad de los Andes aprenderán técnicas de recolección, preservación e identificación para diferentes grupos taxonómicos, así como a proporcionar datos de buena calidad que puedan ser utilizados en el futuro.

Cebus capucinus curtus representa la única especie de primate arbóreo presente en el sistema insular Gorgona, pero a pesar de su potencial aporte en el mantenimiento de la comunidad de plantas, y a ser un atractivo ecoturístico por su particular carisma, se conoce poco sobre el estado actual de su población y sobre su origen en la isla. En el 2012 se realizó una investigación sobre el estado poblacional y uso de hábitat de los monos en la Isla Gorgona, en dicho estudio se registró la mayor densidad de la especie en todo su rango de distribución geográfica, lo que refleja la influencia de esta especie en el VOC Selva húmeda tropical. Actualmente se pretende realizar una Investigación conjunta entre la Universidad de los Andes, la Fundación Proyecto Primates Colombia y Parques Nacionales Naturales relacionada con aspectos sobre genética del mono cariblanco Cebus capucinus curtus presente en el PNNG. Se tomarán muestras fecales (método de recolección no invasivo) y se analizarán en el Laboratorio de Ecología de Bosques Tropicales y Primatología de la Universidad de los Andes. El análisis nos permitirá conocer el origen de los monos cariblancos en la isla Gorgona y responder preguntas sobre la variabilidad genética de la población, biogeografía de islas y efecto fundador. Los resultados y la recopilación de datos cubrirán vacíos de información existentes sobre los monos cariblanco en el AP, y sentarán una base para futuras colaboraciones y proyectos sobre estos primates en la isla.

Non-human primates (NHP) have been found infected with diverse intestinal parasites of public health concern, from which protozoans are commonly reported. Blastocystis Subtypes (ST1, ST2, ST3, ST4, ST5, ST8, ST113, ST15) have been reported in free-living and captive NHP from the New and Old World (Alfellani et al., 2013; Oliveira-Arbex et al., 2020; Valença-Barbosa et al., 2019). Likewise, NHP have been found infected with Giardia duodenalis Assemblages A and B (Soares et al., 2011; Tangtrongsup et al., 2019), and Entamoeba species: E. histolytica, E. dispar, E. moshkovskii, E. hartmanni, E. coli, E. polecki, E. nuttalli (Berrilli et al., 2011; Levecke et al., 2015, 2010). Moreover, the occurrence of zoonotic importance helminths has been observed in NHP, for instance, Trichuris spp. (Levecke et al., 2015; Rondón et al., 2017) and Ascaris spp. (Phillips et al., 2003). In this context, this study aimed to assess the prevalence and genetic diversity of intestinal parasites from NHP living in fragmented forest patches in Colombia, in a preserved forest in Ecuador, and in a wildlife recovery centre, in Italy; in order to explore zoonotic potential and correlation with transmission scenarios. To achieve this goal, the main objectives are: (i)                To determine the prevalence and parasite load of helminths (Trichuris spp., Ascaris spp.) and protozoa (Giardia spp., Blastocystis spp., Entamoeba spp.) in NHP. (ii)              To molecular characterize Trichuris spp., Ascaris spp., Giardia spp., Blastocystis spp. and Entamoeba spp. from NHP faecal samples. (iii)           To assess the parasite (Trichuris spp., Ascaris spp., Giardia spp., Blastocystis spp., Entamoeba spp.) prevalence and richness in NHP living in different transmission scenarios.

En el contexto del cambio climático global, los principales problemas que se deben afrontar desde el punto de vista ecológico son aquellos orientados  a evaluar el impacto que habrá sobre la pérdida de diversidad y el riesgo de emergencia de enfermedades. Estos dos fenómenos están estrechamente ligados y en efecto, se espera que los aumentos predichos de temperatura global, acompañados de los inminentes cambios en el uso del suelo, impacten negativamente en los ecosistemas y comunidades, afectando directamente la diversidad de especies entre las que se encuentran circulando patógenos que pueden ser además, de importancia médica para los humanos. La pérdida de diversidad impacta en los ciclos de transmisión de las enfermedades debido a que ecosistemas más diversos soportan una mayor variación en la competencia de las especies (entendida como su capacidad de infectarse y favorecer la replicación y posterior transmisión de un patógeno). A menor diversidad, por lo tanto, habrá mayor prevalencia de los patógenos en los individuos susceptibles y de esta forma aumentará el riesgo de infección a los humanos. El cambio climático, y en particular el aumento predicho en temperatura, afectarán también la distribución y abundancia relativa de las especies, impactando en la configuración de los ciclos de transmisión. Algunas predicciones hechas para Colombia, sugieren que las especies de vectores de leishmaniasis visceral, por ejemplo, van a tener un cambio en su distribución altitudinal, alcanzando posiblemente poblaciones de humanos susceptibles que previamente no han estado en contacto con estos insectos ni con el patógeno que transmiten. Sin embargo, estos cambios de distribución estarían acompañados por una pérdida en el área potencial de presencia de las especies por efecto de la altitud y por extinciones locales. Desde la perspectiva de las enfermedades emergentes, aquellas zoonóticas (transmitidas entre un animal vertebrado y el hombre), son las de mayor importancia ya que cerca del 60% de los eventos de enfermedades infecciosas que se registran a nivel global son de este tipo, de los cuales cerca del 72% tienen origen silvestre. En el trópico, 80% de las enfermedades tienen hospederos silvestres y son transmitidas por vectores. A pesar de los esfuerzos globales por predecir los focos de aparición de enfermedades emergentes y los cambios potenciales de distribución de especies de importancia médica, hasta el momento, se conocen pocos estudios para las regiones tropicales y en general se han enfocado en proyecciones de Dengue y Malaria. Para Colombia, se desconocen estudios sistemáticos por medio de los cuales se levante la información de base sobre la distribución altitudinal actual de las especies de importancia médica y a partir de la cual puedan realizarse análisis de variación en la distribución en años recientes por aumentos en la temperatura. Desde esta perspectiva, y considerando que las predicciones para el país sugieren que la mayor variación se registrará en un gradiente altitudinal, el objetivo de esta propuesta es evaluar el impacto del cambio climático en la distribución altitudinal de enfermedades emergentes transmitidas por vectores. Para cumplir con este objetivo, se propone realizar un muestreo de los patógenos circulantes en hospederos potenciales tanto vertebrados como invertebrados, a partir de los cuales se detectarán los agentes etiológicos causantes de enfermedades de importancia en salud pública en Colombia tales como: Leishmaniasis, Enfermedad de Chagas, Malaria y arbovirosis (Dengue, Zika, Chikungunya). Adicionalmente, se hará un levantamiento de la información climática en cada uno de los puntos de muestreo, con el fin de evaluar de qué forma la variación climática afecta variables eco-epidemiológicas como abundancias relativas y diversidad de insectos vectores, prevalencia de infección, presencia de reservorios y antropofilia. En dos gradientes altitudinales, uno desde el valle del Magdalena hasta la Sabana de Bogotá y otro desde la Orinoquía hasta la Sabana de Bogotá, se establecerán estaciones de muestreo entomológico y de reservorios cada 500 m desde los 0 hasta los 2500 msnm, en las cuales se realizarán muestreos una vezal año durante dos años. La información obtenida a partir de los muestreos altitudinales se utilizará posteriormente para realizar modelos de distribución potencial de los insectos vectores y sus patógenos asociados en los años 2050 y 2070, bajo proyecciones de cambio climático. De esta forma se espera poder proporcionar a las autoridades herramientas necesarias para establecer planes de prevención y mitigación de los efectos del cambio climático en las zonas vulnerables. Así mismo, la distribución actual obtenida en el presente estudio se comparará con los datos históricos de distribución de vectores y patógenos para la zona de estudio, para así determinar el impacto del cambio climático en la distribución actual.

INTRODUCCIÓN El virus del Zika (ZIKV) es un flavivirus de cadena sencilla y sentido positivo. Después de su primer aislamiento en 1947 a partir de una muestra de suero de un mono Rhesus habitante de un bosque en Uganda (1), ZIKV ha sido detectado en humanos, primates no humanos (PNH) y/o mosquitos (2). Sin embargo, las tasas de infección en humanos se han mantenido relativamente bajas durante 60 años, a pesar de la continua detección del virus en primates silvestres no humanos.   Tres cepas principales de ZIKV han sido detectadas: una de África oriental, una de África occidental y una asiática (3). En un brote de 2007, la cepa asiática de ZIKV infectó aproximadamente el 70% de las personas habitantes de la isla de Yap en los Estados Federados de Micronesia (4); este evento fue seguido por otro brote en 2013 en la Polinesia Francesa, donde estuvo implicada una cepa de ZIKV relacionada con la cepa causante del brote en la isla de Yap (5). ZIKV se reportó por primera vez en poblaciones humanas en Sudamérica (Brasil) en mayo de 2015 (6); análisis filogenéticos indicaron que la cepa americana de ZIKV pertenece al linaje asiático y está estrechamente relacionada con la cepa que causó el brote de la Polinesia Francesa (7-9). Esta cepa emergente tiene 12 nucleótidos adicionales en el gen de la envoltura (E), correspondiente a un motivo de glicosilación asociado con una mayor virulencia en otros flavivirus relacionados (3,10), lo cual podría explicar los desórdenes más severos, neurológicos y del desarrollo, asociados con esta cepa (11, 12-14): microcefalia congénita, síndrome de Guillain-Barré y otras enfermedades neurológicas (11, 15).   Numerosos estudios indican que los PNH de África y Asia son portadores naturales de cepas de ZIKV que causan en su mayoría enfermedades benignas en humanos (16-20); sin embargo, una cepa más virulenta ha emergido y se está propagando a través de las poblaciones humanas en áreas que albergan varias especies de PNH. Brasil es la primera ubicación donde las cepas de ZIKV potencialmente más virulentas y los PNH se superponen (4).   PNH Neotropicales de varias especies son portadores de flavivirus tales como la fiebre amarilla (VFA) y el dengue (VDEN); y portadores potenciales de la forma más virulenta de ZIKV. En comparación con la infección en primates del Viejo Mundo, VFA se presenta con síntomas mucho más graves en PNH Neotropicales (21) y ha causado la muerte de cientos de monos aulladores salvajes (Alouatta spp.) en Argentina (22) y Brasil (23, 24). VFA se mantiene en PNH reservorios y los brotes en poblaciones humanas ocurren cuando la enfermedad se transmite de PNH a humanos por medio de mosquitos vectores (25). Este patrón de transmisión de flavivirus sugiere que los PNH Neotropicales son importantes reservorios de ZIKV.   Dado que ZIKV está estrechamente relacionado con los flavivirus VFA y VDEN, y que estos virus son transmitidos principalmente por el mosquito vector Aedes aegypti, se plantea como hipótesis que ZIKV será encontrado en PNH Neotropicales que podrían servir como reservorios de infecciones en humanos. Comprender la biología de los reservorios es crítico para el monitoreo y control de las enfermedades zoonóticas, las cuales han sido poco estudiadas en PNH Neotropicales (26) a pesar de los brotes fatales de estas enfermedades y la relevancia de los PNH como reservorios de enfermedades en humanos (22, 25, 27).   OBJETIVOS Determinar la prevalencia de ZIKV en primates Alouatta seniculus, Cebus versicolor, Ateles hybridus y Saguinus leucopus.   Evaluar la detección de ZIKV en heces y orina de primates Alouatta seniculus, Cebus versicolor, Ateles hybridus y Saguinus leucopus.

Actualmente la fragmentación y la pérdida de hábitat son unos de los problemas más relevantes para la conservación de la biodiversidad, a tal punto que estos fenómenos son considerados como uno de los principales promotores de la pérdida de biodiversidad. Particularmente, el Valle del Río Magdalena, en Colombia, es una región dominada por el cultivo de palma de aceite y la ganadería extensiva. Debido a esto y escasez de estudios realizados en esta zona, es de gran importancia conocer la diversidad de murciélagos de esta región del país y comprender los servicios ecosistémicos que estos aportan a los ecosistemas, por ejemplo: la dispersión de semillas por endozoocoria o su papel como control de plagas. Este proyecto busca realizar por un lado generar conocimiento sobre la diversidad de murciélagos del Magdalena y por el otro, cuantificar los servicios ecosistémicos brindados por las diferentes especies de murciélagos presentes en el Valle del Magdalena, Colombia. La información obtenida a partir de este trabajo aportará conocimientos sobre la diversidad, ecología y la importancia de los servicios ecosistémicos de las especies presentes en este ecosistema altamente fragmentado. El rol de los murciélagos como depredadores, polinizadores y dispersores de semillas es importante en los procesos ecológicos de los bosques tropicales. Específicamente, su rol como dispersores de semillas juega un papel importante en la regeneración de los bosques ya que la dieta de la mayoría de las especies de murciélagos frugívoros se basa en una mayor proporción de especies de plantas pioneras. Varios estudios han sugerido que la endozoocoria produce efectos benéficos para la germinación de las semillas, aumentando su capacidad de germinación y disminuyendo el tiempo requerido para este mismo proceso. Sin embargo, para este proyecto se requiere evaluar si la efectividad de la dispersión de semillas es mayor en murciélagos frugívoros generalistas respecto a los que poseen una dieta especialista.

Trypanoxyuris es un género de nematodo perteneciente a la familia Oxyuridae (Hugot et al., 1985), transmitido principalmente por medio de la ingestión de huevos, los cuales son liberados en el ambiente junto con las heces de sus hospederos, no obstante, la autoinfección y retroinfección también son modos de transmisión comunes. (Cook, 1994; Felt & White, 2005; Gónzalez-Hernández et al., 2014). En el Neotrópico se han encontrado 18 especies de Trypanoxyuris (Alves et al., 2013),  las cuales presentan variación morfológica, así como también diferentes rangos geográficos (Conga et al., 2015). Existen reportes de Trypanoxyuris en varias especies de primates en diferentes países: Argentina, Brasil, Guyana Francesa, Surinam, Venezuela, Colombia, Panamá, Costa Rica, Bélice y México (Trejo-Macías et al., 2011), y se ha encontrado que estos parásitos son altamente hospedero-específicos y muestran patrones de coevolución entre parásito y hospedero (Hugot, 1999).  Este estudio pretende determinar las especies de Trypanoxyuris que infectan primates neotropicales en cuatro diferentes regiones en Colombia, para posteriormente evaluar la diversidad genética de estas; contribuyendo al entendimiento de la evolución e historia de vida de este grupo de parásitos.  OBJETIVOS 1. Identificar las especies de Trypanoxyuris que parasitan primates en cuatro diferentes regiones en Colombia. 2. Determinar la diversidad genética de Trypanoxyuris spp. en las especies de primates en Colombia. 3. Realizar análisis filogenéticos que comparen la historia evolutiva de Trypanoxyuris spp.  con la historia evolutiva de los primates neotropicales

En la actualidad nos encontramos en una crisis de conservación de la biodiversidad, causada por las actividades antrópicas ocurridas tras la Revolución Industrial. Esta crisis es de tal magnitud que se considera como la sexta extinción masiva, solo que se está llevando a cabo en una escala de tiempo mucho menor a la de las otras cinco extinciones masivas ocurridas en la historia de la vida en la tierra. Dada la rapidez de la ocurrencia de esta crisis, se hace necesario estudiar la biodiversidad con el fin de tomar medidas para garantizar la supervivencia de las especies a largo plazo.  Sin embargo, es muy difícil plantear planes de conservación si no se conocen la abundancia demográfica, distribución geográfica, más la variabilidad morfológica y genética de las poblaciones salvajes. Dentro de los grupos más amenazados y de mayor interés para el público se encuentran los tetrápodos (anfibios, reptiles, aves, y mamíferos). En Colombia el estado de conservación de muchas especies de tetrápodos es poco conocida debido a la escasa información que se tiene sobre su historia natural, ya que muchas especies (sobre todo, los serpientes y los mamíferos) presentan hábitos crípticos y/o presentan bajas densidades poblacionales y por ende son difíciles de observar. Como consecuencia, los inventarios y colectas en el campo han sido limitados en el tiempo y el espacio, comúnmente llevando a una subestimación del estado de conservación de algunas especies. Por otro lado, son escasos los datos cuantitativos registrando los efectos de las principales amenazas de estos vertebrados. Algunos estudios infieren que aparte de la destrucción del hábitat, la tasa de mortalidad por el atropello vehicular y trabajadores de campo son dos de las amenazas más importantes para los tetrápodos, por ejemplo en el caso de las serpientes. Aparte de estas amenazas antropogenicas, también existen otras causas naturales poco estudiadas como enfermedades o depredación que con llevan al encuentro de tetrápodos muertos en numerosas salidas de campo de la universidad.  Dado que el país parece encaminarse a un posible periodo de post-conflicto, empezará una etapa de urbanización en Colombia con un aumento de construcción de carreteras. Esto conlleva a un mayor encuentro entre trafico vehicular, trabajadores del campo, y los animales salvajes, aumentando la probabilidad de mortalidad de animales por atropello vehicular o machetazos indiscriminados. Por otro lado, en las ultimas décadas también ha ocurrido un aumento de enfermedades poco estudiadas en poblaciones silvestres que llevan a la muerte de muchos individuos y sin duda alguna también hay muchas causas de muerte natural de vertebrados que la ciencia desconoce. Con la ayuda del permiso marco, se pretende recolectar y recuperar especímenes de estos grupos faunísticos encontrados muertos en el campo dado a los diversos escenarios mencionados. Cada ejemplar no solo ayudará a cuantificar cuáles son las posibles especies más afectadas por dichas actividades antropogénicas (atropellados y sacrificados por campesinos), sino también proporcionar datos valiosos sobre enfermedades, dinámicas de depredación, distribución geográfica, variación morfológica, y fenología demográfica. Los ejemplares (completos o partes de ellos) serán depositado en una colección de historia natural (como Museo de Historia Natural ANDES) y, cuando posible, con un tejido para futuros estudios taxonómicos o patológicos basados en datos genéticos. Por otro lado, con estos datos de mortalidad también se pueden predecir las épocas con mayor actividad de migración y estimar en qué épocas se encuentran más vulnerables los tetrápodos. Esta información es vital para establecer el estado de conservación y tomar decisiones sobre el manejo de cada especie en particular. El propósito de este proyecto es recopilar evidencia que permita tener un acercamiento informado a la importancia de la mortalidad de anfibios, reptiles, aves, y mamíferos (los tetrápodos) en el territorio colombiano por muerte natural, por enfermedades emergentes, atropello vehicular, o por parte de los trabajadores de campo, y conocer mejor la distribución geográfica e historia natural de especies de baja densidad.

Después de Brasil, Colombia es el segundo país con el mayor número de casos de Virus del Zika (ZIKV) reportados en América durante el periodo epidemiológico 2015-2016 (Nishiura et al., 2016), y de acuerdo con el Ministerio de Salud, Colombia es el país con el mayor número de pruebas diagnósticas realizadas.La mayor relevancia de la infección por ZIKV en el país y en América del sur, desde la perspectiva de salud pública, es la relación entre la infección con el virus y la microcefalia en fetos (Calvet et al., 2016; Mlaka et al., 2016). En Colombia, en marzo de 2016, 34 casos de microcefalia estuvieron bajo investigación debido a su probable relación con la infección por ZIKV en 2015 (Ministry of Health, 2016).El primer caso se registró en Cali en la semana del 9 al 15 de agosto de 2015. Desde entonces se han registrado 89.218 casos, 7.582 de ellos son casos confirmados y el resto son sospechosos, debido a los síntomas clínicos (National Institute of Health, 2016). De los casos reportados, 77.905 pertenecen a 486 municipios donde ZIKV ha sido confirmado, y 3.458 proceden de 273 municipios donde los casos no han sido confirmados mediante pruebas de laboratorio.Si se estima el número de asintomáticos, el virus podría haber infectado a 494.000 individuos. El sub-reporte es también importante, debido a la similitud de los síntomas con otros virus circulantes, tales como Chikungunya y Dengue, que son altamente endémicos en el país (Villamil-Gómez, 2016).El laboratorio de entomología del Instituto Nacional de Salud (Bogotá, Colombia) reportó que en 2015 el vector, Aedes aegypti, se distribuyó hasta 2.150 m.s.n.m en el departamento de Boyacá, aumentando el límite histórico altitudinal de 1.800 m.s.n.m. El mosquito ha sido colectado en 1.503 localidades dentro de 755 municipios. En total, la población en riesgo estimada es de 28 millones de personas, ya que viven en áreas donde el mosquito está presente. Actualmente algunos investigadores muestran preocupación frente a la posibilidad de que otros mosquitos, como los del género Culex, actúen como vectores (Ayres, 2016).La distribución de los casos muestra que el 55.82% de ellos se localiza en cinco departamentos (Valle del Cauca, Norte Santander, Santander, Huila and Tolima). El pico epidemiológico se alcanzó a finales de enero del 2016 con un máximo de 5.789 casos nuevos reportados entre el 24 y el 30 de ese mes. Adicionalmente, 3.467 casos fueron reportados entre el 15 y el 21 de mayo. Los focos de transmisión más grandes se localizan en centros urbanos, todos ellos capitales de departamento, situados a bajas altitudes y con alta densidad poblacional, como es el caso de Cali (6.594 casos), Cúcuta (3.900 casos), Bucaramanga (2.344 casos), Neiva (1.889 casos) y Barranquilla (1.641 casos). El grupo de edad donde la mayoría de casos han sido reportados es de los 20 a los 35 años. Aunque la epidemia parece haber terminado, el mosquito es endémico y se encuentra listo para transmitir nuevos virus que podrían ser introducidos potencialmente en el país; también, la población que permanece susceptible podría ser suficiente para sostener una segunda epidemia en el 2017.Desde la perspectiva de la ecología de la enfermedad, ZIKV pertenece a un grupo de arbovirus como el Dengue (DEN), el Chikungunya (CHIKV) y el Virus de la Fiebre Amarilla (YFV), que emergieron de diferentes ciclos enzoóticos entre mosquitos Aedes y hospederos animales no humanos. Todos los virus fueron importados a América desde diferentes orígenes: Chikungunya y Fiebre Amarilla de África, y Zika y Dengue del sudeste asiático, con introducciones recurrentes que se suman a la complejidad de las cepas circulantes. El resultado del establecimiento de ciclos de transmisión fue diferente; el Dengue se mantuvo en un ciclo urbano, no silvestre, mientras que el virus de la Fiebre Amarilla estableció un ciclo silvestre en primates no humanos.Considerando la relevancia desde la perspectiva de la salud pública, el objetivo de este estudio es evaluar el potencial de ZIKV para establecer un ciclo de transmisión silvestre en Colombia.Objetivos1. Evaluar la exposición del virus del Zika en diferentes grupos de vertebrados: primates, pequeños mamíferos (murciélagos, roedores y marsupiales), anfibios y reptiles y animales domésticos, mediante el análisis de muestras de sangre para la detección de anticuerpos y presencia del virus del Zika (virus, antígeno y/o ARN).2. Determinar las especies de mosquitos que probablemente sirven como vector(es) puente desde o hacia estos hospederos vertebrados no humanos; mediante estudios de campo de mosquitos asociados con especies de vertebrados no humanos y a través de análisis de sangre.

En la actualidad la fragmentación y degradación del hábitat son una de las principales amenazas para las especies en el planeta. Para especies de gran tamaño como los monos araña café (Ateles hybridus), la fragmentación representa un gran desafío ya que requieren de áreas poco perturbadas para su supervivencia. A pesar de ser considerado como una especie críticamente amenazada, poco se conoce sobre el estado genético de sus poblaciones y las consecuencias genéticas de la fragmentación para la especie. El presente trabajo tiene como objetivo identificar los efectos de la fragmentación sobre la diversidad y la estructura genética de los monos araña café, evaluando si la fragmentación está relacionada con una reducción de la variabilidad genética y la capacidad de dispersión de los individuos,  causando una disminución o interrupción del flujo genético entre grupos sociales. Para el desarrollo de esta investigación realizaremos un análisis multilocus con marcadores microsatélites en cuatro poblaciones de monos araña que habitan en ecosistemas con diferentes grados de perturbación antrópica. Los resultados de este estudio permitirán conocer el estado genético de las poblaciones de monos araña café que habitan en áreas con diferente grado de intervención, lo cual será un elemento esencial en la  formulación e implementación de planes de conservación para la especie.

El presente estudio busca evaluar la prevalencia de Plasmodium sp. en tres especies de primates no humanos (Cebus albifrons, Ateles hybridus, Alouatta seniculus) y los vectores del género Anopheles asociados a la transmisión, en cuatro sitios con diferente grado de fragmentación, localizados a lo largo del Magdalena Medio. Se colectarán muestras fecales de los primates, a partir de las cuales se realizará extracción de ADN mediante el kit QIAamp DNA stool, PCR, electroforesis y secuenciación para identificación de Plasmodium sp. Adicionalmente se colectarán mosquitos del género Anopheles por medio de trampas CDC con atrayente, que serán identificados taxonómicamente. Se seleccionarán las hembras para realizar extracción de ADN mediante el kit ZR Tissue & Insect DNA MiniPrep, PCR, electroforesis y secuenciación con el fin de llevar a cabo la identificación de Plasmodium sp. Se espera encontrar mayor prevalencia de Plasmodium sp. en los sitios con mayor grado de fragmentación, y diferencias en las dinámicas poblacionales y tasa de infección en Anopheles según el lugar de muestreo.

El chigüiro (Hydrochoerus hydrochaeris) y el chigüiro menor (Hydrochoerus isthmius) son las especies de roedores más grandes del mundo y se han convertido en un ícono de la vida silvestre de Sur América. De acuerdo a la IUCN, el chigüiro se encuentra en la categoría de preocupación menor, y el chigüiro menor está en la categoría de datos insuficientes. Las especies están separadas por la cordillera de los Andes. El chigüiro menor (H. isthmius) se encuentra en el oeste de los Andes colombianos, Panamá y Venezuela. El chugüiro (H. hydrochaeris) se encuentra al este de los Andes desde Venezuela hasta la boca del río de la Plata en Argentina. En las tierras bajas de Colombia, los chigüiros se mueven en manada en zonas inundables y se ha consolidado como una fuente importante de comida para las comunidades locales.  En el año 2014 ocurrió una sequía en la zona oriental de Colombia causando la muerte de un número alarmante de individuos. Adicionalmente, el año pasado se propusieron una nueva ley que permitiría la caza regulada de chigüiros. Por estas razones, Colombia enfrenta un momento crucial en las decisiones de conservación y manejo de estas especies emblemáticas, para las cuales existe una deficiencia de datos genéticos de las poblaciones naturales.   Por este motivo, en este proyecto proponemos llenar este vacío mediante la generación del genoma completo del chigüiro (H. hydrochaeris). Estos datos proporcionarán información demográfica básica así como información relevante para la biología del chigüiro como genes relacionados con inmunidad o gigantismo. Adicionalmente, se desarrollarán marcadores microsatélites que podrán ser usados para estudiar parentesco o paternidad en individuos en cautiverio y salvajes. Se generarán datos transcriptómicos (secuencia de todos los ARN mensajeros en una muestra biológica) con el fin de anotar el genoma (identificar cada uno de los genes que componen el genoma de la especie). Este proyecto generará una gran cantidad de información genética detallada para este icónico animal. Además, dada la importancia económica del chigüiro para la comunidades locales, entender la historia genética y demográfica de estas especies es de gran importancia para dirigir las acciones futuras en cuanto a manejo sostenible y conservación.