Adriana Jimena Bernal Giraldo

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Adriana Jimena Bernal Giraldo

Adriana Jimena Bernal Giraldo

Doctor Of Philosophy In Plant Pathology

abernal @uniandes.edu.co

Profesor Asociado

Departamento de Ciencias Biológicas

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Recent Courses

  • 2020
    • PASANTÍA SEMESTRAL

      First period
      Master Level

      TESIS 4 CR

      First period
      Master Level

Recent Products

Leidy C, Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Gerson-Dirceu López, Carazzone C, Feussner I, Bernal A, Forero A, Suesca E. (2020)
Carotenoid Content and Composition in Exponential, Stationary and Biofilm States of Staphylococcus aureus and their Influence on Membrane Biophysical Properties
Biophysical Journal (ISSN 0006-3495)
Article
Rojas-Estevez P, Urbina D, Ayala D, Guayazan N, Mideros M, Bernal A, Cardenas M, Restrepo S. (2020)
Effector Repertoire of Phytophthora betacei: In Search of Possible Virulence Factors Responsible for Its Host Specificity
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Article

Recent Degrees

Doctor Of Philosophy In Plant Pathology

Doctoral degree

University Of California

2003

Estados Unidos

Microbióloga

Bachelor degree

Universidad De Los Andes

1994

Colombia

Recent Projects

  • 2020
    • Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en Colombia

      Duration: 18 months

      PR.6.2020.7087

      La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

      Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis en el Caribe Colombiano

      Duration: 18 months

      PR.6.2020.7107

      La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

Courses

  • 2020
    • PASANTÍA SEMESTRAL

      First period
      Master Level

      TESIS 4 CR

      First period
      Master Level
    • POYECTO DE PROFUNDIZACIÓN

      First period
      Master Level

      TESIS 2 - 4 CR

      First period
      Master Level
    • TESIS 8 CR

      First period
      Master Level

      TESIS MAESTRÍA 1

      First period
      Master Level
    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 5

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 8

      First period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.

      First period
      Master Level
    • PASANTÍA ESTUD. EXT. MAESTRÍA

      First period
      Master Level

      PASANTÍA DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level
    • PASANTÍA DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA 1

      First period
      Doctoral Level
    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRÍA 2

      First period
      Master Level
    • PASANTÍA DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level
    • PASANTÍA 2

      First period
      Doctoral Level

      PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level
    • PROYECTO MAESTRÍA

      First period
      Master Level

      PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACIÓN

      First period
      Master Level
    • SUSTENTACIÓN DE TESIS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 9

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      First period
      Doctoral Level
    • BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

      TESIS 2 - 8 CR

      First period
      Master Level
    • TESIS DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTÍA ESTUDIANTES EXTERNOS

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 11

      First period
      Doctoral Level
    • PASANTÍA ESTUDIANTES EXTERNOS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRÍA 2

      Interseminal period
      Master Level
    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 10

      First period
      Doctoral Level

      BIOLOGÍA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level
    • TESIS MAESTRÍA 1

      Interseminal period
      Master Level

      PASANTÍA ESTUD. EXT. MAESTRÍA

      Second period
      Master Level
    • PASANTÍA DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTÍA 1

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTÍA 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 3

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 8

      Second period
      Doctoral Level

      PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACIÓN

      Second period
      Master Level
    • PROYECTO MAESTRÍA

      Interseminal period
      Master Level

      TESIS MAESTRÍA 2

      Second period
      Master Level
    • PASANTÍA DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTÍA 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTÍA 2

      Second period
      Doctoral Level
    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTÍA DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 4

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 5

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 10

      Second period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level
    • SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 2

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level

      BACTERIOLOGÍA-TEO

      Second period
      Bachelor Level
    • PASANTÍA DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 6

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PROYECTO MAESTRÍA

      Second period
      Master Level
    • TESIS MAESTRÍA 1

      Second period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 9

      Second period
      Doctoral Level
    • SUSTENTACIÓN DE TESIS

      Interseminal period
      Doctoral Level

      SEMIN.INVESTIGACIÓN DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 5

      Second period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACIÓN L.D.

      Second period
      Master Level
  • 2019
    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

      BACTERIOLOGIA-TEO

      Second period
      Bachelor Level
    • TESIS DOCTORADO 1

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 4

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 5

      First period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRIA 1

      First period
      Master Level
    • PASANTIA DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      First period
      Doctoral Level
    • PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      First period
      Master Level

      PASANTIA DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 2

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 3

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 8

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      First period
      Doctoral Level
    • PASANTIA ESTUDIANTES EXTERNOS

      First period
      Doctoral Level

      INTERAC.MOLEC.PLANTA PATOGENO

      First period
      Master Level
    • BACTERIOLOGIA-TEO

      First period
      Bachelor Level

      PASANTIA DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • PASANTIA 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTIA 1

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 6

      Interseminal period
      Doctoral Level

      BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level
    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level

      PASANTIA DOCTORADO

      First period
      Doctoral Level
    • PASANTIA 1

      First period
      Doctoral Level

      PASANTIA 2

      First period
      Doctoral Level
    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      First period
      Doctoral Level

      PROYECTO MAESTRIA

      First period
      Master Level
    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      First period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 9

      First period
      Doctoral Level
    • PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      Second period
      Master Level

      PROYECTO MAESTRIA

      Interseminal period
      Master Level
    • TESIS MAESTRIA 2

      Second period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 5

      Second period
      Doctoral Level
    • SUSTENTACION DE TESIS

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 3

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 5

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 8

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 10

      Second period
      Doctoral Level
    • PROYECTO MAESTRIA

      Second period
      Master Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Interseminal period
      Master Level
    • PASANTIA DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA 2

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTIA 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level
    • SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS MAESTRIA 2

      First period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 9

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 7

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 10

      First period
      Doctoral Level

      SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      First period
      Doctoral Level
    • TESIS MAESTRIA 2

      Interseminal period
      Master Level

      PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTIA DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Second period
      Master Level
    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      Interseminal period
      Doctoral Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      Second period
      Master Level
    • PASANTIA DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 2

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 4

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTIA ESTUDIANTES EXTERNOS

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTIA ESTUD. EXT. MAESTRIA

      First period
      Master Level

      TESIS DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTIA ESTUD. EXT. MAESTRIA

      Second period
      Master Level
  • 2018
    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

      BACTERIOLOGIA-TEO

      First period
      Bachelor Level
    • PASANTIA DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 2

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 10

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA ESTUDIANTES EXTERNOS

      Second period
      Doctoral Level
    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level
    • EXAMEN DE CANDIDATURA

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 8

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 9

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS MAESTRIA 2

      Interseminal period
      Master Level

      PROYECTO MAESTRIA

      Interseminal period
      Master Level
    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

      BACTERIOLOGIA-TEO

      Second period
      Bachelor Level
    • PROYECTO DE TESIS DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • SUSTENTACIÓN DE TESIS 1

      Second period
      Doctoral Level

      EXAMEN DE CANDIDATURA

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 3

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 4

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 5

      Second period
      Doctoral Level

      PASANTIA DOCTORADO 2

      Second period
      Doctoral Level
    • PASANTIA 1

      Interseminal period
      Doctoral Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Interseminal period
      Master Level
    • PASANTIA 1

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 6

      Second period
      Doctoral Level
    • TESIS DOCTORADO 7

      Second period
      Doctoral Level

      SUSTENTACION DE TESIS

      Second period
      Doctoral Level
    • PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      Interseminal period
      Master Level

      PASANTIA DOCTORADO

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • PASANTIA 2

      Interseminal period
      Doctoral Level

      PASANTIA 2

      Second period
      Doctoral Level
    • EXAMEN CONOCIMIENTOS

      Second period
      Doctoral Level

      TESIS DOCTORADO 1

      Interseminal period
      Doctoral Level
    • PROYECTO MAESTRIA

      Second period
      Master Level

      PROFUNDIZAC. EN INVESTIGACION

      Second period
      Master Level
    • TESIS MAESTRIA 2

      Second period
      Master Level

      TESIS MAESTRIA 1

      Second period
      Master Level
  • 2017
    • BIOLOGIA MOLECULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level
  • 2014
    • INTERAC.MOLEC.PLANTA PATOGENO

      First period
      Master Level

      SEMINARIOS INVESTIGACION L.D.

      First period
      Master Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      First period
      Doctoral Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      Second period
      Doctoral Level
    • SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.1

      First period
      Doctoral Level

      SEMIN.INVESTIGACION DOC. L.D.2

      Second period
      Doctoral Level
    • FITOPATOLOGIA-TEO

      First period
      Bachelor Level

      BIOLOGIA CELULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level
  • 2013
    • BIOLOGIA CELULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level

      FITOPATOLOGIA-TEO

      First period
      Bachelor Level
    • INTERAC.MOLEC.PLANTA PATOGENO

      First period
      Master Level

      FITOPATOLOGIA-TEO

      Second period
      Bachelor Level
    • BIOLOGIA CELULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level
  • 2012
    • INTERAC.MOLEC.PLANTA PATOGENO

      First period
      Master Level

      BIOLOGIA CELULAR-TEO

      First period
      Bachelor Level
    • BIOLOGIA CELULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

      GENOMICA Y BIOINFORMATICA

      Second period
      Bachelor Level
  • 2011
    • GENETICA MOLEC. EUCARIOTES-TEO

      Second period
      Bachelor Level

      BIOLOGIA CELULAR-TEO

      Second period
      Bachelor Level

Products

Leidy C, Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Gerson-Dirceu López, Carazzone C, Feussner I, Bernal A, Forero A, Suesca E. (2020)
Carotenoid Content and Composition in Exponential, Stationary and Biofilm States of Staphylococcus aureus and their Influence on Membrane Biophysical Properties
Biophysical Journal (ISSN 0006-3495)
Article
Rojas-Estevez P, Urbina D, Ayala D, Guayazan N, Mideros M, Bernal A, Cardenas M, Restrepo S. (2020)
Effector Repertoire of Phytophthora betacei: In Search of Possible Virulence Factors Responsible for Its Host Specificity
Frontiers in Genetics (ISSN 1664-8021)
Article
Rache L, Blondin L, Flores C, Trujillo C, Szurek B, Restrepo S, Koebnik R, Bernal A, Verniere C. (2019)
An Optimized Microsatellite Scheme for Assessing Populations of Xanthomonas phaseoli pv. Manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Gomez F, Soto J, Restrepo S, Bernal A, Lopez L, Lopez C. (2019)
Gene co-expression network for Xanthomonas-challenged cassava reveals key regulatory elements of immunity processes
European Journal of Plant Pathology (ISSN 0929-1873)
Article
Diaz-Tatis P, Ochoa J. C., Garcia L. M., Chavarriaga P, Bernal A, Lopez C. (2019)
Interfamily transfer of Bs2 from pepper to cassava (Manihot esculenta Crantz)
Tropical Plant Pathology (ISSN 1983-2052)
Article
Bernal A, Cardenas M, Snoeijenbos M, Guevara M, Gutierrez C .Phytobiomes, The Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together. (2019).
Phytobiomes, The Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together
Thesis
Snoeijenbos M, Cardenas M, Guevara M, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2019)
Phytobiomes, the Reason Why Microbiologists and Botanists Should Work Together
Annual Plant Reviews online (ISSN 2639-3832)
Article
Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Feussner I, Bernal A, Forero A, Leidy C. (2019)
Variations in carotenoid content and acyl chain composition in exponential, stationary and biofilm states of Staphylococcus aureus, and their influence on membrane biophysical properties
Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes (ISSN 0005-2736)
Article
Villarreal S .Análisis de la distribución, contexto genómico y evolución del efector XopE4 en diferentes cepas de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. (2018).
Análisis de la distribución, contexto genómico y evolución del efector XopE4 en diferentes cepas de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Bernal V, Ochoa J. C., Trujillo C, Rache L, Bernal A, Lopez C. (2018)
Development of a multiplex nested PCR method for detection of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Cassava
Tropical Plant Pathology (ISSN 1983-2052)
Article
Villarreal S .Evaluación del efector XopE4 de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis como supresor de la respuesta hipersensible mediada por distintos elicitores. (2018).
Evaluación del efector XopE4 de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis como supresor de la respuesta hipersensible mediada por distintos elicitores
Thesis
Kante M, Blondin L, Flores C, Rache L, Wonni I, Dagno K, Restrepo S, Bernal A, Koebnik R, Verdier V, Koita O, Verniere C, Szurek B. (2018)
MLVA-based diversity analysis of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) populations in Mali
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Leidy C, Perez M, Mendez R, Trier S, Herrfurth C, Feussner I, Bernal A, Forero A.
Modulation of lipid composition during biofilm formation, and its influence on the membrane biophysical properties of Staphylococcus aureus
Event
Botero D, Alvarado C, Bernal A, Danies G, Restrepo S. (2018)
Network Analyses in Plant Pathogens
Frontiers in Microbiology (ISSN 1664-302X)
Article
Mideros M, Turissini D, Guayazan N, Ibarra H, Danies G, Cardenas M, Myers K, Tabima J, Goss E, Bernal A, Lagos L, Grajales A, Gonzalez L, Cooke D. E. L., Fry W. E., Grunwald N. J., Matute D, Restrepo S. (2018)
Phytophthora betacei, a new species within Phytophthora clade 1c causing late blight on Solanum betaceum in Colombia.
Persoonia (ISSN 0031-5850)
Article
Zarate C, Rache L, Verniere C, Gagnevin L, Bernal A, Szurek B. (2018)
TALE neighborhood: A genomic approach to picture worldwide TALome diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis
Other Publication
Medina C, Reyes P, Trujillo C, Gonzalez J, Bejarano D, Montenegro N, Jacobs J, Joe A, Restrepo S, Alfano J, Bernal A. (2018)
The role of type III effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in virulence and suppression of plant immunity
Molecular Plant Pathology (ISSN 1464-6722)
Article
Rache L, Bernal A, Restrepo S. (2017)
Cellulase and xylanase activities of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) strains collected from different regions of Colombia
J Biotechnol Biomater (ISSN 2155-952X)
Article
Rache L, Bernal A, Restrepo S.
Cellulase and xylanase activities of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) strains collected from different regions of Colombia
Event
Gonzalez J .Functional characterization of the suppression of plant immunity mediated by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis type III effector XopAO1. (2017).
Functional characterization of the suppression of plant immunity mediated by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis type III effector XopAO1
Thesis
Gomez D .A Small Heat Shock Protein Important in Plant Defense is Targeted by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis HpaF Effector. (2016).
A Small Heat Shock Protein Important in Plant Defense is Targeted by the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis HpaF Effector
Thesis
Rache L, Flores C, Lopez C, Szurek B, Verniere C, Koebnik R, Restrepo S, Bernal A. (2016)
A strategy to study population variation of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using a new set of multiple-locus variable number tandem repeats
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Medina C .Elucidation of role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. (2016).
Elucidation of role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Berdugo J .Genetic Diversity and Association Mapping in Colombian Central Collection of potato (Solanum tuberosum L.) Group Andigenum using SNPs markers. (2016).
Genetic Diversity and Association Mapping in Colombian Central Collection of potato (Solanum tuberosum L.) Group Andigenum using SNPs markers
Thesis
Soto J, Ortiz J. F., Perlaza L, Vasquez A, Becerra L, Mathew B, Leon J, Bernal A, Ballvora A, Lopez C. (2015)
A genetic map of cassava (Manihot esculenta Crantz) with integrated physical mapping of immunity-related genes
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Article
Santiago M, Susana C, Mariana R, Alejandro A, Bernal A, Gonzalez A. (2015)
APPLICATIONS OF MOLECULAR DOCKING AND MOLECULAR DYNAMICS ON THE INHIBITION OF QUORUM SENSING SYSTEMS
ADVANCES IN MATHEMATICAL CHEMISTRY AND APPLICATIONS (ISBN 978-1-68108-052-9)
Inbook
Rache L, Koebnik R, Bernal A.
Analysis of the Population Diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) in Different Regions of Colombia Using VNTRS
Event
Muñoz A, Cruz L, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2015)
COMPARING INOCULATION METHODS TO EVALUATE THE GROWTH OF Xanthomonas axonopodis pv. manihotis ON CASSAVA PLANTS
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Article
Florez C, Rache L, Lopez C, Koebnik R, Verdier V, Bernal A, Szurek B.
Characterization of Cassava Bacterial Blight in Venezuela: Diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis ( Xam ) and its Talome
Event
Zarate C .Diversity of TALE content in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strains is a valuable tool to improve target gene searching methodologies. (2015).
Diversity of TALE content in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strains is a valuable tool to improve target gene searching methodologies
Thesis
Gonzalez J .Importancia de la triada catalítica del efector XopAO1 en la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. (2015).
Importancia de la triada catalítica del efector XopAO1 en la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Gomez F .Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz. (2015).
Metabolic Network Reconstruction of Manihot esculenta Crantz
Thesis
Botero D, Gomez F, Alvarez M, Alvarez A, Alvarado C, Zarate C, Gonzalez A, Restrepo S, Bernal A.
Molecular Pathogenicity Networks in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Event
Botero D, Gomez F, Alvarez M, Alvarez A, Gonzalez A, Restrepo S, Bernal A.
Molecular Pathogenicity Networks in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (5th Xanthomonas Genomics Conference)
Event
Danies G, Antolinez A, Cantillo J, Peña G, Vargas A, Cardenas M, Bernal A, Fry W. E., Restrepo S. (2015)
Physalis peruviana responses to Phytophthora infestans are typical of an incompatible interaction
CANADIAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY (ISSN 0706-0661)
Article
Gomez F, Alvarez M, Alvarado C, Zarate C, Jimenez E, Pardo C, Botero D, Gonzalez A, Bernal A.
Reconstruction of Genome-Scale Metabolic Networks of Species of the Genus Xanthomonas with Different Pathogenic Behavior
Event
Karr J, Williams A, Zucker J, Raue A, Steiert B, Timmer J, Kreutz C, Wilkinson S, Allgood B, Bot B, Hoff B, Kellen M, Covert M, Stolovitzky G, Meyer P, Hu Y, Baron M, Bryson K, Barker B, Bogart E, Wang Y, Chandramohan D, Huang L, Zawack K, Shestov A, Makadia H, Decicco D, Yin A, Wang M, Li S, Swistak M, Cygan M, Kazakiewicz D, Kursa M, Korytkowski P, Plewczynski D, Yang J, Li Y, Tang H, Wang T, Liu Y, Xie Y, Xiao G, Bello J, Botero D, Cañas S, Castro J, Gomez F, Valdes I, Gonzalez L, Bernal A, Pedraza J, Restrepo S, Reyes A. (2015)
Summary of the DREAM8 Parameter Estimation Challenge: Toward Parameter Identification for Whole-Cell Models
PLoS Computational Biology (ISSN 1553-734X)
Article
Trujillo C, Ochoa J. C., Mideros M, Restrepo S, López C. E., Bernal A. (2014)
A Complex Population Structure of the Cassava Pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Recent Years in the Caribbean Region of Colombia
MICROBIAL ECOLOGY (ISSN 0095-3628)
Article
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S.
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Event
Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Lozano G, Vasquez J. J., Myers K, Fry W. E., Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S. (2014)
De novo pyrimidine biosynthesis in the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans
Gene (ISSN 0378-1119)
Article
Tenjo F. J., Bello J, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Garavito M.F, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S.
Evaluation of a Possible Metabolic Regulation in Pyrimidine Biosynthesis in Phytophthora infestans and Solanum tuberosum: the case of Aspartate Transcarbamoylase and Uridine Monophosphate Synthase
Event
Bernal V .Genome-wide identification of small non-coding RNAs related with quorum sensing and virulence in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. (2014).
Genome-wide identification of small non-coding RNAs related with quorum sensing and virulence in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Rodriguez A .Identification of HrpG and RpfCGH-regulated genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. (2014).
Identification of HrpG and RpfCGH-regulated genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Thesis
Bernal A. (2014)
Maestría en Biología Computacional: una apuesta de Uniandes al futuro de la ciencia en el país
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Article
Trujillo C, Arias N, Poulin L, Medina C, Tapiero A, Restrepo S, Koebnik R, Bernal A. (2014)
Population typing of the causal agent of cassava bacterial blight in the Eastern Plains of Colombia using two types of molecular markers
BMC Microbiology (ISSN 1471-2180)
Article
Garavito M.F, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.
Pyrimidine salvage pathways: Uracil Phosphoribosyltransferases of Phytophthora infestans and Solanum tuberosum
Event
Muñoz A, Perez A. L., Gomez F, Gil J, Michelmore R, Bernal A, Szurek B, Lopez C. (2014)
RNAseq analysis of cassava reveals similar plant responses upon infection with pathogenic and non-pathogenic strains of Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis
PLANT CELL REPORTS (ISSN 0721-7714)
Article
Perez M, Trier S, Bernal A, Vargas-zambrano J, Herrfurth C, Feussner I, Gonzalez J, Leidy C. (2014)
S. Aureus Adapt to Growth Conditions by Changing Membrane Order
Biophysical Journal (ISSN 0006-3495)
Article
Botero D, Restrepo S, Bernal A, Gonzalez A.
THE Xanthomonas axonopodis pv. manihotis PATHOGENESIS UNCOVER BY METABOLIC NETWORKS
Event
Diaz P, Bernal A, Lopez C. (2014)
Transient GUS gene expression in cassava (Manihot esculenta Crantz) using Agrobacterium tumefaciens leaf infiltration
Revista MVZ Cordoba (ISSN 0122-0268)
Article
Bello J, Tenjo F. J., Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S, Garavito M.F.
Cloning and expression of the pyrimidine enzymes aspartate transcarbamoylase and uridine synthase of an oomycete plant pathogen
Event
Perlaza L .Deconstructive Evolutionary Pipeline (DeEP) Implemented to Find Genes Responsible for Pathogenic Behavior in Xanthomonas Genus. (2013).
Deconstructive Evolutionary Pipeline (DeEP) Implemented to Find Genes Responsible for Pathogenic Behavior in Xanthomonas Genus
Thesis
del Castillo Munera J., Cardenas M, Pinzon A, Castañeda A, Bernal A, Restrepo S. (2013)
Developing a taxonomic identification system of Phytophthora species based on microsatellites Artículo completo 2013
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Article
Medina C, Bernal A. (2013)
El uso de nuevas tecnologías de la genómica para defender nuestros cultivos
Hipótesis: Apuntes Científicos Uniandinos (ISSN 1692-729X)
Article
Ramirez J .Evaluación de la redundancia en el papel de algunos efectores de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en la virulencia frente a yuca y en respuesta no hospedero. (2013).
Evaluación de la redundancia en el papel de algunos efectores de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en la virulencia frente a yuca y en respuesta no hospedero
Thesis
Trujillo C .Genetic structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis populations in two cassava producer regions in Colombia and characterization of an effector protein. (2013).
Genetic structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis populations in two cassava producer regions in Colombia and characterization of an effector protein
Thesis
Arrieta M, Rodriguez L. M., Perez A. L., Poulin L, Diaz A, Arias N, Trujillo C, Restrepo M, Bart R, Boch J, Boureau T, Darrasse A, Perrine D, Dugé de Bernonville T, Fontanilla P, Gagnevin L, Guérin F, Jacques M, Lauber E, Lefeuvre P, Medina C, Edgar M. Medina, Montenegro N, Muñoz A, Noël L. D., Ortiz J. F., Osorio D, Pardo C, Patil P. B., Poussier S, Pruvost O, Robène Soustrade I, Ryan R, Tabima J, Urrego O, Vernière C, Carrere S, Verdier V, Szurek B, Restrepo S, López C. E., Koebnik R, Bernal A. (2013)
Genomic Survey of Pathogenicity Determinants and VNTR Markers in the Cassava Bacterial Pathogen Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis Strain CIO151
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Article
Romero J .Las propiedades térmicas y mecánicas de las membranas bacterianas influencian la actividad de los agentes antimicrobiales que atacan la membrana. (2013).
Las propiedades térmicas y mecánicas de las membranas bacterianas influencian la actividad de los agentes antimicrobiales que atacan la membrana
Thesis
Ospina M .Microorganismos endófitos causantes del deterioro post cosecha primario en yuca (Manihot esculenta Crantz), una teoría olvidada.. (2013).
Microorganismos endófitos causantes del deterioro post cosecha primario en yuca (Manihot esculenta Crantz), una teoría olvidada.
Thesis
Cespedes M, Cardenas M, Vargas A, Rojas A, Morales J. B. , Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2013)
Physiological and molecular characterization of Phytophthora infestans isolates from the Central Colombian Andean Region
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Article
Botero D, Restrepo S, Bernal A.
Reconstrucción Metabólica de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Event
Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2013)
Seborrheic dermatitis: predisposing factors and ITS2 secondary structure for Malassezia phylogenic analysis
Medical Mycology (ISSN 1369-3786)
Article
Castiblanco L, Gil J, Rojas A, Osorio D, Gutiérrez S, Muñoz A, Perez A. L., Koebnik R, Szurek B, López C, Restrepo S, Verdier V, Bernal A. (2013)
TALE1 from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis acts as a transcriptional activator in plant cells and is important for pathogenicity in cassava plants
Molecular Plant Pathology (ISSN 1464-6722)
Article
Muñoz A, Bernal A, Szurek B, López C. E.. (2013)
Tell Me a Tale of TALEs
Applied Biochemistry and Biotechnology - Part B Molecular Biotechnology (ISSN 1073-6085)
Article
Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Caracterización de aislamientos de Malassezia spp. a partir de individuos con dermatitis seborreica
VIII Encuentro Nacional de Investigación en Enfermedades Infecciosas
Inproceeding
Verdier V, Lopez C, Bernal A. (2012)
Cassava Bacterial Blight, Caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Cassava In The Third Millennium. Modern Production, Processing, Use And Marketing Systems (ISBN 978-958-694-112-9)
Inbook
López C. E., Bernal A. (2012)
Cassava Bacterial Blight: Using Genomics for the Elucidation and Management of an Old Problem
Tropical Plant Biology (ISSN 1935-9756)
Article
Cabezas L, Calderon L, Medina L. M., Bahamon I, Cardenas M, Bernal A, Gonzalez A, Restrepo S. (2012)
Characterization of cellulases of fungal endophytes isolated from Espeletia spp.
Journal of Microbiology (ISSN 1225-8873)
Article
Bello J, Tenjo F. J., Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Restrepo S, Zimmermann B.
Cloning and Expression of the pyrimidine enzymes uridine monophosphate synthetase (UMP) and aspartate carbamoyltransferase (ATC) of an Oomycete
Event
Trujillo C, Medina C, Restrepo S, López C. E., Bernal A.
Comparison of diversity and population structure of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis between two cassava growing regions in Colombia
Event
Cardenas M, Tabima J, Fry W. E., Grunwald N. J., Bernal A, Restrepo S. (2012)
Defining species boundaries in the genus Phytophthora: the case of Phytophthora andina A response to Phytophthora andina sp nov., a newly identified heterothallic pathogen of solanaceous hosts in the Andean highlands' (Oliva et al., 2010)
Plant Pathology (ISSN 0032-0862)
Article
Osorio D, Rodriguez L. M., Perez A. L., Trujillo C, Lopez C, Koebnik R, Szurek B, Restrepo S, Bernal A.
Determination of the genetic and functional diversity of TAL effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Event
Bernal A. (2012)
Determination of the virulence activity of the type three effectors avrBs2, hpaF and xopZ from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Cassava
Inproceeding
Guevara M, Sopo L, Motta A, Tabima J, M. C. Cepero de García, García A, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Especies de Fusarium asociadas con onicomicosis en Colombia
VIII Encuentro Nacional de Investigación en Enfermedades Infecciosas
Inproceeding
Bernal A. (2012)
Expressing diverse versions of disease resistance proteins for protection against cassava bacterial blight
Inproceeding
Amado Y, Patiño A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Fusarium species associated with onychomycoses in Colombia.
18th Congress of the International Society for Human and Animal Mycology
Inproceeding
Rodriguez L. M., Grajales A, Arrieta M, Salazar J. C., Restrepo S, Bernal A. (2012)
Genomes-based phylogeny of the genus Xanthomonas
BMC Microbiology (ISSN 1471-2180)
Article
Bart R, Cohna M, Kassena A, Bernal A, et al. (2012)
High-throughput genomic sequencing of cassava bacterial blight strains identifies conserved effectors to target for durable resistance
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (ISSN 0027-8424)
Article
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S.
Metabolismo de pirimidinas en Phytophthora infestans: Búsqueda de estrategias comunes para el control de patógenos Oomycetes como Phytophthora infestans basados en los blancos para el control de parásitos apicomplexa.
Event
Mideros M, Bastidas J, Castillo Y. V., Lagos L, Bernal A, Restrepo S. (2012)
Pathogenicity and aggressiveness of isolates belonging to a new Phytophthora infestans sensu lato population in Colombia
Annual Meeting of the American Phytopathological Society
Inproceeding
Muñoz A, Guevara M, Amado Y, Bocanegra L, Sopo L, Motta A, M. C. Cepero de García, Tabima J, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2012)
Phylogenetic relationship of Malassezia species isolated from seborrheic dermatitis
18th Congress of the International Society for Human and Animal Mycology
Inproceeding
Cardenas M, Danies G, Tabima J, Bernal A, Restrepo S. (2012)
Phytophthora infestans population structure: A worldwide scale
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Article
Hurtado V, Trujillo C, Ocampo J, Restrepo S, Bernal A. (2012)
Plausible role of the interactions between the effector HpaF of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis and Manihot esculenta proteins in the plant defense system
Inproceeding
Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S.
Preliminary biochemical characterization of the pyrimidine salvage pathway enzyme uracil phosphoribosyltransferase in the plant pathogen Phytophthora infestans and its host Solanum tuberosum
Event
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Bello J, Tenjo F. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.
Pyrimidine metabolism in Phytophthora infestans: new control strategies based on targets used to control apicomplexan parasites
Event
Bernal A.
Role of type three effectors from Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in the virulence towards cassava.
Event
Bernal A. (2012)
Structure and Diversity of colombian populations of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis, the causal agent of cassava bacterial blight. Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Inproceeding
Tabima J, Mideros M, Bernal A, Jiménez P, Riaño D, Grunwald N. J., Restrepo S. (2012)
The dynamics of evolution in Phytopththora infestans as told by phylogeographical approaches.
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Vargas N, Bernal A, Sarria V, Franco A, Restrepo S. (2011)
Amatoxin and phallotoxin composition in species of the genus Amanita in Colombia: A taxonomic perspective
Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology (ISSN 0041-0101)
Article
Gonzalez A, Borrero A, Bernal A. (2011)
Applications of Molecular Docking and Molecular Dynamics on the Inhibition of Quorum Sensing Systems: The Case of Indol and 3-OH PAME
Other Publication
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Zimmermann B, Restrepo S.
Biochemical characterization of recombinant Dihydroorotate dehydrogenase from the plant pathogenic Oomycete Phytophthora infestans
Event
Reyes P, Restrepo S, Bernal A. (2011)
Cassava's immunity suppression mediated by Type III effectors of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garavito M.F, Hortua M, Garcia-Bayona L, Vasquez J. J., Lozano G, Bernal A, Loffler M, Restrepo S, Zimmermann B.
Common strategies for controlling human Apicomplexan parasites and agricultural Oomycete pathogens such as Phytophthora infestans
Event
Trujillo C, Restrepo S, López C. E., Bernal A. (2011)
Diversity and population dynamics of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Colombia from 2008 to 2010
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Cardenas M, Medina E, Tabima J, Bernal A, Restrepo S, C. A. Lopera. (2011)
First Report of Phytophthora infestans Causing Late Blight on Solanum viarum in Colombia
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Article
Garcia-Bayona L, Grajales A, Cardenas M, Sierra R, M. C. Cepero de García, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
First report of Fusarium oxysporum causin potato dry rot in solanum tuberosum in colombia
New Disease Reports (ISSN 2044-0588)
Article
Cardenas M, Tabima J, Vargas A, C. A. Lopera, Bernal A, Restrepo S. (2011)
First report of Phytophthora infestans causing Late blight in the wild Solanaceae, Solanum viarum, in Colombia
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Article
Cardenas M, Grajales A, Sierra R, Rojas A, González A, Vargas A, Marín M, Fermín, Lagos, Grunwald N. J., Bernal A, Salazar C, Restrepo S. (2011)
Genetic diversity of Phytophthora infestans in the Northern Andean region
BMC Genetics (ISSN 1471-2156)
Article
Mideros Y, Castillo Y, Obando C, Cardenas M, Lagos L, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
Genetic structure and patogenicity of Phytophthora infestans sensu lato collected from Solanum betaceum in southwestern Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garcia-Bayona L, Grajales A, Cardenas M, Sierra R, Lozano G, Garavito M.F, M. C. Cepero de García, Bernal A, Jiménez P, Restrepo S. (2011)
Isolation and characterization of two strains of Fusarium oxysporum causing potato dry rot in Solanum tuberosum in Colombia.
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Article
Gil J, Bohórquez L, Bernal A, López C. E., Castiblanco L. (2011)
LA PROTEÍNA PTHB DE Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis ES AUTOACTIVA EN ENSAYOS DE DOBLE HÍBRIDO
Acta Biologica Colombiana (ISSN 0120-548X)
Article
Olarte X, Fermín, Tabima J, Rojas Y, Tennant P, Fuchs M, Sierra R, Bernal A, Restrepo S. (2011)
Phylogeography and molecular epidemiology of Papaya ringspot virus
Virus Research (ISSN 0168-1702)
Article
Restrepo M, Restrepo S, Bernal A. (2011)
RpfG interaction in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Pinzon A, Rodriguez L. M., Gonzalez A, Bernal A, Restrepo S, Gonzalez A. (2011)
Targeted metabolic reconstruction: a novel approach for the characterization of plant-pathogen interactions
Briefings in Bioinformatics (ISSN 1467-5463)
Article
Cai R, Lewis J, Yan S, Liu H, Clarke C, Campanile F, Almeida N, Studholme D, Lindeberg M, Schneider D, Zaccardelli M, Setubal J, Morales N, Bernal A, Coaker G, Baker C, Bender C, Leman S, Vinatzer B. (2011)
The Plant Pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato Is Genetically Monomorphic and under Strong Selection to Evade Tomato Immunity
PLoS Pathogens (ISSN 1553-7366)
Article
Vasquez J. J., Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S.
Uracil Phosphoribosyltransferase inhibition as a complementary target for Phytophthora infestans control
Event
Patiño A, Amado Y, M. C. Cepero de García, Chaves D, Tabima J, Motta A, Cardenas M, Bernal A, Restrepo S, Celis A. (2011)
Virulence Gene Expression in Malassezia spp from Individuals with Seborrheic Dermatitis
Journal of Investigative Dermatology (ISSN 0022-202X)
Article
Arrieta M, Rodriguez L. M., Restrepo S, Koebnik R, Bernal A. (2010)
A bioinformatic study of pathogenicity factors in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Gorrón E, Rodríguez F, Bernal D, Rodriguez L. M., Bernal A, Restrepo S, Tohme J. (2010)
A new method for designing degenerate primers and its use in the identification of sequences in Brachiaria showing similarity to apomixis-associated genes
Bioinformatics (ISSN 1367-4803)
Article
Bernal A, Restrepo S. (2010)
Bacterial Phylogenomics Revisited: A Case study for the Xanthomonas genus
Inproceeding
Antolinez A, Danies G, Peña A, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Biochemical and microscopical study of Phytophthora infestans process of infection on Physalis peruviana
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Del J, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Developing a taxonomic identification system based on microsatellites of Phytophthora species
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S.
Dihydroorotate dehydrogenase from the phytopathogenic Oomycete Phytophthora infestans as a novel target for crop control.
Event
Sierra R, Rodriguez L. M., Chaves D, Pinzon A, Grajales A, Rojas A, Mutis G, Cardenas M, Burbano D, Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Discovery of Phytophthora infestans Genes Expressed in Planta through Mining of cDNA Libraries
PLoS ONE (ISSN 1932-6203)
Article
Garavito M.F, Garcia-Bayona L, Lozano G, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S. (2010)
Expression and homology modeling of Dihydroorotate dehydrogenase from the phytopathogenic Oomycete Phytophthora infestans
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Montenegro N, Alvarez A, Restrepo S, Bernal A. (2010)
Identification and characterization of genes involved in the type VI secretion system in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Cespedes L, Cardenas M, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Molecular and morphological characterization of a Phytophthora infestans population in the Colombian Andean region
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Trujillo C, Restrepo S, López C. E., Esquivel J, Bernal A. (2010)
Molecular diversity and population dynamics of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in the Caribbean region of Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garcia-Bayona L, Garavito M.F, Bernal A, Zimmermann B, Restrepo S.
Orotate phosphoribosyl transferase and orotidine-5-monophosphate decarboxylase as targets for control of Phytophthora infestans.
Event
Danies G, Vargas A, Antolinez A, Peña A, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Physalis peruviana natural reservoir for Phytophthora infestans in the field
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Cardenas M, Cespedes L, Bernal A, Restrepo S. (2010)
Phytophthora infestans oospores: Production and viability in Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Quesada L, Cespedes L, Carreño N, González A, Rojas A, Vargas A, Zuluaga A, Myers K, Fry W. E., Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2009)
Characterization of Phytophthora infestans Populations in Colombia: First Report of the A2 Mating Type
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Bernal A. (2009)
Characterization of effector proteins in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Inproceeding
Buitrago F, Sierra R, Grajales A, Jiménez P, Bernal A, Restrepo S, Rodriguez L. M.. (2009)
Comparative study of Chalcone synthase promoters across plant families
Revista Colombiana de Biotecnología (ISSN 0123-3475)
Article
Restrepo S, Pinzon A, Rodriguez L. M., Sierra R, Grajales A, Bernal A, Barreto E, Moreno P, Zambrano M, Cristancho M, Gonzalez A, Castro H. (2009)
Computational Biology in Colombia
PLoS Computational Biology (ISSN 1553-734X)
Article
Pinzon A, Barreto E, Bernal A, Achenie L, Gonzalez A, Isea R, Restrepo S. (2009)
Computational models in plant-pathogen interactions: the case of Phytophthora infestans
Theoretical Biology and Medical Modelling (ISSN 1742-4682)
Article
Buitrago F, Sierra R, Grajales A, Rodriguez L, Jiménez P, Bernal A, Restrepo S. (2009)
Estudio comparativo de promotores de la Chalcón Sintasa en diferentes familias de plantas
Revista Colombiana de Biotecnología (ISSN 0123-3475)
Article
Bernal A, Restrepo S. (2009)
Identification of pathogenic effectors in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using a genetic screen.
XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions
Inproceeding
Garcia-Bayona L, Grajales A, Sierra R, Cardenas M, Avila L, M. C. Cepero de García, Restrepo S, Bernal A. (2009)
Isolation and characterization of Fusarium oxysporum causing potato dry rot in Solanum tuberosum in Colombia - año 2009
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Trujillo C, Jarma A, López C. E., Restrepo S, Bernal A. (2009)
Molecular diversity of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in three different agroecological regions in the Caribbean region of Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Prada H, Avila L, Sierra R, Bernal A, Restrepo S. (2009)
Morphological and molecular characterization of the antagonistic interaction between the endophyte Diaporthe sp isolated from frailejon (Espeletia sp.) and the plant pathogen Phytophthora infestans
Revista Iberoamericana de Micologia (ISSN 1130-1406)
Article
Ryan R, Koebnik R, Szurek B, Boureau T, Bernal A, Bogdanove A, Dow J. (2009)
Passing GO (gene ontology) in plant pathogen biology: a report from the Xanthomonas Genomics Conference
Cellular Microbiology (ISSN 1462-5814)
Article
Sierra R, Cardenas M, Grajales A, Rodriguez L. M., Bernal A, Restrepo S. (2009)
Using bioinformatics in the characterization of novel putative virulence determinants of Phytophthora infestans expressed in planta
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Alvarez A, Gonzalez A, Bernal A. (2009)
Virtual Screening of Quenchers for the Signal 3-Hydroxypalmitic Acid Methyl Ester in Ralstonia Solanacearum
2009 AIChE Annual Meeting: Nashville, TN
Inproceeding
Bernal A, Yoo C, Mutwil M, Jensen J, Hou G, Blaukopf C, Sorensen I, Blancaflor E, Scheller H, Willats W. (2008)
Functional Analysis of the Cellulose Synthase-Like Genes CSLD1, CSLD2, and CSLD4 in Tip-Growing Arabidopsis Cells
Plant Physiology (ISSN 0032-0889)
Article
Sierra R, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2008)
Gene expression profiling of the infection of yellow potato (Solanum phureja) by Phytophthora infestans
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Jensen J, Sorensen S, Harholt J, Geshi N, Sakuragi Y, Moller I, Zandleven J, Bernal A, Jensen N, Pauly M, Beldman G, Willats W, Scheller H. (2008)
Identification of a xylogalacturonan xylosyltransferase involved in pectin biosynthesis in Arabidopsis
Plant Cell (ISSN 1040-4651)
Article
Gutiérrez S, Rodriguez L. M., Pardo C, Pinzón D, Morales N, Restrepo S, Bernal A. (2008)
Identification of effector genes in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using bioinformatics and a forward genetics screen
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Castiblanco L, Trujillo C, Alfonso N, López C. E., Szurek B, Verdier V, Restrepo S, Bernal A. (2008)
Molecular characterization of virulence and pathogenicity determinants in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Rojas A, Sierra R, González A, Vargas A, Cardenas M, Fermín, Lagos L, Bernal A, Restrepo S, Salazar C. (2008)
Study of the genetic diversity of Phytophthora infestans isolates from the Northern Andean region using seven genic regions
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2007)
Appearance of the mating type A2 in a population of Phytophthora infestans from six species of the Solanaceae family in the Cundinamarca - Colombia
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Bernal A, Jensen J, Harholt J, Sorensen S, Moller I, Blaukopf C, Johansen B, De R, Pauly M, Scheller H, Willats W. (2007)
Disruption of AtCslD5 results in reduced growth, reduced Xylan and Homogalacturonan synthase activity and altered Xylan occurrence in Arabidopsis
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Article
Vargas A, Correa A, Lozano D, Bernal A, Restrepo S, Jiménez P, González A. (2007)
First report of late blight caused by Phytophthora infestans on Cape gooseberry (Physalis peruviana) in Colombia.
Plant Disease (ISSN 0191-2917)
Article
Moller I, Sorensen I, Bernal A, Blaukopf C, Lee S, Obro J, Pettolino F, Roberts A, Mikkelsen J, Knox J, Bacic A, Willats W. (2007)
High-throughput mapping of cell-wall polymers within and between plants using novel microarrays
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Article
Barriga C, Pinzon A, Szurek B, González A, Morales N, Restrepo S, Bernal A, Verdier V. (2007)
Identification of pathogenicity determinants in Xanthomonas axonopodis pv. manihotis using comparative genomic tools
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Carreño N, Vargas A, Bernal A, Restrepo S. (2007)
Problemas fitopatológicos en especies de la familia Solanaceae causados por los géneros Phytophthora, Alternaria y Ralstonia en Colombia
Agronomía Colombiana (ISSN 0120-9965)
Article
Tapiero A, Garnica D, Gordillo M, Bernal A, Restrepo S. (2006)
Molecular and pathogenic variability in colombian isolates of Phytophthora sojae
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Garnica D, Pinzon A, Quesada L, Bernal A, Restrepo S, Barreto E. (2006)
Molecular markers a la carte: Exploiting genomic databases for the generation of tools for understanding of Phytophthora spp. populations
Phytopathology (ISSN 0031-949X)
Article
Pinzon A, Garnica D, Quesada L, Bernal A, Barreto E, Grunwald N. J., Restrepo S. (2006)
Survey and analysis of microsatellites from transcript sequences in Phytophthora species: frequency, distribution, and potential as markers for the genus
BMC Genomics (ISSN 1471-2164)
Article
Bernal A, Pan Q, Pollack J, Rose L, Kozik A, Willits N, Luo Y, Guittet M, Kochetkova E, Michelmore R. (2005)
Functional analysis of the plant disease resistance gene Pto using DNA shuffling
Journal of Biological Chemistry (ISSN 0021-9258)
Article
Manfield I, Bernal A, Moller I, Mccartney L, Riess N, Knox J, Willats W. (2005)
Re-engineering of the PAM1 phage display monoclonal antibody to produce a soluble, versatile anti-homogalacturonan scFv
PLANT SCIENCE (ISSN 0168-9452)
Article
Manfield I, Orfila C, Mccartney L, Harholt J, Bernal A, Scheller H, Gilmartin P, Mikkelsen J, Knox J, Willats W. (2004)
Novel cell wall architecture of isoxaben-habituated Arabidopsis suspension-cultured cells: global transcript profiling and cellular analysis
Plant Journal (ISSN 0960-7412)
Article
Bernal A, Willats W. (2004)
Plant science in the age of phage
Trends in Plant Science (ISSN 1360-1385)
Article
Chang J, Tai Y, Bernal A, Lavelle D, Staskawicz B, Michelmore R. (2002)
Functional analyses of the Pto resistance gene family in tomato and the identification of a minor resistance determinant in a susceptible haplotype
Molecular Plant-Microbe Interactions (ISSN 0894-0282)
Article
Suarez M, Bernal A, Gutiérrez J, Tohme J, Fregene M. (2000)
Developing expressed sequence tags (ESTs) from polymorphic transcript-derived fragments (TDFs) in cassava (Manihot esculenta Crantz)
Genome / National Research Council Canada = Genome / Conseil national de recherches Canada (ISSN 0831-2796)
Article
Chang J, Rathjen J, Bernal A, Staskawicz B, Michelmore R. (2000)
avrPto enhances growth and necrosis caused by Pseudomonas syringae pv. tomato in Tomato lines lacking either Pto or Prf
Molecular Plant-Microbe Interactions (ISSN 0894-0282)
Article

Degrees

  • Doctor Of Philosophy In Plant Pathology

    Doctoral degree

    University Of California

    2003

    Estados Unidos

    Microbióloga

    Bachelor degree

    Universidad De Los Andes

    1994

    Colombia

Projects

  • 2020
    • Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en Colombia

      Duration: 18 months

      PR.6.2020.7087

      La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

      Estudios poblacionales, genómicos y moleculares de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis en el Caribe Colombiano

      Duration: 18 months

      PR.6.2020.7107

      La Yuca es una parte esencial de la dieta de quinientos millones de personas que viven en el trópico. Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) es el agente causal del añublo bacteriano de la yuca. Esta es una de las enfermedades más destructivas que afecta este cultivo en Colombia y el resto del mundo causando pérdidas entre 12 y 100% de los cultivos de Yuca. Como muchas otras enfermedades en plantas causadas por bacterias el añublo bacteriano de la yuca en difícil y costosa de controlar a través del uso de químicos. El método de control conocido más eficiente es el uso de variedades resistentes o tolerantes que han sido desarrolladas a través de varios años. El principal problema del uso de estas variedades es que estas resistencias se pueden romper rápidamente. Sin embargo, aunque esta enfermedad está bien estudiada a nivel citoquímico y bioquímico no está caracterizada a nivel molecular. Es por esto que el estudio de esta enfermedad a nivel molecular, puede llevar a la identificación de genes involucrados en el proceso de patogenicidad por parte de la bacteria y de la planta, lo que implicaría una información importante en el proceso de entendimiento de la enfermedad y posterior desarrollo de una forma de combatirla. Adicionalmente, Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

  • 2019
    • Construccion de consorcios microbianos lignoceluloliticos

      Duration: 36 months

      PR.6.2019.6828

      La producción de diferentes tipos de biocompuestos a partir de biomasa vegetal ha impactado la economía mundial en la última década. Específicamente, los residuos agrícolas han sido considerados como una excelente fuente de energía renovable para la generación de químicos orgánicos. Sin embargo, uno de los cuellos de botella en estos bioprocesos es la ineficiente sacarificación enzimática de los polisacáridos vegetales. Generalmente, esto se debe a la naturaleza compleja y recalcitrante de los polímeros que conforman la pared celular de las plantas (i.e. lignocelulosa). La degradación de biomasa vegetal es un proceso metabólico llevado a cabo principalmente por bacterias y hongos en la naturaleza. Sin embargo, aún existe poco entendimiento acerca de la eco-enzimología de este proceso dentro comunidades microbianas. Este proyecto se enfocará en la construcción y análisis de consorcios microbianos lignocelulolíticos derivados de suelo de bosque. El método de enriquecimiento estará acoplado a un método de selección (e.g. dilution-to-extinction) con el fin de obtener un consorcio mínimo eficiente. Durante la construcción de los consorcios, análisis (meta)ómicos y enzimáticos se realizarán con el fin de evaluar la diversidad, dinámicas y funcionalidad de las comunidades microbianas seleccionadas.

      Socio-cultural dynamics associated with the propagation of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) in cassava crops in the Colombian Caribbean

      Duration: 10 months

      PR.6.2019.6947

      La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo fundamental para la seguridad alimentaria de millones de personas en el mundo. En Colombia, la región Caribe contribuye a aproximadamente la mitad de la producción nacional, a pesar de los problemas socioeconómicos y políticos de la región como la propiedad de la tierra, las dinámicas de comercialización, el conflicto armado, el cambio climático y los problemas fitosanitarios. La más grande amenaza para lograr una producción estable es la bacteriosis vascular (en inglés, Cassava Bacterial Blight -CBB), que es una enfermedad causada por el patógeno Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) capaz de causar daños irreversibles a la planta, impidiendo su crecimiento y productividad. Considerando que la yuca es principalmente propagada por estacas que son intercambiadas entre los campesinos, en este estudio se pretende analizar el impacto de las dinámicas socioculturales asociadas con las prácticas de manejo en la dispersión de CBB en cultivos de yuca en el Caribe Colombiano, tomando como caso de estudio los municipios de la subregión de Sabanas en el departamento de Córdoba. Se tomarán datos acerca de la prevalencia de la enfermedad en campo, redes de intercambio de material propagativo, prácticas de manejo y efectos de la propiedad de la tierra en la dispersión de Xpm en los cultivos de yuca. Con este análisis se pretende aportar al conocimiento acerca de la epidemiología del patógeno y generar herramientas de diagnóstico para la enfermedad en la región.

  • 2016
    • Diversidad genética de las poblaciones y análisis de la actividad celulolítica de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis

      Duration: 42 months

      PR.6.2016.3767

      Una de las enfermedades que conlleva pérdidas en los cultivos de yuca es el añublo bacteriano causado por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Desde 1990 se han realizado diferentes estudios analizando la diversidad genética de las poblaciones de Xam y se reportó alta diversidad poblacional y cambio rápido en el tiempo. La alta diversidad de Xam ha conllevado a la pérdida de resistencia de las variedades de yuca cultivadas y a la necesidad de desarrollar nuevas estrategias para controlar la enfermedad. Además, los estudios muestran la importancia de analizar continuamente las dinámicas poblaciones. El objetivo de este estudio es utilizar análisis de repeticiones en tándem de número variable (VNTRs) para caracterizar poblaciones de Xam y analizar si se conserva alta diversidad de poblaciones en la localidad de Chinú-Colombia. Para desarrollar el estudio, las cepas de Xam colectadas en la localidad de Chinú durante el 2014 y las cepas más diversas encontradas en los estudios de los 90s y 2008 a 2010, serán analizadas utilizando primers para amplificar 4 loci minisatelites y 18 loci microsatélites. Los resultados del proyecto permitirán evaluar la técnica de VNTRs previamente estandarizada y analizar la diversidad de Xam en el tiempo en la localidad de Chinú. 

  • 2007
    • Identificación y análisis de genes de la virulencia en Xanthomonas campestris pv.manihotis.

      Duration: 36 months

      PR.3.2005.61.abernal