Adriana Jimena Bernal Giraldo

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Adriana Jimena Bernal Giraldo

Adriana Jimena Bernal Giraldo

Doctor Of Philosophy In Plant Pathology

abernal @uniandes.edu.co

Profesor Asociado

Departamento de Ciencias Biológicas

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Profile

Recent Courses

  • 2024

    • INGENIERIA GENETICA PLANTAS

      Second period
      Bachelor Level

      PRACTICAS LABOR. AVANZADAS

      Second period
      Bachelor Level
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Recent Products

.(2024). A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny.
A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny
Thesis
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.(2024). Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta).
Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta)
Thesis
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Recent Degrees

Doctor Of Philosophy In Plant Pathology

Doctoral degree

University Of California

2003

Estados Unidos

Microbióloga

Bachelor degree

Universidad De Los Andes, Colombia

1994

Colombia

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Recent Projects

  • 2021
    • Explorando los microbiomas de suelos asociados con sistemas agrícolas contrastantes y la diversidad de aislamientos de la roya del café en Colombia

      Duration: 45 months

      PR.6.2021.8007

      En este proyecto se pretende evaluar el impacto de la agricultura en la diversidad bacteriana del suelo yla influencia de diferentes prácticas agronómicas en él, utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento en sistemas de cultivos de café, yuca, Sacha-Inchi y tomate de árbol en Colombia. De igual forma se pretende estudiar la diversidad molecular de la roya del café causada por el hongo Hemileia vastatrix, utilizando también secuenciación de tercera generación.

  • 2020
    • Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en Colombia

      Duration: 18 months

      PR.6.2020.7087

      La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

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Courses

  • 2024

    • INGENIERIA GENETICA PLANTAS

      Second period
      Bachelor Level

      PRACTICAS LABOR. AVANZADAS

      Second period
      Bachelor Level

    • BIOLOGÍA MOLECULAR AVANZADA

      First period
      Master Level

      SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.

      First period
      Master Level

    • PRACTICAS LABOR. AVANZADAS

      First period
      Bachelor Level

      TG,MONOGR,PASANTIA,EMPRENDIM

      Second period
      Bachelor Level

    • BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

      SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level

    • SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.

      Second period
      Master Level

      SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level

    • SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.2

      Second period
      Doctoral Level

      TG,MONOGR,PASANTIA,EMPRENDIM

      First period
      Bachelor Level
  • 2023

    • INTERACCIONES PLANTA-BACTERIA

      Second period
      Bachelor Level

      FITOPATOLOGIA-TEO

      Second period
      Bachelor Level

    • TG,MONOGR,PASANTIA,EMPRENDIM

      Second period
      Bachelor Level

      BIOLOGÍA MOLECULAR AVANZADA

      First period
      Master Level

    • INGENIERIA GENETICA PLANTAS

      First period
      Bachelor Level

      BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

    • BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

      TG,MONOGR,PASANTIA,EMPRENDIM

      First period
      Bachelor Level
  • 2022

    • FUND.BIOL.CELULAR Y MOLECULAR

      First period
      Bachelor Level

      BIOLOGÍA MOLECULAR AVANZADA

      First period
      Master Level

    • INTERACCIONES PLANTA-BACTERIA

      First period
      Bachelor Level

      BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

    • BIOLOG. MOLECULAR DE LA CELULA

      Second period
      Bachelor Level

      CLINICA DE PLANTAS

      Second period
      Bachelor Level

    • TRABAJO GRADO, MONOGR, PRAC.GR

      Second period
      Bachelor Level
  • 2021

    • TESIS DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 10

      First period
      Doctoral Level

    • SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.

      First period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 6

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 9

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level

    • PASANTÍA 2

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 5

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level

    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 7

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA ESTUDIANTES EXTERNOS

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS MAESTRÍA 2

      First period
      Master Level

      PASANTÍA DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

    • PASANTÍA DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA 1

      First period
      Doctoral Level

    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 8

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS

      First period
      Doctoral Level

    • SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      First period
      Doctoral Level

      PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACIÓN

      First period
      Master Level

    • PROYECTO MAESTRÍA

      First period
      Master Level

      TESIS MAESTRÍA 1

      First period
      Master Level

    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level

      BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

    • INTERACCIONES PLANTA-BACTERIA

      First period
      Bachelor Level

      FITOPATOLOGÍA-TEO

      Second period
      Bachelor Level

    • BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level
  • 2020

    • PASANTÍA SEMESTRAL

      First period
      Master Level

      TESIS 4 CR

      First period
      Master Level

    • POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

      First period
      Master Level

      TESIS 2 - 4 CR

      First period
      Master Level

    • TESIS 8 CR

      First period
      Master Level

      TESIS MAESTRÍA 1

      First period
      Master Level

    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 5

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 8

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.

      First period
      Master Level

    • PASANTÍA ESTUD. EXT. MAESTRÍA

      First period
      Master Level

      PASANTÍA DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level

    • PASANTÍA DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA 1

      First period
      Doctoral Level

    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRÍA 2

      First period
      Master Level

    • PASANTÍA DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level

    • PASANTÍA 2

      First period
      Doctoral Level

      PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level

    • PROYECTO MAESTRÍA

      First period
      Master Level

      PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACIÓN

      First period
      Master Level

    • SUSTENTACIÓN DE TESIS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 9

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      First period
      Doctoral Level

    • BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

      TESIS 2 - 8 CR

      First period
      Master Level

    • TESIS DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTÍA ESTUDIANTES EXTERNOS

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 11

      First period
      Doctoral Level

    • PASANTÍA ESTUDIANTES EXTERNOS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRÍA 2

      Interseminal period
      Master Level

    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 10

      First period
      Doctoral Level

      BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

    • TESIS MAESTRÍA 1

      Interseminal period
      Master Level

      PASANTÍA ESTUD. EXT. MAESTRÍA

      Second period
      Master Level

    • PASANTÍA DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTÍA 1

      Second period
      Doctoral Level

    • PASANTÍA 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 3

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 8

      Second period
      Doctoral Level

      PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACIÓN

      Second period
      Master Level

    • PROYECTO MAESTRÍA

      Interseminal period
      Master Level

      TESIS MAESTRÍA 2

      Second period
      Master Level

    • PASANTÍA DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level

    • PASANTÍA 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTÍA 2

      Second period
      Doctoral Level

    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 4

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 5

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 10

      Second period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level

    • SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level

      BACTERIOLOGÍA-TEO

      Second period
      Bachelor Level

    • PASANTÍA DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 6

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PROYECTO MAESTRÍA

      Second period
      Master Level

    • TESIS MAESTRÍA 1

      Second period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 9

      Second period
      Doctoral Level

    • SUSTENTACIÓN DE TESIS

      Interseminal period
      Doctoral Level

      SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 5

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.

      Second period
      Master Level
  • 2019

    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

      BACTERIOLOGIA-TEO

      Second period
      Bachelor Level

    • TESIS DOCTORADO 1

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 5

      First period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRIA 1

      First period
      Master Level

    • PASANTIA DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      First period
      Doctoral Level

    • PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      First period
      Master Level

      PASANTIA DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 8

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      First period
      Doctoral Level

    • PASANTIA ESTUDIANTES EXTERNOS

      First period
      Doctoral Level

      INTERAC.MOLEC.PLANTA PATOGENO

      First period
      Master Level

    • BACTERIOLOGIA-TEO

      First period
      Bachelor Level

      PASANTIA DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • PASANTIA 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTIA 1

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 6

      Interseminal period
      Doctoral Level

      BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level

      PASANTIA DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level

    • PASANTIA 1

      First period
      Doctoral Level

      PASANTIA 2

      First period
      Doctoral Level

    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      First period
      Doctoral Level

      PROYECTO MAESTRIA

      First period
      Master Level

    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 9

      First period
      Doctoral Level

    • PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      Second period
      Master Level

      PROYECTO MAESTRIA

      Interseminal period
      Master Level

    • TESIS MAESTRIA 2

      Second period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 5

      Second period
      Doctoral Level

    • SUSTENTACION DE TESIS

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 3

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 5

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 8

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 10

      Second period
      Doctoral Level

    • PROYECTO MAESTRIA

      Second period
      Master Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Interseminal period
      Master Level

    • PASANTIA DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA 2

      Second period
      Doctoral Level

    • PASANTIA 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level

    • SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS MAESTRIA 2

      First period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 9

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 10

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      First period
      Doctoral Level

    • TESIS MAESTRIA 2

      Interseminal period
      Master Level

      PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

    • PASANTIA DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Second period
      Master Level

    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      Interseminal period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      Second period
      Master Level

    • PASANTIA DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 4

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTIA ESTUDIANTES EXTERNOS

      Second period
      Doctoral Level

    • PASANTIA ESTUD. EXT. MAESTRIA

      First period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

    • PASANTIA ESTUD. EXT. MAESTRIA

      Second period
      Master Level
  • 2018

    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

      BACTERIOLOGIA-TEO

      First period
      Bachelor Level

    • PASANTIA DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 10

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA ESTUDIANTES EXTERNOS

      Second period
      Doctoral Level

    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 8

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 9

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS MAESTRIA 2

      Interseminal period
      Master Level

      PROYECTO MAESTRIA

      Interseminal period
      Master Level

    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

      BACTERIOLOGIA-TEO

      Second period
      Bachelor Level

    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 5

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

    • PASANTIA 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Interseminal period
      Master Level

    • PASANTIA 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      Second period
      Doctoral Level

    • TESIS DOCTORADO 7

      Second period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level

    • PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      Interseminal period
      Master Level

      PASANTIA DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • PASANTIA 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTIA 2

      Second period
      Doctoral Level

    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

    • PROYECTO MAESTRIA

      Second period
      Master Level

      PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      Second period
      Master Level

    • TESIS MAESTRIA 2

      Second period
      Master Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Second period
      Master Level
  • 2017

    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level
  • 2014

    • INTERAC.MOLEC.PLANTA PATOGENO

      First period
      Master Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      First period
      Master Level

    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      First period
      Doctoral Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level

    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      Second period
      Doctoral Level

    • FITOPATOLOGIA-TEO

      First period
      Bachelor Level

      BIOLOGIA CELULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

Products

.(2024). A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny.
A step in biosafety: Genetic circuit design for the sabotage of sporulation capacity in Bacillus subtilis progeny
Thesis
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.(2024). Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta).
Aislamiento y caracterización de bacterias fijadoras de nitrógeno en rizósfera de yuca (Manihot esculenta)
Thesis
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Villegas-Torres MF, Bernal A, Gonzalez A.
CocAI: Transformación del uso de la planta de coca a alternativas productivas a partir de la modulación del metabolismo secundario para fomentar la síntesis de metabolitos de tipo no alcaloide combinando cultivo in vitro, metabolómica e inteligencia artificial
Minciencias.
Proposal
.(2024). Evaluación de expresión génica de biopelículas en comunidades de E. Coli por estrés, a partir de microscopía de hoja de luz.
Evaluación de expresión génica de biopelículas en comunidades de E. Coli por estrés, a partir de microscopía de hoja de luz
Thesis
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.(2024). Microbioma bacteriano de Manihot esculenta en diferentes condiciones de cultivo en la costa atlántica colombiana.
Microbioma bacteriano de Manihot esculenta en diferentes condiciones de cultivo en la costa atlántica colombiana
Thesis
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Villegas-Torres MF, Gonzalez A, Duitama J, Velasco J, Bernal A.(2024).
Ruta de la innovación 2.0: Visita de Incauca
Event
.(2024). Sowing deep roots: exploring the plant growth promoting role of rhizobacteria in solanum lycopersicum.
Sowing deep roots: exploring the plant growth promoting role of rhizobacteria in solanum lycopersicum
Thesis
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.(2024). XopAE: A través del patelina verso. Explorando interacciones proteína-proteína que toman parte durante los estadíos de infección de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm).
XopAE: A través del patelina verso. Explorando interacciones proteína-proteína que toman parte durante los estadíos de infección de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm)
Thesis
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Bernal A. (2023)
A minisatellite-based MLVA for deciphering the global epidemiology of the bacterial cassava pathogen Xanthomonas phaseoli pv. manihotis
Article
.(2023). Análisis de patrones de expresión espaciotemporal del gen nlgn3 en el cerebro de peces hembra de la especie Poecilia reticulata tras la exposición a diversos contextos sociales.
Análisis de patrones de expresión espaciotemporal del gen nlgn3 en el cerebro de peces hembra de la especie Poecilia reticulata tras la exposición a diversos contextos sociales
Thesis
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Bernal A. (2023)
CRISPRi in Xanthomonas demonstrates functional convergence of transcription activator-like effectors in two divergent pathogens
New Phytologist (ISSN 0028-646X)
Article
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Bernal A, Zarate C, Audran C, Medina C, Escalon A, Javegny S, Gagnevin L, Thomas E, Pimparé L, López C, Jacobs J, Noël L. D., Koebnik R, Szurek B. (2023)
CRISPRi inXanthomonasdemonstrates functional convergenceof transcription activator-like effectors in twodivergent pathogens
New Phytologist (ISSN 0028-646X)
Article
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.(2023). Caracterización de bacterias aisladas de la rizosfera de sacha inchi (Plukenetia volubilis) asociadas a la promoción de crecimiento vegetal y protección contra estrés hídrico.
Caracterización de bacterias aisladas de la rizosfera de sacha inchi (Plukenetia volubilis) asociadas a la promoción de crecimiento vegetal y protección contra estrés hídrico
Thesis
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.(2023). Dominios de interacción entre la proteína efectora XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y la patelina 3 en Arabidopsis thaliana.
Dominios de interacción entre la proteína efectora XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y la patelina 3 en Arabidopsis thaliana
Thesis
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.(2023). Gene expression dynamics in the guppy brain: unraveling the neural mechanisms underlying social decision making and mate choice.
Gene expression dynamics in the guppy brain: unraveling the neural mechanisms underlying social decision making and mate choice
Thesis
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.(2023). Guide selection using a CRISPRa system to activate parkin gene related to parkinson's disease.
Guide selection using a CRISPRa system to activate parkin gene related to parkinson's disease
Thesis
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.(2023). Microbiología del vermicompost.
Microbiología del vermicompost
Thesis
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.(2023). Rol del T6SS en Competencia Bacteriana de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis Ante Bacterias Epífitas de Yuca (Manihot esculenta).
Rol del T6SS en Competencia Bacteriana de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis Ante Bacterias Epífitas de Yuca (Manihot esculenta)
Thesis
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.(2023). Validación de la interacción entre el efector XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y una patelina de plantas involucrada en inmunidad vegetal.
Validación de la interacción entre el efector XopAE de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis y una patelina de plantas involucrada en inmunidad vegetal
Thesis
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.(2023). Xanthomonas phaseoli pv. manihotis effector XopAO1 targets two key proteins to suppress defense in Cassava.
Xanthomonas phaseoli pv. manihotis effector XopAO1 targets two key proteins to suppress defense in Cassava
Thesis
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Bernal A, Barrera C, Clavijo F, Benčič A., Croce V, Jacobs J, Koebnik R, Roman-Reyna V. (2022)
Complete Genome Sequence Resource for Xanthomonas translucens pv. undulosa MAI5034, a Wheat Pathogen from Uruguay
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
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Meral S, Bibi S, Diaz C, Menkovic J, Bernal A, Koebnik R. (2022)
Complete Genome Sequence of Xanthomonas campestris pv. campestris SB80, a Race 4 Strain Isolated from White Head Cabbage in Turkey
Microbiology Resource Announcements (ISSN 2576-098X)
Article
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.(2022). Diseño de un protocolo de desecación para Pseudomonas benéficas en plantas incorporando carotenoides y disacáridos.
Diseño de un protocolo de desecación para Pseudomonas benéficas en plantas incorporando carotenoides y disacáridos
Thesis
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Luuu S, Duplat D, Benitez P, Leon C, Villota S, Veloz-Villavicencio E, Arevalo V, Jaenes K, Guoo Y, Cicek S, Robinson L, Peidis P, Pearson J, Woodgett J, Mazzulli T, Ponce P, Restrepo S, Gonzalez J, Bernal A, Guevara-Suarez M, Pardee K, Cevallos V, González C, Bremner R. (2022)
Multicenter international assessment of a SARS-CoV-2 RT-LAMP test for point of care clinical application
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Article
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Ayala D, Cardenas M, Guyot R, Chaib M, Bernal A, Reyes A, Restrepo S. (2021)
A whole genome duplication drives the genome evolution of Phytophthora betacei, a closely related species to Phytophthora infestans
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Article
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.(2021). Aislamiento y caracterización de Pseudomonas benéficas de la microbiota asociada a la raíz de Plukenetia volubilis.
Aislamiento y caracterización de Pseudomonas benéficas de la microbiota asociada a la raíz de Plukenetia volubilis
Thesis
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.(2021). Análisis computacional de redes metabólicas e interacción proteína-proteína en relaciones planta patógeno: dilucidando su complejidad mediante métodos computacionales.
Análisis computacional de redes metabólicas e interacción proteína-proteína en relaciones planta patógeno: dilucidando su complejidad mediante métodos computacionales
Thesis
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Zarate C, Gomez D, Verdier V, Lopez C, Bernal A, Szurek B. (2021)
Cassava diseases caused by Xanthomonas phaseoli pv. manihotis and Xanthomonas cassavae
Molecular Plant Pathology (ISSN 1464-6722)
Article
Read more
.(2021). Comparación de técnicas moleculares para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 o COVID 19.
Comparación de técnicas moleculares para el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 o COVID 19
Thesis
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Bautista D, Guayazan N, Buitrago M, Cardenas M, Botero D, Duitama J, Bernal A, Restrepo S. (2021)
Comprehensive Time-Series Analysis of the Gene Expression Profile in a Susceptible Cultivar of Tree Tomato (Solanum betaceum) During the Infection of Phytophthora betacei
Frontiers in Plant Science (ISSN 1664-462X)
Article
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.(2021). Comunidades sintéticas microbianas, una alternativa prometedora para la agricultura.
Comunidades sintéticas microbianas, una alternativa prometedora para la agricultura
Thesis
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.(2021). Efecto de la exposición a estrés crónico en la expresión de genes asociados al comportamiento ansiogénico sam2 y nlgn1 en pez cebra (Danio rerio).
Efecto de la exposición a estrés crónico en la expresión de genes asociados al comportamiento ansiogénico sam2 y nlgn1 en pez cebra (Danio rerio)
Thesis
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.(2021). Evaluación de efectividad de bacterias promotoras de crecimiento vegetal en la variedad de arroz F67 (Oryza sativa).
Evaluación de efectividad de bacterias promotoras de crecimiento vegetal en la variedad de arroz F67 (Oryza sativa)
Thesis
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.(2021). How to transport lipids: a brief history of patellins.
How to transport lipids: a brief history of patellins
Thesis
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.(2021). Phenotypic and metabolomic changes triggered by beneficial bacteria on cape gooseberry against Fusarium wilt.
Phenotypic and metabolomic changes triggered by beneficial bacteria on cape gooseberry against Fusarium wilt
Thesis
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Zarate C, Osorio D, Mora R, Perez A. L., Dereeper A, Restrepo S, Lopez C, Szurek B, Bernal A. (2021)
TAL effector repertoires of strains of Xanthomonas phaseoli Pv. Manihotis in commercial cassava crops reveal high diversity at the country scale
Microorganisms (ISSN 2076-2607)
Article
Read more
Montenegro N, Alvarez A, Arrieta M, Rodriguez L. M., Botero D, Tabima J, Castiblanco L, Trujillo C, Restrepo S, Bernal A. (2021)
The type VI secretion system of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis is involved in virulence and in vitro motility
BMC Microbiology (ISSN 1471-2180)
Article
Read more
Diaz L, Chaparro Dayanne, Jimenez H, Gomez-Ramirez L, Bernal A, Burbano-Erazo E, Jimenez DJ. (2021)
Top-Down Enrichment Strategy to Co-cultivate Lactic Acid and Lignocellulolytic Bacteria From the Megathyrsus maximus Phyllosphere
Frontiers in Microbiology (ISSN 1664-302X)
Article
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Leidy C, Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Gerson-Dirceu López, Carazzone C, Feussner I, Bernal A, Forero-Shelton Manu, Suesca E. (2020)
Carotenoid Content and Composition in Exponential, Stationary and Biofilm States of Staphylococcus aureus and their Influence on Membrane Biophysical Properties
Biophysical Journal (ISSN 0006-3495)
Article
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Melendez J .(2020). Carotenoids in Bacteria: General Scheme on The Diversity of The Biosynthetic Pathways.
Carotenoids in Bacteria: General Scheme on The Diversity of The Biosynthetic Pathways
Thesis
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Cabrera L .(2020). Control of Botrytis cinerea in roses using biopolymer-based films with essential oils incorporated.
Control of Botrytis cinerea in roses using biopolymer-based films with essential oils incorporated
Thesis
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Cruz L .(2020). De la raíz a la hoja: Capacidad de Bacilos rizosféricos como potenciales inductores de resistencia sistémica (ISR) en plantas de Arabidopsis thaliana.
De la raíz a la hoja: Capacidad de Bacilos rizosféricos como potenciales inductores de resistencia sistémica (ISR) en plantas de Arabidopsis thaliana
Thesis
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Bernal A. (2020)
Effector Repertoire of Phytophthora betacei: In Search of Possible Virulence Factors Responsible for Its Host Specificity
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Article
Read more
Rojas-Estevez P, Urbina D, Ayala D, Guayazan N, Mideros M, Bernal A, Cardenas M, Restrepo S. (2020)
Effector Repertoire of Phytophthora betacei: In Search of Possible Virulence Factors Responsible for Its Host Specificity
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Article
Read more
Scortichini M, Arnold D, Pruvost O, Jacques MA, Bernal A. (2020)
Evolutionary trajectories in plant-associated Pseudomonas and Xanthomonas strains
Evolutionary trajectories in plant-associated Pseudomonas and Xanthomonas strains (ISBN 978-2-88963-700-3)
Other Publication
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Botero D, Monk J, Rodriguez M, Rodriguez A, Restrepo M, Bernal V, Reyes A, Gonzalez A, Palsson B, Restrepo S, Bernal A. (2020)
Genome-Scale Metabolic Model of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis: An Approach to Elucidate Pathogenicity at the Metabolic Level
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Article
Read more
Ramirez E, Dereeper A, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2020)
Resistance and susceptibility to Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in cassava: A transcriptomic comparison (or two sides of the same coin)
Physiological and Molecular Plant Pathology (ISSN 0885-5765)
Article
Read more
Bautista D, Guayazan N, Botero D, Duitama J, Bernal A, Restrepo S.(2020).
Time series transcriptome analysis reveals adaptable activation of defense related genes in tree tomato infected with late blight
Event
Buitrago M, Restrepo S, Bernal A.
Transcriptional Expression Pattern in Effector Genes of Phytophthora betacei
Event
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Rache L, Blondin L, Flores C, Trujillo C, Szurek B, Restrepo S, Koebnik R, Bernal A, Verniere C. (2019)
An Optimized Microsatellite Scheme for Assessing Populations of Xanthomonas phaseoli pv. Manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Read more
Gomez F, Soto J, Restrepo S, Bernal A, Lopez L, Lopez C. (2019)
Gene co-expression network for Xanthomonas-challenged cassava reveals key regulatory elements of immunity processes
European Journal of Plant Pathology (ISSN 0929-1873)
Article
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Diaz-Tatis P, Ochoa J. C., Garcia L. M., Chavarriaga P, Bernal A, Lopez C. (2019)
Interfamily transfer of Bs2 from pepper to cassava (Manihot esculenta Crantz)
Tropical Plant Pathology (ISSN 1983-2052)
Article
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Cruz L .(2019). Microscopía confocal para visualización de localización subcelular e interacción molecular de efectores del patosistema Xam (Xanthomonas axonopodis pv manihotis).
Microscopía confocal para visualización de localización subcelular e interacción molecular de efectores del patosistema Xam (Xanthomonas axonopodis pv manihotis)
Thesis
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Bernal A, Cardenas M, Snoeijenbos M, Guevara-Suarez M, Gutierrez C .(2019). Phytobiomes, The Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together.
Phytobiomes, The Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together
Thesis
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Snoeijenbos M, Cardenas M, Guevara-Suarez M, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2019)
Phytobiomes, the Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together
Annual Plant Reviews online (ISSN 2639-3832)
Article
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Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Feussner I, Bernal A, Forero-Shelton Manu, Leidy C. (2019)
Variations in carotenoid content and acyl chain composition in exponential, stationary and biofilm states of Staphylococcus aureus, and their influence on membrane biophysical properties
Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes (ISSN 0005-2736)
Article
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Villarreal S .(2018). Análisis de la distribución, contexto genómico y evolución del efector XopE4 en diferentes cepas de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Análisis de la distribución, contexto genómico y evolución del efector XopE4 en diferentes cepas de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
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Bernal V, Ochoa J. C., Trujillo C, Rache L, Bernal A, Lopez C. (2018)
Development of a multiplex nested PCR method for detection of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Cassava
Tropical Plant Pathology (ISSN 1983-2052)
Article
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Villarreal S .(2018). Evaluación del efector XopE4 de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis como supresor de la respuesta hipersensible mediada por distintos elicitores.
Evaluación del efector XopE4 de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis como supresor de la respuesta hipersensible mediada por distintos elicitores
Thesis
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Kante M, Blondin L, Flores C, Rache L, Wonni I, Dagno K, Restrepo S, Bernal A, Koebnik R, Verdier V, Koita O, Verniere C, Szurek B. (2018)
MLVA-based diversity analysis of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) populations in Mali
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Leidy C, Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Feussner I, Bernal A, Forero-Shelton Manu.(2018).
Modulation of lipid composition during biofilm formation, and its influence on the membrane biophysical properties of Staphylococcus aureus
Event
Botero D, Alvarado C, Bernal A, Danies G, Restrepo S. (2018)
Network Analyses in Plant Pathogens
Frontiers in Microbiology (ISSN 1664-302X)
Article
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Mideros M, Turissini D, Guayazan N, Ibarra H, Danies G, Cardenas M, Myers K, Tabima J, Goss E, Bernal A, Lagos L, Grajales A, Gonzalez-Garcia L, Cooke D. E. L., Fry W. E., Grunwald N. J., Matute D, Restrepo S. (2018)
Phytophthora betacei, a new species within Phytophthora clade 1c causing late blight on Solanum betaceum in Colombia.
Persoonia (ISSN 0031-5850)
Article
Read more
Zarate C, Rache L, Verniere C, Gagnevin L, Bernal A, Szurek B. (2018)
TALE neighborhood: A genomic approach to picture worldwide TALome diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis
Other Publication
Read more
Medina C, Reyes P, Trujillo C, Gonzalez J, Bejarano D, Montenegro N, Jacobs J, Joe A, Restrepo S, Alfano J, Bernal A. (2018)
The role of type III effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in virulence and suppression of plant immunity
Molecular Plant Pathology (ISSN 1464-6722)
Article
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Rache L, Bernal A, Restrepo S. (2017)
Cellulase and xylanase activities of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) strains collected from different regions of Colombia
J Biotechnol Biomater (ISSN 2155-952X)
Article
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Rache L, Bernal A, Restrepo S.
Cellulase and xylanase activities of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) strains collected from different regions of Colombia
Event
Gonzalez J .(2017). Functional characterization of the suppression of plant immunity mediated by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis type III effector XopAO1.
Functional characterization of the suppression of plant immunity mediated by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis type III effector XopAO1
Thesis
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Gomez D .(2016). A Small Heat Shock Protein Important in Plant Defense is Targeted by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis HpaF Effector.
A Small Heat Shock Protein Important in Plant Defense is Targeted by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis HpaF Effector
Thesis
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Rache L, Flores C, Lopez C, Szurek B, Verniere C, Koebnik R, Restrepo S, Bernal A. (2016)
A strategy to study population variation of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using a new set of multiple-locus variable number tandem repeats
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Medina C .(2016). Elucidation of role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Elucidation of role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Berdugo J .(2016). Genetic Diversity and Association Mapping in Colombian Central Collection of potato (Solanum tuberosum L.) Group Andigenum using SNPs markers.
Genetic Diversity and Association Mapping in Colombian Central Collection of potato (Solanum tuberosum L.) Group Andigenum using SNPs markers
Thesis
Diaz-Tatis P, Zarate C, Bernal A, Lopez C. (2016)
Infección de callo embriogénico friable de yuca con Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam)
Revista Colombiana de Biotecnología (ISSN 0123-3475)
Article
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Soto J, Ortiz J. F., Perlaza L, Vasquez A, Becerra L, Mathew B, Leon J, Bernal A, Ballvora A, Lopez C. (2015)
A genetic map of cassava (Manihot esculenta Crantz) with integrated physical mapping of immunity-related genes
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Article
Read more
Santiago M, Susana C, Mariana R, Alejandro A, Bernal A, Gonzalez A. (2015)
APPLICATIONS OF MOLECULAR DOCKING AND MOLECULAR DYNAMICS ON THE INHIBITION OF QUORUM SENSING SYSTEMS
ADVANCES IN MATHEMATICAL CHEMISTRY AND APPLICATIONS (ISBN 978-1-68108-052-9)
Inbook
Read more
Rache L, Koebnik R, Bernal A.
Analysis of the Population Diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) in Different Regions of Colombia Using VNTRS
Event
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Muñoz A, Cruz L, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2015)
COMPARING INOCULATION METHODS TO EVALUATE THE GROWTH OF Xanthomonas axonopodis pv. manihotis ON CASSAVA PLANTS
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Article
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Florez C, Rache L, Lopez C, Koebnik R, Verdier V, Bernal A, Szurek B.
Characterization of Cassava Bacterial Blight in Venezuela: Diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis ( Xam ) and its Talome
Event
Read more
Zarate C .(2015). Diversity of TALE content in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strains is a valuable tool to improve target gene searching methodologies.
Diversity of TALE content in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strains is a valuable tool to improve target gene searching methodologies
Thesis
Gonzalez J .(2015). Importancia de la triada catalítica del efector XopAO1 en la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Importancia de la triada catalítica del efector XopAO1 en la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
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Gomez F .(2015). Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz.
Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz
Thesis
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Botero D, Gomez F, Alvarez M, Alvarez A, Alvarado C, Zarate C, Gonzalez A, Restrepo S, Bernal A.
Molecular Pathogenicity Networks in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Event
Read more
Botero D, Gomez F, Alvarez M, Alvarez A, Gonzalez A, Restrepo S, Bernal A.
Molecular Pathogenicity Networks in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (5th Xanthomonas Genomics Conference)
Event
Read more
Danies G, Antolinez A, Cantillo J, Peña G, Vargas A, Cardenas M, Bernal A, Fry W. E., Restrepo S. (2015)
Physalis peruviana responses to Phytophthora infestans are typical of an incompatible interaction
CANADIAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY (ISSN 0706-0661)
Article
Read more
Gomez F, Alvarez M, Alvarado C, Zarate C, Jimenez E, Pardo C, Botero D, Gonzalez A, Bernal A.
Reconstruction of Genome-Scale Metabolic Networks of Species of the Genus Xanthomonas with Different Pathogenic Behavior
Event
Read more
Karr J, Williams A, Zucker J, Raue A, Steiert B, Timmer J, Kreutz C, Wilkinson S, Allgood B, Bot B, Hoff B, Kellen M, Covert M, Stolovitzky G, Meyer P, Hu Y, Baron M, Bryson K, Barker B, Bogart E, Wang Y, Chandramohan D, Huang L, Zawack K, Shestov A, Makadia H, Decicco D, Yin A, Wang M, Li S, Swistak M, Cygan M, Kazakiewicz D, Kursa M, Korytkowski P, Plewczynski D, Yang J, Li Y, Tang H, Wang T, Liu Y, Xie Y, Xiao G, Bello J, Botero D, Cañas S, Castro J, Gomez F, Valdes I, Gonzalez L, Bernal A, Pedraza J, Restrepo S, Reyes A. (2015)
Summary of the DREAM8 Parameter Estimation Challenge: Toward Parameter Identification for Whole-Cell Models
PLoS Computational Biology (ISSN 1553-734X)
Article
Read more
Trujillo C, Ochoa J. C., Mideros M, Restrepo S, López C. E., Bernal A. (2014)
A Complex Population Structure of the Cassava Pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Recent Years in the Caribbean Region of Colombia
MICROBIAL ECOLOGY (ISSN 0095-3628)
Article
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Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2014).
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Event
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Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Lozano G, Vasquez J. J., Myers K, Fry W. E., Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2014)
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Gene (ISSN 0378-1119)
Article
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Tenjo F. J., Bello J, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Garavito M.F, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2014).
Evaluation of a Possible Metabolic Regulation in Pyrimidine Biosynthesis in Phytophthora infestans and Solanum tuberosum: the case of Aspartate Transcarbamoylase and Uridine Monophosphate Synthase
Event
Bernal V .(2014). Genome-wide identification of small non-coding RNAs related with quorum sensing and virulence in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Genome-wide identification of small non-coding RNAs related with quorum sensing and virulence in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Rodriguez A .(2014). Identification of HrpG and RpfCGH-regulated genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.
Identification of HrpG and RpfCGH-regulated genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Bernal A. (2014)
Maestría en Biología Computacional: una apuesta de Uniandes al futuro de la ciencia en el país
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Article
Trujillo C, Arias N, Poulin L, Medina C, Tapiero A, Restrepo S, Koebnik R, Bernal A. (2014)
Population typing of the causal agent of cassava bacterial blight in the Eastern Plains of Colombia using two types of molecular markers
BMC Microbiology (ISSN 1471-2180)
Article
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Garavito M.F, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2014).
Pyrimidine salvage pathways: Uracil Phosphoribosyltransferases of Phytophthora infestans and Solanum tuberosum
Event
Bernal A. (2014)
RNA-seq data analysis in prokaryotes: A review for non-experts
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Article
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Muñoz A, Perez A. L., Gomez F, Gil J, Michelmore R, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2014)
RNAseq analysis of cassava reveals similar plant responses upon infection with pathogenic and non-pathogenic strains of Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis
PLANT CELL REPORTS (ISSN 0721-7714)
Article
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Perez M, Trier S, Bernal A, Vargas-zambrano J, Herrfurth C, Feussner I, Gonzalez J, Leidy C. (2014)
S. Aureus Adapt to Growth Conditions by Changing Membrane Order
Biophysical Journal (ISSN 0006-3495)
Article
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Botero D, Restrepo S, Bernal A, Gonzalez A.
THE Xanthomonas axonopodis pv. manihotis PATHOGENESIS UNCOVER BY METABOLIC NETWORKS
Event
Diaz P, Bernal A, Lopez C. (2014)
Transient GUS gene expression in cassava (Manihot esculenta Crantz) using Agrobacterium tumefaciens leaf infiltration
Revista MVZ Cordoba (ISSN 0122-0268)
Article
Bello J, Tenjo F. J., Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S, Garavito M.F.(2013).
Cloning and expression of the pyrimidine enzymes aspartate transcarbamoylase and uridine synthase of an oomycete plant pathogen
Event
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Perlaza L .(2013). Deconstructive Evolutionary Pipeline (DeEP) Implemented to Find Genes Responsible for Pathogenic Behavior in Xanthomonas Genus.
Deconstructive Evolutionary Pipeline (DeEP) Implemented to Find Genes Responsible for Pathogenic Behavior in Xanthomonas Genus
Thesis
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Developing a taxonomic identification system of Phytophthora species based on microsatellites Artículo completo 2013
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Article
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Medina C, Bernal A. (2013)
El uso de nuevas tecnologías de la genómica para defender nuestros cultivos
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Article
Ramirez J .(2013). Evaluación de la redundancia en el papel de algunos efectores de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en la virulencia frente a yuca y en respuesta no hospedero.
Evaluación de la redundancia en el papel de algunos efectores de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en la virulencia frente a yuca y en respuesta no hospedero
Thesis
Trujillo C .(2013). Genetic structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis populations in two cassava producer regions in Colombia and characterization of an effector protein.
Genetic structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis populations in two cassava producer regions in Colombia and characterization of an effector protein
Thesis
Arrieta M, Rodriguez L. M., Perez A. L., Poulin L, Diaz A, Arias N, Trujillo C, Restrepo M, Bart R, Boch J, Boureau T, Darrasse A, Perrine D, Dugé de Bernonville T, Fontanilla P, Gagnevin L, Guérin F, Jacques M, Lauber E, Lefeuvre P, Medina C, Edgar M. Medina, Montenegro N, Muñoz A, Noël L. D., Ortiz J. F., Osorio D, Pardo C, Patil P. B., Poussier S, Pruvost O, Robène Soustrade I, Ryan R, Tabima J, Urrego O, Vernière C, Carrere S, Verdier V, Szurek B, Restrepo S, López C. E., Koebnik R, Bernal A. (2013)
Genomic Survey of Pathogenicity Determinants and VNTR Markers in the Cassava Bacterial Pathogen Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis Strain CIO151
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Article
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Romero J .(2013). Las propiedades térmicas y mecánicas de las membranas bacterianas influencian la actividad de los agentes antimicrobiales que atacan la membrana.
Las propiedades térmicas y mecánicas de las membranas bacterianas influencian la actividad de los agentes antimicrobiales que atacan la membrana
Thesis
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Ospina M .(2013). Microorganismos endófitos causantes del deterioro post cosecha primario en yuca (Manihot esculenta Crantz), una teoría olvidada..
Microorganismos endófitos causantes del deterioro post cosecha primario en yuca (Manihot esculenta Crantz), una teoría olvidada.
Thesis
Cespedes M, Cardenas M, Vargas A, Rojas A, Morales J. B. , Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2013)
Physiological and molecular characterization of Phytophthora infestans isolates from the Central Colombian Andean Region
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Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis Ramírez AM. (2013)
Seborrheic dermatitis: predisposing factors and ITS2 secondary structure for Malassezia phylogenic analysis
Medical Mycology (ISSN 1369-3786)
Article
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Castiblanco L, Gil J, Rojas A, Osorio D, Gutiérrez S, Muñoz A, Perez A. L., Koebnik R, Szurek B, López C, Restrepo S, Verdier V, Bernal A. (2013)
TALE1 from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis acts as a transcriptional activator in plant cells and is important for pathogenicity in cassava plants
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Article
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Tell Me a Tale of TALEs
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Article
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Caracterización de aislamientos de Malassezia spp. a partir de individuos con dermatitis seborreica
VIII Encuentro Nacional de Investigación en Enfermedades Infecciosas
Inproceeding
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Verdier V, Lopez C, Bernal A. (2012)
Cassava Bacterial Blight, Caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Cassava In The Third Millennium. Modern Production, Processing, Use And Marketing Systems (ISBN 978-958-694-112-9)
Inbook
López C. E., Bernal A. (2012)
Cassava Bacterial Blight: Using Genomics for the Elucidation and Management of an Old Problem
Tropical Plant Biology (ISSN 1935-9756)
Article
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Characterization of cellulases of fungal endophytes isolated from Espeletia spp.
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Article
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Bello J, Tenjo F. J., Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2012).
Cloning and Expression of the pyrimidine enzymes uridine monophosphate synthetase (UMP) and aspartate carbamoyltransferase (ATC) of an Oomycete
Event
Trujillo C, Medina C, Restrepo S, López C. E., Bernal A.
Comparison of diversity and population structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis between two cassava growing regions in Colombia
Event
Cardenas M, Tabima J, Fry W. E., Grunwald N. J., Bernal A, Restrepo S. (2012)
Defining species boundaries in the genus Phytophthora: the case of Phytophthora andina A response to Phytophthora andina sp nov., a newly identified heterothallic pathogen of solanaceous hosts in the Andean highlands' (Oliva et al., 2010)
Plant Pathology (ISSN 0032-0862)
Article
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Osorio D, Rodriguez L. M., Perez A. L., Trujillo C, Lopez C, Koebnik R, Szurek B, Restrepo S, Bernal A.
Determination of the genetic and functional diversity of TAL effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Event
Bernal A. (2012)
Determination of the virulence activity of the type three effectors avrBs2, hpaF and xopZ from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Cassava
Inproceeding
Guevara-Suarez M, Sopo L, Motta A, Tabima J, M. C. Cepero de García, García A, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Especies de Fusarium asociadas con onicomicosis en Colombia
VIII Encuentro Nacional de Investigación en Enfermedades Infecciosas
Inproceeding
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Bernal A. (2012)
Expressing diverse versions of disease resistance proteins for protection against cassava bacterial blight
Inproceeding
Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Fusarium species associated with onychomycoses in Colombia.
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Genomes-based phylogeny of the genus Xanthomonas
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Article
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High-throughput genomic sequencing of cassava bacterial blight strains identifies conserved effectors to target for durable resistance
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (ISSN 0027-8424)
Article
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Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2012).
Metabolismo de pirimidinas en Phytophthora infestans: Búsqueda de estrategias comunes para el control de patógenos Oomycetes como Phytophthora infestans basados en los blancos para el control de parásitos apicomplexa.
Event
Mideros M, Bastidas J, Castillo Y. V., Lagos L, Bernal A, Restrepo S. (2012)
Pathogenicity and aggressiveness of isolates belonging to a new Phytophthora infestans sensu lato population in Colombia
Annual Meeting of the American Phytopathological Society
Inproceeding
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Muñoz A, Guevara-Suarez M, Amado Y, Bocanegra L, Sopo L, Motta A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Phylogenetic relationship of Malassezia species isolated from seborrheic dermatitis
18th Congress of the International Society for Human and Animal Mycology
Inproceeding
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Cardenas M, Danies G, Tabima J, Bernal A, Restrepo S. (2012)
Phytophthora infestans population structure: A worldwide scale
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
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Hurtado V, Trujillo C, Ocampo J, Restrepo S, Bernal A. (2012)
Plausible role of the interactions between the effector HpaF of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis and Manihot esculenta proteins in the plant defense system
Inproceeding
Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2012).
Preliminary biochemical characterization of the pyrimidine salvage pathway enzyme uracil phosphoribosyltransferase in the plant pathogen Phytophthora infestans and its host Solanum tuberosum
Event
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2012).
Pyrimidine metabolism in Phytophthora infestans: new control strategies based on targets used to control apicomplexan parasites
Event
Bernal A.
Role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in the virulence towards cassava.
Event
Bernal A. (2012)
Structure and Diversity of colombian populations of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis, the causal agent of cassava bacterial blight. Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Inproceeding
Tabima J, Mideros M, Bernal A, Jiménez P, Riaño D, Grunwald N. J., Restrepo S. (2012)
The dynamics of evolution in Phytopththora infestans as told by phylogeographical approaches.
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Vargas N, Bernal A, Sarria V, Franco A, Restrepo S. (2011)
Amatoxin and phallotoxin composition in species of the genus Amanita in Colombia: A taxonomic perspective
Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology (ISSN 0041-0101)
Article
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Gonzalez A, Borrero A, Bernal A. (2011)
Applications of Molecular Docking and Molecular Dynamics on the Inhibition of Quorum Sensing Systems: The Case of Indol and 3-OH PAME
Other Publication
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Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Zimmermann B.H, Restrepo S.(2011).
Biochemical characterization of recombinant Dihydroorotate dehydrogenase from the plant pathogenic Oomycete Phytophthora infestans
Event
Reyes P, Restrepo S, Bernal A. (2011)
Cassava's immunity suppression mediated by Type III effectors of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garavito M.F, Hortua M, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.H.(2011).
Common strategies for controlling human Apicomplexan parasites and agricultural Oomycete pathogens such as Phytophthora infestans
Event
Trujillo C, Restrepo S, López C. E., Bernal A. (2011)
Diversity and population dynamics of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Colombia from 2008 to 2010
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Cardenas M, Medina E, Tabima J, Bernal A, Restrepo S, C. A. Lopera. (2011)
First Report of Phytophthora infestans Causing Late Blight on Solanum viarum in Colombia
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First report of Fusarium oxysporum causin potato dry rot in solanum tuberosum in colombia
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Cardenas M, Tabima J, Vargas A, C. A. Lopera, Bernal A, Restrepo S. (2011)
First report of Phytophthora infestans causing Late blight in the wild Solanaceae, Solanum viarum, in Colombia
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Article
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Cardenas M, Grajales A, Sierra R, Rojas A, González A, Vargas A, Marín M, Fermín, Lagos, Grunwald N. J., Bernal A, Salazar C, Restrepo S. (2011)
Genetic diversity of Phytophthora infestans in the Northern Andean region
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Mideros Y, Castillo Y, Obando C, Cardenas M, Lagos L, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
Genetic structure and patogenicity of Phytophthora infestans sensu lato collected from Solanum betaceum in southwestern Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
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Garcia-Bayona L, Grajales A, Cardenas M, Sierra R, Lozano G, Garavito M.F, M. C. Cepero de García, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
Isolation and characterization of two strains of Fusarium oxysporum causing potato dry rot in Solanum tuberosum in Colombia.
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
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LA PROTEÍNA PTHB DE Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis ES AUTOACTIVA EN ENSAYOS DE DOBLE HÍBRIDO
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Phylogeography and molecular epidemiology of Papaya ringspot virus
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Restrepo M, Restrepo S, Bernal A. (2011)
RpfG interaction in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
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Pinzon A, Rodriguez L. M., Gonzalez A, Bernal A, Restrepo S, Gonzalez A. (2011)
Targeted metabolic reconstruction: a novel approach for the characterization of plant-pathogen interactions
Briefings in Bioinformatics (ISSN 1467-5463)
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Cai R, Lewis J, Yan S, Liu H, Clarke C, Campanile F, Almeida N, Studholme D, Lindeberg M, Schneider D, Zaccardelli M, Setubal J, Morales N, Bernal A, Coaker G, Baker C, Bender C, Leman S, Vinatzer B. (2011)
The Plant Pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato Is Genetically Monomorphic and under Strong Selection to Evade Tomato Immunity
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The PthB protein from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis is an autoactive in yeast two-hybrid assays
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
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Uracil Phosphoribosyltransferase inhibition as a complementary target for Phytophthora infestans control
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Patiño A, Amado Y, M. C. Cepero de García, Chaves D, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis Ramírez AM. (2011)
Virulence Gene Expression in Malassezia spp from Individuals with Seborrheic Dermatitis
Journal of Investigative Dermatology (ISSN 0022-202X)
Article
Read more
Arrieta M, Rodriguez L. M., Restrepo S, Koebnik R, Bernal A. (2010)
A bioinformatic study of pathogenicity factors in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
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Gorrón E, Rodríguez F, Bernal D, Rodriguez L. M., Bernal A, Restrepo S, Tohme J. (2010)
A new method for designing degenerate primers and its use in the identification of sequences in Brachiaria showing similarity to apomixis-associated genes
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Bacterial Phylogenomics Revisited: A Case study for the Xanthomonas genus
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Antolinez A, Danies G, Peña A, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Biochemical and microscopical study of Phytophthora infestans process of infection on Physalis peruviana
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Discovery of Phytophthora infestans Genes Expressed in Planta through Mining of cDNA Libraries
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Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B.H, Restrepo S. (2010)
Expression and homology modeling of Dihydroorotate dehydrogenase from the phytopathogenic Oomycete Phytophthora infestans
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Physalis peruviana natural reservoir for Phytophthora infestans in the field
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Phytophthora infestans oospores: Production and viability in Colombia
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Characterization of Phytophthora infestans Populations in Colombia: First Report of the A2 Mating Type
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Characterization of effector proteins in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
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Pinzon A, Barreto E, Bernal A, Achenie L, Gonzalez A, Isea R, Restrepo S. (2009)
Computational models in plant-pathogen interactions: the case of Phytophthora infestans
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Buitrago F, Sierra R, Grajales A, Rodriguez L, Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2009)
Estudio comparativo de promotores de la Chalcón Sintasa en diferentes familias de plantas
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Identification of pathogenic effectors in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using a genetic screen.
XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
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Garcia-Bayona L, Grajales A, Sierra R, Cardenas M, Avila L, M. C. Cepero de García, Restrepo S, Bernal A. (2009)
Isolation and characterization of Fusarium oxysporum causing potato dry rot in Solanum tuberosum in Colombia - año 2009
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
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Molecular diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in three different agroecological regions in the Caribbean region of Colombia
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Morphological and molecular characterization of the antagonistic interaction between the endophyte Diaporthe sp isolated from frailejon (Espeletia sp.) and the plant pathogen Phytophthora infestans
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
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Ryan R, Koebnik R, Szurek B, Boureau T, Bernal A, Bogdanove A, Dow J. (2009)
Passing GO (gene ontology) in plant pathogen biology: a report from the Xanthomonas Genomics Conference
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Sierra R, Cardenas M, Grajales A, Rodriguez L. M., Bernal A, Restrepo S. (2009)
Using bioinformatics in the characterization of novel putative virulence determinants of Phytophthora infestans expressed in planta
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
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Virtual Screening of Quenchers for the Signal 3-Hydroxypalmitic Acid Methyl Ester in Ralstonia Solanacearum
2009 AIChE Annual Meeting: Nashville, TN
Inproceeding
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Bernal A, Yoo C, Mutwil M, Jensen J, Hou G, Blaukopf C, Sorensen I, Blancaflor E, Scheller H, Willats W. (2008)
Functional Analysis of the Cellulose Synthase-Like Genes CSLD1, CSLD2, and CSLD4 in Tip-Growing Arabidopsis Cells
Plant Physiology (ISSN 0032-0889)
Article
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Sierra R, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2008)
Gene expression profiling of the infection of yellow potato (Solanum phureja) by Phytophthora infestans
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Jensen J, Sorensen S, Harholt J, Geshi N, Sakuragi Y, Moller I, Zandleven J, Bernal A, Jensen N, Pauly M, Beldman G, Willats W, Scheller H. (2008)
Identification of a xylogalacturonan xylosyltransferase involved in pectin biosynthesis in Arabidopsis
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Gutiérrez S, Rodriguez L. M., Pardo C, Pinzón D, Morales N, Restrepo S, Bernal A. (2008)
Identification of effector genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using bioinformatics and a forward genetics screen
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
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Castiblanco L, Trujillo C, Alfonso N, López C. E., Szurek B, Verdier V, Restrepo S, Bernal A. (2008)
Molecular characterization of virulence and pathogenicity determinants in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
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Rojas A, Sierra R, González A, Vargas A, Cardenas M, Fermín, Lagos L, Bernal A, Restrepo S, Salazar C. (2008)
Study of the genetic diversity of Phytophthora infestans isolates from the Northern Andean region using seven genic regions
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
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Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2007)
Appearance of the mating type A2 in a population of Phytophthora infestans from six species of the Solanaceae family in the Cundinamarca - Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Bernal A, Jensen J, Harholt J, Sorensen S, Moller I, Blaukopf C, Johansen B, De R, Pauly M, Scheller H, Willats W. (2007)
Disruption of AtCslD5 results in reduced growth, reduced Xylan and Homogalacturonan synthase activity and altered Xylan occurrence in Arabidopsis
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Article
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Vargas A, Correa A, Lozano D, Bernal A, Restrepo S, Jiménez P, González A. (2007)
First report of late blight caused by Phytophthora infestans on Cape gooseberry (Physalis peruviana) in Colombia.
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Article
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Moller I, Sorensen I, Bernal A, Blaukopf C, Lee S, Obro J, Pettolino F, Roberts A, Mikkelsen J, Knox J, Bacic A, Willats W. (2007)
High-throughput mapping of cell-wall polymers within and between plants using novel microarrays
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Article
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Barriga C, Pinzon A, Szurek B, González A, Morales N, Restrepo S, Bernal A, Verdier V. (2007)
Identification of pathogenicity determinants in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using comparative genomic tools
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Carreño N, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2007)
Problemas fitopatológicos en especies de la familia Solanaceae causados por los géneros Phytophthora, Alternaria y Ralstonia en Colombia
Agronomía Colombiana (ISSN 0120-9965)
Article
Tapiero A, Garnica D, Gordillo M, Bernal A, Restrepo S. (2006)
Molecular and pathogenic variability in colombian isolates of Phytophthora sojae
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garnica D, Pinzon A, Quesada L, Bernal A, Restrepo S, Barreto E. (2006)
Molecular markers a la carte: Exploiting genomic databases for the generation of tools for understanding of Phytophthora spp. populations
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Pinzon A, Garnica D, Quesada L, Bernal A, Barreto E, Grunwald N. J., Restrepo S. (2006)
Survey and analysis of microsatellites from transcript sequences in Phytophthora species: frequency, distribution, and potential as markers for the genus
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Article
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Bernal A, Pan Q, Pollack J, Rose L, Kozik A, Willits N, Luo Y, Guittet M, Kochetkova E, Michelmore R. (2005)
Functional analysis of the plant disease resistance gene Pto using DNA shuffling
Journal of Biological Chemistry (ISSN 0021-9258)
Article
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Manfield I, Bernal A, Moller I, Mccartney L, Riess N, Knox J, Willats W. (2005)
Re-engineering of the PAM1 phage display monoclonal antibody to produce a soluble, versatile anti-homogalacturonan scFv
PLANT SCIENCE (ISSN 0168-9452)
Article
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Manfield I, Orfila C, Mccartney L, Harholt J, Bernal A, Scheller H, Gilmartin P, Mikkelsen J, Knox J, Willats W. (2004)
Novel cell wall architecture of isoxaben-habituated Arabidopsis suspension-cultured cells: global transcript profiling and cellular analysis
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Article
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Bernal A, Willats W. (2004)
Plant science in the age of phage
Trends in Plant Science (ISSN 1360-1385)
Article
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Chang J, Tai Y, Bernal A, Lavelle D, Staskawicz B, Michelmore R. (2002)
Functional analyses of the Pto resistance gene family in tomato and the identification of a minor resistance determinant in a susceptible haplotype
Molecular Plant-Microbe Interactions (ISSN 0894-0282)
Article
Suarez M, Bernal A, Gutiérrez J, Tohme J, Fregene M. (2000)
Developing expressed sequence tags (ESTs) from polymorphic transcript-derived fragments (TDFs) in cassava (Manihot esculenta Crantz)
Genome / National Research Council Canada = Genome / Conseil national de recherches Canada (ISSN 0831-2796)
Article
Chang J, Rathjen J, Bernal A, Staskawicz B, Michelmore R. (2000)
avrPto enhances growth and necrosis caused by Pseudomonas syringae pv. tomato in Tomato lines lacking either Pto or Prf
Molecular Plant-Microbe Interactions (ISSN 0894-0282)
Article

Degrees

  • Doctor Of Philosophy In Plant Pathology

    Doctoral degree

    University Of California

    2003

    Estados Unidos

    Microbióloga

    Bachelor degree

    Universidad De Los Andes, Colombia

    1994

    Colombia

Projects

  • 2021
    • Explorando los microbiomas de suelos asociados con sistemas agrícolas contrastantes y la diversidad de aislamientos de la roya del café en Colombia

      Duration: 45 months

      PR.6.2021.8007

      En este proyecto se pretende evaluar el impacto de la agricultura en la diversidad bacteriana del suelo yla influencia de diferentes prácticas agronómicas en él, utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento en sistemas de cultivos de café, yuca, Sacha-Inchi y tomate de árbol en Colombia. De igual forma se pretende estudiar la diversidad molecular de la roya del café causada por el hongo Hemileia vastatrix, utilizando también secuenciación de tercera generación.

  • 2020
    • Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en Colombia

      Duration: 18 months

      PR.6.2020.7087

      La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

      Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis en el Caribe Colombiano

      Duration: 18 months

      PR.6.2020.7107

      La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

    • Portable, Low-cost Hardware for De-centralized COVID-19 Diagnostics

      Duration: 12 months

      PR.2.2020.7907

      We propose to develop and validate the molecular tools and hardware needed for the decentralized, high capacity diagnostic and serological testing needed to respond to the COVID-19 crisis.With the peak infection hopefully past, attention is turning to the tools that will be needed to re-start our economy and for life to return to normal. Two capabilities are key for this to happen: 1) De-centralized diagnostic testing for SARS-CoV-2 to prevent a resurgence of infection and 2) Serological testing to test population antibody-levels and allow for strategic use of precious, future vaccine stocks. There has yet to be a means to de-centralize this capacity for the widespread surveillance needed. Here we propose to adapt our low-cost portable plate reader for high capacity and distributed testing with our rapid molecular test (RT-LAMP) for the SARS-CoV-2 genome (15 min) and our related ELISA-based antibody test.

  • 2019
    • Construccion de consorcios microbianos lignoceluloliticos

      Duration: 48 months

      PR.6.2019.6828

      La producción de diferentes tipos de biocompuestos a partir de biomasa vegetal ha impactado la economía mundial en la última década. Específicamente, los residuos agrícolas han sido considerados como una excelente fuente de energía renovable para la generación de químicos orgánicos. Sin embargo, uno de los cuellos de botella en estos bioprocesos es la ineficiente sacarificación enzimática de los polisacáridos vegetales. Generalmente, esto se debe a la naturaleza compleja y recalcitrante de los polímeros que conforman la pared celular de las plantas (i.e. lignocelulosa). La degradación de biomasa vegetal es un proceso metabólico llevado a cabo principalmente por bacterias y hongos en la naturaleza. Sin embargo, aún existe poco entendimiento acerca de la eco-enzimología de este proceso dentro comunidades microbianas. Este proyecto se enfocará en la construcción y análisis de consorcios microbianos lignocelulolíticos derivados de suelo de bosque. El método de enriquecimiento estará acoplado a un método de selección (e.g. dilution-to-extinction) con el fin de obtener un consorcio mínimo eficiente. Durante la construcción de los consorcios, análisis (meta)ómicos y enzimáticos se realizarán con el fin de evaluar la diversidad, dinámicas y funcionalidad de las comunidades microbianas seleccionadas.

      Socio-cultural dynamics associated with the propagation of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) in cassava crops in the Colombian Caribbean

      Duration: 43 months

      PR.6.2019.6947

      La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo fundamental para la seguridad alimentaria de millones de personas en el mundo. En Colombia, la región Caribe contribuye a aproximadamente la mitad de la producción nacional, a pesar de los problemas socioeconómicos y políticos de la región como la propiedad de la tierra, las dinámicas de comercialización, el conflicto armado, el cambio climático y los problemas fitosanitarios. La más grande amenaza para lograr una producción estable es la bacteriosis vascular (en inglés, Cassava Bacterial Blight -CBB), que es una enfermedad causada por el patógeno Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) capaz de causar daños irreversibles a la planta, impidiendo su crecimiento y productividad. Considerando que la yuca es principalmente propagada por estacas que son intercambiadas entre los campesinos, en este estudio se pretende analizar el impacto de las dinámicas socioculturales asociadas con las prácticas de manejo en la dispersión de CBB en cultivos de yuca en el Caribe Colombiano, tomando como caso de estudio los municipios de la subregión de Sabanas en el departamento de Córdoba. Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

  • 2016
    • Diversidad genética de las poblaciones y análisis de la actividad celulolítica de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis

      Duration: 87 months

      PR.6.2016.3767

      Una de las enfermedades que conlleva pérdidas en los cultivos de yuca es el añublo bacteriano causado por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Desde 1990 se han realizado diferentes estudios analizando la diversidad genética de las poblaciones de Xam y se reportó alta diversidad poblacional y cambio rápido en el tiempo. La alta diversidad de Xam ha conllevado a la pérdida de resistencia de las variedades de yuca cultivadas y a la necesidad de desarrollar nuevas estrategias para controlar la enfermedad. Además, los estudios muestran la importancia de analizar continuamente las dinámicas poblaciones. El objetivo de este estudio es utilizar análisis de repeticiones en tándem de número variable (VNTRs) para caracterizar poblaciones de Xam y analizar si se conserva alta diversidad de poblaciones en la localidad de Chinú-Colombia. Para desarrollar el estudio, las cepas de Xam colectadas en la localidad de Chinú durante el 2014 y las cepas más diversas encontradas en los estudios de los 90s y 2008 a 2010, serán analizadas utilizando primers para amplificar 4 loci minisatelites y 18 loci microsatélites. Los resultados del proyecto permitirán evaluar la técnica de VNTRs previamente estandarizada y analizar la diversidad de Xam en el tiempo en la localidad de Chinú. 

  • 2007
    • Identificación y análisis de genes de la virulencia en Xanthomonas campestris pv.manihotis.

      Duration: 36 months

      PR.3.2005.61.abernal